ERRATA Colle n°23 Gform - Recherche

[Le_Nain]

Salut à tous !!!

Vous pouvez débattre ici des potentiels errata de la colle concernant la partie Recherche ! 

 

La Tutobise à tous 

[DrR]

saluuut, merci pour cette super colle !!

 

j'ai pas bien compris le rôle de la B actine, comment elle joue le rôle de contrôle ?  (qcm 25)

 

pr le 27 D est ce qu'on peux dire que c'est faux aussi prc l'elisa c'est pr doser or ici on veux juste identifier ? et pr le E je comprends pas pq elle est fausse

 

exercice 30 :

A. Le cDNA de PAH muté digéré par PstI et SbfI sera correctement inséré dans le plasmide préalablement digéré par SbfI (v) : mais dans ce cas il s'insère dans les 2 sens or on veux que le vecteur s'exprime ducoup il sera pas forcément correctement inséré non ?

merci !!

 

 

[Metallica]

Coucou @DrR

 

il y a 24 minutes, DrR a dit :

j'ai pas bien compris le rôle de la B actine, comment elle joue le rôle de contrôle ?  (qcm 25

 

Yup c'est ça , tu en as un autre exemple sur un qcm de concours de purpan sur ce sujet : 

 

 

il y a 25 minutes, DrR a dit :

pr le 27 D est ce qu'on peux dire que c'est faux aussi prc l'elisa c'est pr doser or ici on veux juste identifier ? et pr le E je comprends pas pq elle est fausse

 

Ouaip

 

il y a 46 minutes, DrR a dit :

A. Le cDNA de PAH muté digéré par PstI et SbfI sera correctement inséré dans le plasmide préalablement digéré par SbfI (v) : mais dans ce cas il s'insère dans les 2 sens or on veux que le vecteur s'exprime ducoup il sera pas forcément correctement inséré non ?

 

C'est vrai tu as raison 

[DrR]

il y a 18 minutes, Metallica a dit :

Coucou @DrR

 

 

Yup c'est ça , tu en as un autre exemple sur un qcm de concours de purpan sur ce sujet : 

 

 

 

Ouaip

 

 

C'est vrai tu as raison 

mercii @Metallica toujours présente

[Camm]

Salut et merci pour cette colle !  

 

Je comprend pas cet item du QCM 25, comment la beta actine permet d'évaluer la quantité de protéines ? pour moi elle sevrait seulement de contrôle 

E. La B-Actine est une protéine de contrôle permettant d’évaluer la quantité de protéines dans chaque échantillon.

[Tchoupi]

Bonjour !

 

Tout d'abord merci pour la colle  (la dernière snif...)

 

Je ne suis pas sûre d'avoir compris le QCM 27... 

1. Est ce qu'on utilisait que des anticorps de souris qui reconnaissaient les cellules cancéreuses ? Ou on avait un mélange d'Ac qui reconnaissent d'autres éléments ?
2. Quand on dit "différencier" les anticorps de souris qui reconnaissent exclusivement les cellules cancéreuses, est ce que ça veut dire qu'on veut les révéler spécifiquement ?

 

Je sais pas si c'est très clair désolé 

[choLOLApine]

Saluut! 

Pour l'item 22E "De nos jours, un dépistage de la phénylcétonurie est fait de façon systématique par le test de Guthrie à la naissance." (vrai) mais depuis 2012 on fait les dépistages par LC-MS-MS et plus par le test de Guthrie non? 

[Wonder]

Bonjour ! Pour la 24B en immuno, peut-on vraiment affirmer cela ? imaginons c'est une épitoge cryptique il ne serait révélé qu'en conditions dénaturantes

[OxyGenS]

Bonjour et merci pour cette colle !

 

21C : "Injecter le gène G codant dans le pronucléus mâle, sous l’influence d’un promoteur spécifique des poumons."-->VRAI. Je l'ai mis faux pcq c'est pas dit "avant la fusion avec le pronucleus femelle". Du coup au CC ça change rien que ce soit précisé ou non ?

 

24D : "Le domaine extracellulaire en forme de boucle n’est pas reconnu par l’anticorps anti-AQ1."-->VRAI. Je comprends pas pq, qqun peut m'expliquer svp ?

