2' ou 2?

[JenesaisPASS]

bonjour je comprends pas prq ds ce schéma on a 2 au lieu de 2' alors que c'est bien un DESOXYribose, on dit C5 du ribose et C5' du désoxyribose alors prq ici il n'y a pas d'apostrophe a cote du 2

[Jean-Lactose]

Salut @mkfsarra !

 

Je suis d'accord avec toi. Pour parler du OH en position 2 du ribose, on devrait utiliser la notation 2'. 

Généralement on utilise la notation 1/2/3/4... pour parler de la base, et les notations "en prime" sont utilisées pour le ribose.

C’est pour ça qu'on parle de liaison N1-C'1 entre la base et le ribose.

 

Alors dans ton cas c’est bien un 2'-désoxy car sur le second carbone du ribose il n'y a pas le OH. Ils ont dû se tromper en écrivant. 

Ce nucléoside est donc retrouvé dans l'ADN (si associé à un groupement phosphate auquel cas il deviendra nucélotide)

 

C’est plus clair ?

[PASSion]

Salut @mkfsarra

Selon moi, ils ont écrit dans le diapo 2-desoxy-B-D-ribofuranose et pas 2'-desoxy car on n'a pas encore la formation de la liaison N-osidique. Donc pas un nucléoside

 

C'est après que l'on obtient un nucléoside, et ainsi le nommé par 2'-déoxycytidine.

 

Edited October 12, 2022 by PASSion

[Valou09]

 

Je suis d’accord avec @PASSion

[Jean-Lactose]

Alors oui je suis d'accord avec @PASSion !!

 

Tant que la liaison n'est pas faite avec la base, le ribose reste un ribose avec sa propre notation C1-C2-C3....

C’est le cas de la molécule de gauche.

 

Par contre quand la liaison avec la base est faite, alors on se pose un soucis de notation est là on parle de "prime".

 

Alors à gauche, le ribose est seul donc 2-désoxy. Puis à droite il est lié à la base donc c’est un 2'-désoxy. 

 

C’est plus clair @mkfsarra ?

 

 

Edited October 7, 2022 by Jean-Lactose

[JenesaisPASS]

Il y a 1 heure, Jean-Lactose a dit :

Salut @mkfsarra !

 

Je suis d'accord avec toi. Pour parler du OH en position 2 du ribose, on devrait utiliser la notation 2'. 

Généralement on utilise la notation 1/2/3/4... pour parler de la base, et les notations "en prime" sont utilisées pour le ribose.

C’est pour ça qu'on parle de liaison N1-C'1 entre la base et le ribose.

 

Alors dans ton cas c’est bien un 2'-désoxy car sur le second carbone du ribose il n'y a pas le OH. Ils ont dû se tromper en écrivant. 

Ce nucléoside est donc retrouvé dans l'ADN (si associé à un groupement phosphate auquel cas il deviendra nucélotide)

 

C’est plus clair ?

jsp comment vs citer tous les 3 mais mrc bcp! c bcp plus clair maintenant