Clonage orienté

[jlr.10]

Bonjour, juste une petite question concernant le clonage orienté. Est ce que si le clonage est orienté peut importe le sens dans lequel s’insère la séquence le gène sera transcrit ?

Si oui ça me semble bizarre puisque si on a le codon d’initiation ATG qui se retrouve du coter du terminateur l’ARN formé ne pourra pas être traduit en protéine ? 
 

bon j’espère que vous m’aurais compris

Merci d’avance pour vos réponses. : ) 

[Cassolnousmanque2]

Coucou @jlr.10, 

alors tout d’abord, je te rappelle que dans un clonage ORIENTÉ, il n’y a qu’un seul sens d’insertion possible

Ensuite, la transcription pourra toujours se faire (peu importe si on est dans un cas de clonage orienté ou de clonage non orienté) dans la mesure où il y a un promoteur, et selon la processivité de l’ARN polymérase 

 

Pour rappel, la processivité c’est sur combien de nucléotides la polymérase pourra faire son travail (dans le cas de l’ARN pol, la transcription) avant de se décrocher de la séquence matrice (et non pas amorce !!!!)

 

 

[Cassolnousmanque2]

il y a 12 minutes, jlr.10 a dit :

Si oui ça me semble bizarre puisque si on a le codon d’initiation ATG qui se retrouve du coter du terminateur l’ARN formé ne pourra pas être traduit en protéine ? 

Je pense que tu confonds transcription et traduction 

La transcription c’est : ADN -> ARNm

La traduction c’est ARNm -> protéine 

 

Donc pour la transcription on utilise le promoteur 

Pour la traduction on utilise le codon initiateur ATG 

 

Je te laisse aller voir ce post auquel j’ai répondu ce matin en faisant un exemple qui, je l’espère répondra à ta question : https://forum.tutoweb.org/topic/88615-qcms-forma-ue11/

 

Par contre, si tu es dans un cas de figure comme celui là : 

5’ promoteur - ATCGG …….. GGCTAGCATGGATTAG 3’ 

3’ ——————  TAGCC …….. CCGATCGTACCTAATC 5’

 

et qu’il y a un terminateur dans la séquence en pointillés, alors effectivement tu n’auras pas de protéine puisque le codon ATG se trouve APRÈS le terminateur de transcription (mais la prof ne vous fera pas ce cas là à mon avis)

 

Si tu as encore des questions après, n’hésite pas !!

[jlr.10]

Il y a 5 heures, Cassolnousmanque2 a dit :

Je pense que tu confonds transcription et traduction 

La transcription c’est : ADN -> ARNm

La traduction c’est ARNm -> protéine 

 

Donc pour la transcription on utilise le promoteur 

Pour la traduction on utilise le codon initiateur ATG 

 

Je te laisse aller voir ce post auquel j’ai répondu ce matin en faisant un exemple qui, je l’espère répondra à ta question : https://forum.tutoweb.org/topic/88615-qcms-forma-ue11/

 

Par contre, si tu es dans un cas de figure comme celui là : 

5’ promoteur - ATCGG …….. GGCTAGCATGGATTAG 3’ 

3’ ——————  TAGCC …….. CCGATCGTACCTAATC 5’

 

et qu’il y a un terminateur dans la séquence en pointillés, alors effectivement tu n’auras pas de protéine puisque le codon ATG se trouve APRÈS le terminateur de transcription (mais la prof ne vous fera pas ce cas là à mon avis)

 

Si tu as encore des questions après, n’hésite pas !!

Ok donc si j’ai bien compris quelque soit  le  sens de l’insertion (de l’ADN codant) on aura une transcription en ARNm (si le promoteur est dans le bon sens) mais on aura pas forcément de traduction de cet ARNm en protéine ( en fonction de où se trouve le cordon ATG sur l’ADN codant ) ?

 

[barbiedocteur]

C’est bien ça oui @jlr.10 !

[jlr.10]

Super merci bcp à vous : )