 

25E : "La B-Actine est une protéine de contrôle permettant d’évaluer la quantité de protéines dans chaque échantillon"-->VRAI. Pareil, je comprends pas

[Metallica]

Il y a 4 heures, Camm a dit :

Je comprend pas cet item du QCM 25, comment la beta actine permet d'évaluer la quantité de protéines ? pour moi elle sevrait seulement de contrôle 

E. La B-Actine est une protéine de contrôle permettant d’évaluer la quantité de protéines dans chaque échantillon.

 

Justement ce contrôle consiste à montrer que la quantité qu'on peut disposer dans le puits est la même dans les deux colonnes. (pas de biais vis-à-vis de la quantité déposée avant électrophorèse)

[Camm]

il y a 24 minutes, Metallica a dit :

Justement ce contrôle consiste à montrer que la quantité qu'on peut disposer dans le puits est la même dans les deux colonnes. (pas de biais vis-à-vis de la quantité déposée avant électrophorèse)

d'accord je comprend ! merci @Metallica  

[Metallica]

Il y a 4 heures, Tchoupi a dit :

Est ce qu'on utilisait que des anticorps de souris qui reconnaissaient les cellules cancéreuses ? Ou on avait un mélange d'Ac qui reconnaissent d'autres éléments ?

 

A priori,ils reconnaissent tous une seule et même protéine qui se situe exclusivement au niveau des cellules cancéreuses ;))

 

Il y a 4 heures, Tchoupi a dit :

Quand on dit "différencier" les anticorps de souris qui reconnaissent exclusivement les cellules cancéreuses, est ce que ça veut dire qu'on veut les révéler spécifiquemen

 

Yep ça doit être ça, les distinguer sur une seule et même coupe

[Tchoupi]

Nickel merci beaucoup @Metallica 

[Théophylline]

Salut à tous !!

 

J'ai repris toutes vos questions, parfois vous aviez trouvé vous-mêmes les réponses 

 

QCM 21, item C :

Il y a 5 heures, OxyGenS a dit :

21C : "Injecter le gène G codant dans le pronucléus mâle, sous l’influence d’un promoteur spécifique des poumons."-->VRAI. Je l'ai mis faux pcq c'est pas dit "avant la fusion avec le pronucleus femelle". Du coup au CC ça change rien que ce soit précisé ou non ?

Si on parle de pronucléus mâle c'est parce la fusion n'a pas encore eu lieu, sinon on aurait un noyau. J'ai jamais vu de piège sur ça dans les annales. 

 

QCM 22, item E : 

Il y a 6 heures, lola_svry a dit :

Pour l'item 22E "De nos jours, un dépistage de la phénylcétonurie est fait de façon systématique par le test de Guthrie à la naissance." (vrai) mais depuis 2012 on fait les dépistages par LC-MS-MS et plus par le test de Guthrie non? 

Le prélèvement sanguin se fait toujours de la même façon, on pique le talon du nouveau-né et on dépose le sang sur papier buvard. C'est ce qu'on appelle le test de Guthrie. Les techniques d'analyse utilisées ensuite ont évolué au cours des années, mais le test initial est toujours le test de Guthrie. 

 

Extrait de la HAS : https://www.has-sante.fr/jcms/p_3149627/fr/depistage-neonatal-quelles-maladies-depister 

"A la naissance, une série de dépistages est proposée aux parents de chaque nouveau-né. Elle repose sur le prélèvement d’une goutte de sang sur le talon du nourrisson, laquelle est déposée sur un papier buvard. Ce prélèvement sanguin, appelé « test de Guthrie », est ensuite envoyé à un laboratoire spécialisé (à ce jour 13 centres en France) pour y rechercher la présence de 5 maladies : la phénylcétonurie, l’hyperplasie congénitale des surrénales, l’hypothyroïdie, la mucoviscidose et, pour les nouveau-nés présentant des facteurs de risque, la drépanocytose. Ces pathologies sont dépistées à partir du même prélèvement sanguin sur papier buvard, mais via différentes techniques d’analyse."

