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concours 2013 génome


ConstanceT
Go to solution Solved by JulieFinkel,

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  • Ancien du Bureau

Bonjour !

 

  • QCM 5

Alors voilà ce qui se passe ici : Nous avons à faire à un QCM qui porte sur le Chromosome X. On sait que ce Chr est présent en 2 exemplaires chez les femmes alors qu'il n'y en a qu'1 chez les hommes. De plus !! Les femmes en ont 1 méthylé (inactivé) et un non méthylé. Les hommes eux l'ont non méthyle.

La mise en place de ce QCM fait donc appel à des notions qui mélangent Génome et Biocell !

Autre chose, lorsque les fragments seront préalablement digérés par HhaI ils ne seront pas détectés puisque la PCR ne pourra pas se faire !

À partir de là on peut analyser les résultats :

 

- Item A :

Pas de digestion par HhaI : les bandes peuvent être visible

L'item concerne une femme : il faut donc 2 bandes dans ce cas là

Item Vrai :)

 

- Item B :

L'item concerne une femme : 2 bandes

Digestion par HhaI : une bande doit disparaître (la coupure ne se fait que sur le Chr non méthylé !

La piste II n'a qu'un seule bande

Item Vrai :)

 

- Item C :

Homme : 1 bande

Digestion par HhaI : 0 bandes

La piste III n'a pas de bande

Item Vrai :)

 

- Item D :

Supposons qu'il s'agisse d'un homme et que la piste IV n'a pas été digérée par HhaI :

Piste III : 0 bande ok

Piste IV : 1 bande ok !

Item Vrai :)

Attention si l'item parlait d'une femme, ce serait faux ! il faudrait 2 bandes sur une piste et 1 bande sur la deuxième !

 

- Item E :

On compare les piste I et IV :

Un même individu ne peut pas avoir 3 versions d'un même allèles ! Ici on a 6 + 2 + 4 Il faudrait 3Chr pour porter ces 3 versions

Item Faux :(

 

  • QCM 7 Item D

Avec les amorces A et C tu obtiens ceci :

--->-------------------------------------x---                  (1)

--------------------------------------

 

Avec B et D tu obtiens ceci :

---x-->---------------------                                       (3)

---x--------------------

 

Tu incubes ces fragments à 37°C et ceci se passe :

--->--------------------------------------x---                                     (1)  

                                                ---x-------------------

 

[(2) et (3) peuvent s'apparier de la même façon mais leur produit de PCR sera pas intéressant]

 

Puis le fragment de Klenow la polymérase etc font leur job et tu obtiens miraculeusement au bout de la PCR :

--->---------------------------------------x-----------------------

--------------------------------------------x------------------

(en gras ce qui est nouvellement synthétisé)

 

Ton item est donc Vrai :)

 

 

Voilà voilà :)

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  • Ancien du Bureau
  • Solution

Coucou ! :)

 

Je pense que l'item 7D est faux car si tu incubes les produits de PCR à 37 degrés il ne va rien se passer. Pour qu'il y ait un appariement entre 1 et 4 (cf. schéma d'Alex ci-dessus) il faudrait tout d'abord remonter la température un peu en dessous de 100°C afin de dénaturer les brins, puis descendre la température aux alentours de 60°C afin de permettre l'hybridation des amorces, et enfin ajuster la température à la température optimale de l'ADN polymérase (37°C si on utilise le fragment de Kleenow) afin de permettre la synthèse d'ADN.

 

Attention, dans "la vie de tous les jours" (enfin pas la notre parce qu'on ne fait pas de PCR tous les matins même si on adore ça) on n'utilise pas le fragment de Kleenow mais une ADNpolymérase thermorésistante : la taq ADNpolymérase ( :wub: ). Cette taq ADNpol permet, grâce à sa capacité à résister à des hautes températures, de faire plusieurs cycles de PCR sans rendre l'âme (alors qu'en utilisant l'ADNpol I on doit rajouter de l'ADN pol I à chaque cycle car elle est sensible aux fortes températures, ce qui est peu pratique en plus d'être coûteux). La température optimale de la TaqADNpol étant 72°C, tu vas avoir pour chaque cycle l'enchaînement suivant de températures : 96/98°C (dénaturation des brins) --> 60°C (fixation de l'amorce) --> 72°C (synthèse d'ADN). Cet enchaînement constitue un cycle de PCR est répété entre 30 et 40 fois :).

 

Bref, j'ai un peu dévié pour te faire un petit rappel sur cette histoire de températures mais en tous cas le problème dans cet item est qu'incuber les produits de PCR à 37°C sans avoir augmenté la température au préalable ne permet pas la dénaturation des brins et donc l'hybridation entre eux :).

 

Voilà, j'espère que ça répond à ta question :D .

 

Bonne année et surtout bon courage !

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