Membre d'Honneur etou Posted December 28, 2015 Membre d'Honneur Share Posted December 28, 2015 Bonjour ! Je suis en train de faire le concours 2015 de biomol, et j'ai un soucis au QCM 3.... On nous demande de calculer le pHi du peptide MEKAQH, et la bonne réponse est 7,7. Pourtant je ne trouve pas du tout ça.... Si quelqu'un pourrait détailler la réponse Egalement, je me posais une question a propos de l'asparagine et la glutamine, dans le cours, il est dit que leur pHi est de 6,8, or, si ils ne sont pas ionisables, je ne comprends pas pourquoi ce ne serait pas la moyenne du pKa de l'alpha carboxylique et de l'alpha aminé, donc environ (2,1+9,4)/2 = 5,75. Si quelqu'un pourrait m'éclairer .... Merci d'avance Link to comment Share on other sites More sharing options...
Clemsoin Posted December 28, 2015 Share Posted December 28, 2015 Vu que les tuteurs de biomol sont en vacances (non j'en sais rien, y a juste des vieux sujets qui attendent des réponses, mais je comprends qu'ils n'ont pas que ça à faire, ils font déjà du super boulot sur certaine rubrique (génome+++)). Pour calculer le pHi d'un peptide, il faut prendre la forme switerionique. Moi j'écris le pHi de chaque AA (donc la ça donne environ : 5,8 3 7,7 5,8 10 5,8 5,8). On vire les 5,8, ça donne : 3->7,7->10 Et voilà le pHi ! Link to comment Share on other sites More sharing options...
Maowww Posted December 28, 2015 Share Posted December 28, 2015 Hello Etou ! Je te joins la soluce, dis moi si c'est pas clair Et pour les Phi de N et Q Perret nous a dit en cours qu'il fallait rectifier et que leur phi était plutôt voisin de 5.6 tu as raison Link to comment Share on other sites More sharing options...
Maowww Posted December 28, 2015 Share Posted December 28, 2015 Wottah jme suis faite devancée Link to comment Share on other sites More sharing options...
Membre d'Honneur etou Posted December 28, 2015 Author Membre d'Honneur Share Posted December 28, 2015 Clemsoin : Merci beaucoup! C'est ce que j'avais fait mais avec cette méthode on trouve 3+10+7,7 /3 = 6,9 et non 7,7.... Maowww : Merci c'est très clair Doit on toujours faire cette méthode? Il me semblait qu'une des méthodes était de faire la moyenne des pHi des AA ionisables.. Merci beaucoup pour l'info sur le N et Q! Link to comment Share on other sites More sharing options...
Maowww Posted December 28, 2015 Share Posted December 28, 2015 Perso je fais toujours ca et ca marche bien Je crois que ca ne marche pas comme tu fais , il faut plutot les ordonner et regarder celui du milieu ou un truc comme ca, comme a fait Clemsoin , mais je la trouve plus longue ca fait un moment que je l'ai pas faite, et je la trouve pas logique car on inclus des NH2 et COOH qui ne sont plus ionisables (dans les liaisons amides) De rien Link to comment Share on other sites More sharing options...
Maowww Posted December 28, 2015 Share Posted December 28, 2015 La moyenne des phi de deux groupements c'est quand tu as qu'un seul acide aminé non? Des fois oour aller plus vite pour un peptide qui a 3 groupements ionisables : si 2 basiques (ou 2 acides) et 1 acide (ou un basique) alors c'est la moyenne des 2 basiques (des deux acides). Link to comment Share on other sites More sharing options...
Clemsoin Posted December 28, 2015 Share Posted December 28, 2015 Dans mon explication il fallait justement prendre 7,7 pour pHi parce que c'est à ce pH que le peptide n'a plus de charge! Avant il est chargé - + + => + (E,H,K) à 7,7 il à 0 Après ce pH il est chargé - - + => + Link to comment Share on other sites More sharing options...
Maowww Posted December 28, 2015 Share Posted December 28, 2015 Oui voilà mais j'ai du mal a le voir avec cette technique ^^' Link to comment Share on other sites More sharing options...
