Le wobble y en a marre

[julithium]

C'est par ce magnifique début de soirée, la veille de l'exam que je me suis rendue compte que je ne comprenais RIEN au wobble, j'ai beau le tourner dans tous les sens vraiment ça ne marche pas pourtant ça me parait simple je comprend pas ce que je fais qui coince

[Vector]

Coucouuuu !

 

alors pas de panique on va tout reprendre depuis le début : la traduction. La traduction c'est l'étape qui permet de passer de l'ARNm à la protéine. On passe donc d'une chaine de nucléotides à une chaine d'acides aminés. Mais tout ça ne se fait pas magiquement, il y a un petit intermédiaire qu'on appelle l'ARNt qui a pour rôle d'amener l'acide aminé correspondant au message codé dans l'ARNm.

 

Sur la chaine de nucléotides de l'ARNm, les nucléotides sont groupés par 3 pour former un codon (ex : 5'-UAG-3'). Ce codon va s'associer avec 3 nucléotides complémentaires portés par l'ARNt qu'on appelle l'anti-codon. Il existe 32 ARNt pour 20 acides aminés et 3 codons STOP (ce qui explique que plusieurs codons codent pour le même acide aminé dans le code génétique). L'appariement codon / anti-codon se fait en respectant les règles classiques de complémentarité (A/U et C/G) et d'antiparallélité (le 5' d'un brin en face du 3' de l'autre brin et inversement). En plus de l'anti-codon, l'ARNt porte l'acide aminé correspondant au codon de l'ARNm. Cette correspondance est reprise dans le code génétique.

 

Si on reprend notre exemple : 

          codon : 5' - UCG - 3'

  anti-codon : 3' - AGC - 5' (autrement écrit : 5' - CGA - 3' ou tout simplement : CGA)

Acide aminé :        Ser

 

Ça c'est la règle générale : le codon s'apparie avec l'anti-codon et l'acide aminé correspondant est associé à la chaine protéique.

 

Mais parfois on observe des mésappariements (=wobble) entre le codon et l'anti-codon. Ces mésappariements obéissent à 2 règles : 

- Ils ne concernent que la 3e base du codon (le G dans notre exemple) et donc la 1ere base de l'anti-codon (vu qu'ils sont antiparallèles).

- Ils s'effectuent selon la table du Wobble :

 

 

 

Cette table nous dit que :

- le G situé en 3e position du codon peut s'apparier avec le C et le U sur l'anti-codon.

- le U situé en 3e position du codon peut s'apparier avec le A, le G et le I sur l'anti-codon.

- le C situé en 3e position du codon peut s'apparier avec le G et le I sur l'anti-codon.

- le A situé en 3e position du codon peut s'apparier avec le U et le I sur l'anti-codon.

 

C'est ça le wobble, juste des "erreurs de mésappariements" qu'on a recensé dans la table et qui s'ajoutent à la correspondance classique des bases. 

 

donc si on reprend notre exemple :

         codon : 5' - UCG - 3'

anti-codon : 3' - AGC - 5'

       wobble : 3' - AGU - 5' 

 

Est-ce que c'est plus clair ?

 

L'aminobise

 

 

Edited December 18, 2023 by Vector

[julithium]

il y a 17 minutes, Vector a dit :

Coucouuuu !

 

alors pas de panique on va tout reprendre depuis le début : la traduction. La traduction c'est l'étape qui permet de passer de l'ARNm à la protéine. On passe donc d'une chaine de nucléotides à une chaine d'acides aminés. Mais tout ça ne se fait pas magiquement, il y a un petit intermédiaire qu'on appelle l'ARNt qui a pour rôle d'amener l'acide aminé correspondant au message codé dans l'ARNm.

 

Sur la chaine de nucléotides de l'ARNm, les nucléotides sont groupés par 3 pour former un codon (ex : 5'-UAG-3'). Ce codon va s'associer avec 3 nucléotides complémentaires portés par l'ARNt qu'on appelle l'anti-codon. Il existe 32 ARNt pour 20 acides aminés et 3 codons STOP (ce qui explique que plusieurs codons codent pour le même acide aminé dans le code génétique). L'appariement codon / anti-codon se fait en respectant les règles classiques de complémentarité (A/U et C/G) et d'antiparallélité (le 5' d'un brin en face du 3' de l'autre brin et inversement). En plus de l'anti-codon, l'ARNt porte l'acide aminé correspondant au codon de l'ARNm. Cette correspondance est reprise dans le code génétique.

 

Si on reprend notre exemple : 

          codon : 5' - UCG - 3'

  anti-codon : 3' - AGC - 5' (autrement écrit : 5' - CGA - 3' ou tout simplement : CGA)

Acide aminé :        Ser

 

Ça c'est la règle générale : le codon s'apparie avec l'anti-codon et l'acide aminé correspondant est associé à la chaine protéique.

 

Mais parfois on observe des mésappariements (=wobble) entre le codon et l'anti-codon. Ces mésappariements obéissent à 2 règles : 

- Ils ne concernent que la 3e base du codon (le G dans notre exemple) et donc la 1ere base de l'anti-codon (vu qu'ils sont antiparallèles).

- Ils s'effectuent selon la table du Wobble :

 

 

 

Cette table nous dit que :

- le G situé en 3e position du codon peut s'apparier avec le C et le U sur l'anti-codon.

- le U situé en 3e position du codon peut s'apparier avec le A, le G et le I sur l'anti-codon.

- le C situé en 3e position du codon peut s'apparier avec le G et le I sur l'anti-codon.

- le A situé en 3e position du codon peut s'apparier avec le U et le I sur l'anti-codon.

 

C'est ça le wobble, juste des "erreurs de mésappariements" qu'on a recensé dans la table et qui s'ajoutent à la correspondance classique des bases. 

 

donc si on reprend notre exemple :

         codon : 5' - UCG - 3'

anti-codon : 3' - AGC - 5'

       wobble : 3' - AGU - 5' 

 

Est-ce que c'est plus clair ?

 

L'aminobise

 

 

d'accooord, ça me parait plus clair, donc c'est à apprendre par coeur du coup? 

[Vector]

A voir avec ce que vous ont dit le prof et les chargés de TD cette année. L'année dernière la table était donnée à l'exam et il fallait juste la comprendre et savoir l'appliquer.