 

QCM 24, item B :

Il y a 5 heures, Wonder a dit :

Pour la 24B en immuno, peut-on vraiment affirmer cela ? imaginons c'est une épitoge cryptique il ne serait révélé qu'en conditions dénaturantes

On dit dans l'énoncé que l'AQP-M est exprimée que sous la forme de monomère. 

 

QCM 24, item D : 

Il y a 5 heures, OxyGenS a dit :

24D : "Le domaine extracellulaire en forme de boucle n’est pas reconnu par l’anticorps anti-AQ1."-->VRAI. Je comprends pas pq, qqun peut m'expliquer svp ?

On dit que l'AQP mutée ne possède pas ce domaine en boucle et l'anticorps anti-AQ1 reconnaît cette protéine donc ce n'est pas le domaine en boucle qu'il reconnait. 

 

QCM 25, item E : L'actine 

Contrôle ? 

Il y a 5 heures, OxyGenS a dit :

25E : "La B-Actine est une protéine de contrôle permettant d’évaluer la quantité de protéines dans chaque échantillon"-->VRAI. Pareil, je comprends pas

Il y a 8 heures, DrR a dit :

j'ai pas bien compris le rôle de la B actine, comment elle joue le rôle de contrôle ?  (qcm 25)

Il y a 7 heures, Metallica a dit :

Yup c'est ça , tu en as un autre exemple sur un qcm de concours de purpan sur ce sujet :

https://forum.tutoweb.org/topic/43391-recherche-purpan-2016/ 

 

 

Quantité ? 

Il y a 7 heures, Camm a dit :

Je comprend pas cet item du QCM 25, comment la beta actine permet d'évaluer la quantité de protéines ? pour moi elle sevrait seulement de contrôle

Il y a 2 heures, Metallica a dit :

Justement ce contrôle consiste à montrer que la quantité qu'on peut disposer dans le puits est la même dans les deux colonnes. (pas de biais vis-à-vis de la quantité déposée avant électrophorèse)

 

QCM 27, item D : 

Il y a 8 heures, DrR a dit :

27 D est ce qu'on peux dire que c'est faux aussi prc l'elisa c'est pr doser or ici on veux juste identifier ?

C'est surtout parce qu'on cherche à mettre en évidence des anticorps ayant reconnu une protéine sur une cryocoupe et l'ELISA ne sert pas du tout à ça. 

 

QCM 27, item E : 

Il y a 8 heures, DrR a dit :

pr le E je comprends pas pq elle est fausse

L'immunoprécipitation sert généralement à isoler des protéines comme il est dans la correction. De plus, on est sur une cryocoupe et on cherche à mettre en évidence des anticorps qui ont reconnu une certaine protéine donc l'immunoprécipitation ne devrait pas du tout rentrer en jeu.

 

QCM 27 (dans l'ensemble) : 

Il y a 6 heures, Tchoupi a dit :

Je ne suis pas sûre d'avoir compris le QCM 27... 

1. Est ce qu'on utilisait que des anticorps de souris qui reconnaissaient les cellules cancéreuses ? Ou on avait un mélange d'Ac qui reconnaissent d'autres éléments ?
2. Quand on dit "différencier" les anticorps de souris qui reconnaissent exclusivement les cellules cancéreuses, est ce que ça veut dire qu'on veut les révéler spécifiquement ?

On a deux souches de cellules saines et tumorales, on utilise des anticorps reconnaissant une protéine spécifique aux cellules tumorales pour faire de l'immunohistochimie dessus. On veut maintenant révéler, mettre en évidence, ces anticorps. La question du QCM est : quelles techniques pouvons-nous utiliser pour les mettre en évidence ?

Désolée si l'énoncé n'était pas très clair, mais voilà l'idée du QCM, on voulait vous faire revoir les techniques de révélation d'anticorps. 

 

QCM 29, item A : 

Il y a 8 heures, DrR a dit :

exercice 30 :

A. Le cDNA de PAH muté digéré par PstI et SbfI sera correctement inséré dans le plasmide préalablement digéré par SbfI (v) : mais dans ce cas il s'insère dans les 2 sens or on veux que le vecteur s'exprime ducoup il sera pas forcément correctement inséré non ?

