TD 3 génome

[maelysine]

Bonjour, je ne comprends pas pourquoi l'item E est compté juste? Le produit de la PCR est bien l'ADN donc y'a bien les introns et vu que la mutation est sur l'intron, ça fera bien raccourcir le produit obtenu non??

 

Bonne journée ;)

[Zoe.chvt]

Salut! alors je pense que l'excision e n elle même n'a pas d'effet sur l'ADN génomique : sur ce dernier tu verras bien la mutation mais l'exon 2 ne sera pas excisé donc la taille  de ton ADN génomique ne sera pas modifiée. (d'où le fait que C et E soient vrai)

Est e qe ça répond a ta question ?

[maelysine]

Il y a 2 heures, Zoe.chvt a dit :

Salut! alors je pense que l'excision e n elle même n'a pas d'effet sur l'ADN génomique : sur ce dernier tu verras bien la mutation mais l'exon 2 ne sera pas excisé donc la taille  de ton ADN génomique ne sera pas modifiée. (d'où le fait que C et E soient vrai)

Est e qe ça répond a ta question ?

Merci beaucoup pour ta réponse. Je t'avoue que j'ai pas tout compris. En fait je pense que j'ai pas bien compris ce que fait la mutation: pour moi si y'a la mutation, d'office on a plus l'exon 2 puisqu'elle le coupe. Alors comment on peut comment on peut voir la mutation si l'exon 2 n'est pas excisé?? (pour moi c'est l'absence de l'exon 2 qui montre la mutation non??)

[Vector]

Heeey ! 

 

Si ça peut t'aider j'avais déjà répondu à ce QCM dans le sujet ci-dessous (c'est juste une autre façon de le dire).

 

bon courage, la nucléobise !

 

Le 22/11/2023 à 19:48, Vector a dit :

Dans ce cas la, le QCM insiste sur la différence entre la PCR et la RT-PCR :

 

Quand tu fais une PCR, tu pars de l'ADN génomique (introns + exons) et tu l'amplifies pour en avoir plein de copies (qui contiennent donc les introns et les exons). Qu'il y ai une mutation ou pas, l'exon concerné sera toujours présent dans le génome, donc cette mutation n'aura pas d'impact sur la PCR (sauf bien sur si la mutation concerne le site d'hybridation des amorces, ce qui n'est pas le cas dans ce QCM puisqu'elle se trouve dans l'intron 1).

 

Quand tu fais une RT-PCR tu pars d'un brin d'ARNm mature, donc épissé (ne contenant que des exons) et à partir de cet ARNm tu fais une rétro-transcription (RT) afin d'obtenir pleins de copies d'ADNc (ne contenant que des exons aussi). Donc si une mutation entraine l'excision d'un exon dans la séquence de l'ARN et que cet exon correspond au site de fixation des amorces tu n'auras pas d'amplification.

 

en bref pour cet item : 

On fait une PCR donc il y a amplification de l'ADN génomique (introns + exons) donc la mutation n'a pas de conséquence : l'exon 2 est toujours présent dans le génome et n'a pas été modifié donc l'amorce peut s'hybrider.

Imaginons maintenant le cas où on réalise une RT-PCR : l'ADN nucléaire est transcrit en ARN pré-messager -> lors de l'épissage la mutation de l'intron 1 entraine l'excision de l'exon 2 -> l'ARNm mature ne contient que les exons 1 et 3 -> l'ADNc amplifié ne contient que les exons 1 et 3 -> pas d'amplification car l'amorce se fixe sur l'exon 2 (éliminé lors de l'épissage).

 

Si ce n'est pas clair ou si tu as d'autres questions n'hésite pas !

 

Edited December 17, 2023 by Vector

[maelysine]

il y a 58 minutes, Vector a dit :

Heeey ! 

 

Si ça peut t'aider j'avais déjà répondu à ce QCM dans le sujet ci-dessous (c'est juste une autre façon de le dire).

 

bon courage, la nucléobise !

 

 

Okkk ça y est j'ai compris!! Merci @Zoe.chvt et @Vector!!