Tu as raison, il y a une ambiguïté, ce n'est pas forcément vrai, mais ce n'est pas forcément faux non plus : après discussion avec mon co-RM ( @Ratus ) nous avons décidé d'annuler l'item.

 

 

 

Donc, en résumé :

• l'item 29 A sera annulé 

 

J'espère avoir répondu à vos questions, dites-moi si ce n'est pas clair ! 
 

[Metallica]

Il y a 5 heures, Wonder a dit :

Bonjour ! Pour la 24B en immuno, peut-on vraiment affirmer cela ? imaginons c'est une épitoge cryptique il ne serait révélé qu'en conditions dénaturantes

 

Effectivement l'assemblage des 4SU pourrait masquer l'épitope que reconnait l'Ac anti-AQP1 mais dans ce cas-là on ne devrait avoir  de bande à 120kDa pour l'Ac anti -AQP4 pour l'AQP normale;)

[ZygomatiqueHypertendu]

Salut à tous et merci pour cette dernière colle (snif)

 

Au sujet du qcm 29 B j'ai du mal à comprendre pourquoi elle serait justement dans un mauvais sens, ne faut -il pas aller justement dans le sens de la flèche pour la bonne transcription ? Le fait de mettre justement le 5' du Cdna dans le sens n'est pas suffisant ? 
Merci Bien pour vos réponses

Ah je me suis peut-être trompé sur la lecture des sites d'enzymes ! On considère que ApoI est proche du Lac R BInding site ? 

Edited May 7, 2020 by RomainNico81

[OxyGenS]

Merci pour ta réponse complète !

 

il y a 26 minutes, Théophylline a dit :

QCM 21, item C :

Il y a 5 heures, OxyGenS a dit :

21C : "Injecter le gène G codant dans le pronucléus mâle, sous l’influence d’un promoteur spécifique des poumons."-->VRAI. Je l'ai mis faux pcq c'est pas dit "avant la fusion avec le pronucleus femelle". Du coup au CC ça change rien que ce soit précisé ou non ?

Si on parle de pronucléus mâle c'est parce la fusion n'a pas encore eu lieu, sinon on aurait un noyau. J'ai jamais vu de piège sur ça dans les annales.

En fait j'ai fait cette remarque pcq on demande de créer une souris transgénique et je me suis dit si on met seulement le gène dans le pronucléus mâle ça fait pas une souris transgénique.  Et souvent ils font des pièges sur ça

[Fantôme]

Bonjour , pour l'item 23 E : " la recombinaison homologue est un C.O" , 

j'ai noté dans mon cours que c'était un double C.O , du coup j'ai mis faux , est ce que c'est une CO ou bien est-ce que on doit compter que c'est la même chose ?

 

 

Aussi , je crois pas avoir bien compris le qcm 25 , surtout la B , j'avais l'impression de pas tout comprendre parceque pour moi il manquait une des protéines sur  le WB, du coup je ne savais pas où était la AQP2 , quelqu'un peut m'expliquer ?

Merci ! 

Edited May 7, 2020 by R2019

[Metallica]

il y a 18 minutes, R2019 a dit :

Bonjour , pour l'item 23 E : " la recombinaison homologue est un C.O" , 

j'ai noté dans mon cours que c'était un double C.O , du coup j'ai mis faux , est ce que c'est une CO ou bien est-ce que on doit compter que c'est la même chose ?

 

Y aura pas de piège de ce type au cc, ici c'est juste histoire de dire qu'on utilise le phénomène de crossing-over pour arriver à nos fins

 

 

il y a 18 minutes, R2019 a dit :

Aussi , je crois pas avoir bien compris le qcm 25 , surtout la B , j'avais l'impression de pas tout comprendre parceque pour moi il manquait une des protéines sur  le WB, du coup je ne savais pas où était la AQP2 , quelqu'un peut m'expliquer ?

 

En fait dans le tableau 1, au niveau du tube collecteur, ils nous montrent qu'il n'y a pas d'expression d'AQ1 au niveau du tube collecteur. On doit certainement utiliser cette donnée pour raisonner avec la figure 2. Les 3 bandes de cette figure correspondent donc à AQP2,3 et 4  et on peut déterminer leur emplacement par rapport à leur PM respectifs (plus le PM est petit plus la prot migrera vers le bas puisque c'est dans ce sens que se fait la migration). Du coup, de haut en bas, on a AQP2 , AQP4,AQ3 et la B est donc vrai car on voit qu'après utilisation de la vasopressine, la bande du haut est plus épaisse, signe d'une expression plus importante de cette AQP au niveau du pole apical des cellules du tube collecteur

Edited May 7, 2020 by Metallica

[Fantôme]

Super , merci beaucoup @Metallica 

[Amonbofis]

@Théophylline salut, pour le 29E, il est dit une fois le vecteur correctement inséré il pourra être excisé par Pst1, ok ça marche si c'est Sbf1 et Pst1 utililisé pour l'insertion mais il y a bien d'autre manière dinsérer le cDNA correctement  d'après les cartes de restrictions, toute ne conduisent pas a l'apparition d'un site Pst1 non ?

 

[RQS04]

bonjour, merci pour cette colle !

 

au sujet du qcm 29, pour la B je ne comprends pas pourquoi elle est fausse, justement pour moi tout était dans le bon sens (celui inverse des aiguilles d'une montre), le promoteur -> site MCS (Xmal (ATG) -> Acc651 (STOP)) -> Lac -> Amp^R   en accord avec le sens des fleches sur le plamide. Et donc ces enzymes de restriction pouvaient permettre l'expression du gene PAH.

Peut-on déterminer le sens 5'-3' autrement que par le sens des fleches des genes déjà present dans le vecteur (Lac, Amp) ?

 

PS: pour le site MCS j'avais donc pris le sens 5'-3' de bas en haut pour suivre un trajet inverse au sens des aiguilles d'une montre.

 

au sujet du 29 E, je ne comprends pas pourquoi elle est vraie : lorsque l'on dit une fois le cDNA correctement inséré cela sous entend pour moi qu'il est dans le seul et bon sens (pour inserer le cDNA correctement il ne faudrait pas les memes extrémité pour ne permettre l'insertion que dans un seul sens et donc pas de possibilité de l'inserer comme dans la proposition A car se ferait dans les 2 sens ) on pourrait alors utiliser d'autre enzymes proposées dans l'exercice et donc on ne pourrait pas le rouvrir par PstI.                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              J'espere que ce que je dis est compréhensible

[Metallica]

Il y a 11 heures, RQS04 a dit :

au sujet du qcm 29, pour la B je ne comprends pas pourquoi elle est fausse, justement pour moi tout était dans le bon sens (celui inverse des aiguilles d'une montre), le promoteur -> site MCS (Xmal (ATG) -> Acc651 (STOP)) -> Lac -> Amp^R   en accord avec le sens des fleches sur le plamide. Et donc ces enzymes de restriction pouvaient permettre l'expression du gene PAH.

Peut-on déterminer le sens 5'-3' autrement que par le sens des fleches des genes déjà present dans le vecteur (Lac, Amp) ?

 

PS: pour le site MCS j'avais donc pris le sens 5'-3' de bas en haut pour suivre un trajet inverse au sens des aiguilles d'une montre.

 

Rien que la notion de 5'-3' c'est étrange vu que c'est un plasmide (pas d'orientation)

 

Il y a 11 heures, RQS04 a dit :

PS: pour le site MCS j'avais donc pris le sens 5'-3' de bas en haut pour suivre un trajet inverse au sens des aiguilles d'une montre

 

C'est aussi ce que j'ai fait mais l'énoncé le considère de haut en bas d'ou le fait que ça soit faux

 

Il y a 11 heures, RQS04 a dit :

au sujet du 29 E, je ne comprends pas pourquoi elle est vraie : lorsque l'on dit une fois le cDNA correctement inséré cela sous entend pour moi qu'il est dans le seul et bon sens (pour inserer le cDNA correctement il ne faudrait pas les memes extrémité pour ne permettre l'insertion que dans un seul sens et donc pas de possibilité de l'inserer comme dans la proposition A car se ferait dans les 2 sens ) on pourrait alors utiliser d'autre enzymes proposées dans l'exercice et donc on ne pourrait pas le rouvrir par PstI.

 

Je suis aussi d'accord

[Ratus]

Coucou tout le monde! Alors, pour les nouvels interrogations:

 

QCM 29 : Ce QCM Pose définitivement problème, la plupart des questions ne sont pas fausses, mais seulement ambiguës:

Le 07/05/2020 à 20:57, RomainNico81 a dit :

Au sujet du qcm 29 B j'ai du mal à comprendre pourquoi elle serait justement dans un mauvais sens, ne faut -il pas aller justement dans le sens de la flèche pour la bonne transcription ? Le fait de mettre justement le 5' du Cdna dans le sens n'est pas suffisant ? 
Merci Bien pour vos réponses

Ah je me suis peut-être trompé sur la lecture des sites d'enzymes ! On considère que ApoI est proche du Lac R BInding site ? 

En fait oui, le sens 5'-3' (et donc celui de la flèche) était de haut en bas, mais rien ne permettait explicitement  de s'en assurer, d'où l'interrogation parfaitement légitime. Donc l'item reste faux, mais ambiguë.

Le 08/05/2020 à 22:36, Amonbofis a dit :

@Théophylline salut, pour le 29E, il est dit une fois le vecteur correctement inséré il pourra être excisé par Pst1, ok ça marche si c'est Sbf1 et Pst1 utililisé pour l'insertion mais il y a bien d'autre manière dinsérer le cDNA correctement  d'après les cartes de restrictions, toute ne conduisent pas a l'apparition d'un site Pst1 non ?

Là pour le coup l'item reste vrai malgré l'erratum du A! En effet, de manière générale et y compris au concours, "inséré correctement" sous-entends parmis les techniques présentées précédemment. La solution du A est la seule adéquate parmi celles présentées, et même si, du fait de l'erratum, elle a une chance d'inséré faussement, elle peut aussi bien inséré et c'est l'hypothèse de base que l'on prend dans l'item! Et dans ce cas là, en effet on peut couper par PstI, l'item reste donc vrai!

 

QCM 23 :

Le 07/05/2020 à 23:16, R2019 a dit :

Bonjour , pour l'item 23 E : " la recombinaison homologue est un C.O" , 

j'ai noté dans mon cours que c'était un double C.O , du coup j'ai mis faux , est ce que c'est une CO ou bien est-ce que on doit compter que c'est la même chose ?

Comme dis plus tôt le prof ne piège pas là dessus. De plus, un double C.O reste un C.O, même si l'inverse n'est pas vrai.

 

QCM 24 :

Le 07/05/2020 à 23:16, R2019 a dit :

Aussi , je crois pas avoir bien compris le qcm 25 , surtout la B , j'avais l'impression de pas tout comprendre parceque pour moi il manquait une des protéines sur  le WB, du coup je ne savais pas où était la AQP2 , quelqu'un peut m'expliquer ?

@Metallica a tout dis :

Le 07/05/2020 à 23:34, Metallica a dit :

En fait dans le tableau 1, au niveau du tube collecteur, ils nous montrent qu'il n'y a pas d'expression d'AQ1 au niveau du tube collecteur. On doit certainement utiliser cette donnée pour raisonner avec la figure 2. Les 3 bandes de cette figure correspondent donc à AQP2,3 et 4  et on peut déterminer leur emplacement par rapport à leur PM respectifs (plus le PM est petit plus la prot migrera vers le bas puisque c'est dans ce sens que se fait la migration). Du coup, de haut en bas, on a AQP2 , AQP4,AQ3 et la B est donc vrai car on voit qu'après utilisation de la vasopressine, la bande du haut est plus épaisse, signe d'une expression plus importante de cette AQP au niveau du pole apical des cellules du tube collecteur

 

Les errata restent donc les mêmes, même si l'on peut compter le 29B comme annulé!

N'hésitez pas si vous avez encore des questions!

[Benj152]

Salut!

Pour le QCM 24

L'AQ1 muté n'a pas la boucle EC alors que l'AQ1 l'a, et les 2 sont reconnus

Mais est ce qu'il serait possible que l'Ac anti-AQ1 reconnaisse un épitope qui peut être présent à la fois sur la boucle EC et à "l'intérieur" ? (d'où une notion d'avidité ? Qui ne serait donc pas visible avec AQ1 muté car elle a pas la boucle EC)