Maysha Posted December 28, 2015 Share Posted December 28, 2015 Hello Etou ! Je te joins la soluce, dis moi si c'est pas clair Et pour les Phi de N et Q Perret nous a dit en cours qu'il fallait rectifier et que leur phi était plutôt voisin de 5.6 tu as raison Link to comment Share on other sites More sharing options...
Maysha Posted December 28, 2015 Share Posted December 28, 2015 Hello Etou ! Je te joins la soluce, dis moi si c'est pas clair Et pour les Phi de N et Q Perret nous a dit en cours qu'il fallait rectifier et que leur phi était plutôt voisin de 5.6 tu as raison Link to comment Share on other sites More sharing options...
Maysha Posted December 28, 2015 Share Posted December 28, 2015 Salut! Est ce que tu peux expliquer stp les (+) et (-) et comment trouver la forme zwitterion? Link to comment Share on other sites More sharing options...
Maowww Posted December 28, 2015 Share Posted December 28, 2015 Salut ! Alors c'est pas très compliqué en soi il faut juste être rigoureux Déjà il faut écrire les pKi des différents groupements ionisables comme j'ai fait au début Puis tu traces une droite "des pKi" qui part de 0 et tu note tout le long les différents pKi concernés dans l'ordre croissant en écrivant a droite les groupements Et la tu pars de pH= 0 et tu augmente à chaque fois que tu passes un pKi particulier et tu regardes quelle est la charge du groupement a tel pH Pour le savoir c'est simple : un groupement acide (COOH) va être neutre (0) en dessous de son pKi et négatif en dessus, et un groupement basique (NH2,imidazole... Tous ceux avec un N) sera positif en dessous de sont pKi et neutre (0) en dessus. Donc entre 2 pKa de la droite il faut que tu calcule le bilan des charges de ton peptide et des que tu trouves + puis - ou alors + puis 0 puis - comme dans l'exo, il faut prendre les deux pKi de part et d'autre faire la somme et diviser par 2 et voilouuu J'espere que c'est clair ^^' Link to comment Share on other sites More sharing options...
Membre d'Honneur etou Posted December 29, 2015 Author Membre d'Honneur Share Posted December 29, 2015 Merci beaucoup a vous deux c'est très clair ! Link to comment Share on other sites More sharing options...
Maowww Posted December 29, 2015 Share Posted December 29, 2015 Avec plaisir Link to comment Share on other sites More sharing options...
plumane Posted December 29, 2015 Share Posted December 29, 2015 Bonjour, J'ai aussi un problème avec les calculs de phi alors je me permets de m'inclure dans cette conversation. En utilisant la méthode que vous avez montré pour le peptide MEKAQH, j'ai voulu essayé de faire un item de qcm du concours 2013 dans lequel il était demandé: " le pHi du peptide DISH est voisin de 4.95" Avec votre méthode je trouve que la réponse est fausse alors qu'elle est comptée juste. Merci d'avance. PS: Les valeurs données de pK d'ionisation sont: alpha carboxylique: 2.1 alpha aminé: 9.5 béta carboxylique: 3.9 gamma carboxylique: 4.1 imidazole: 6 Link to comment Share on other sites More sharing options...
Maowww Posted December 29, 2015 Share Posted December 29, 2015 Pour moi ca marche tu as bien pris 3,9 et pas 4,1? Link to comment Share on other sites More sharing options...
Maowww Posted December 29, 2015 Share Posted December 29, 2015 Pour moi ca marche tu as bien pris 3,9 et pas 4,1? Link to comment Share on other sites More sharing options...
plumane Posted December 29, 2015 Share Posted December 29, 2015 Je comprends mon erreur mais ce que je comprends pas c'est comment on sait que pour le D par exemple on prend la valeur de alpha aminé et de béta carboxylique? Je n'arrive jamais à savoir quelles valeurs il faut prendre. Link to comment Share on other sites More sharing options...
Ouistiti Posted December 29, 2015 Share Posted December 29, 2015 Pour trouver le pHi d'un peptide, il faut que tu comprends comment il est construit. Ainsi, pour toutes les chaînes polypeptidiques,tu as une chaîne qui comme par une alpha NH2 et terminé par un alpha COOH. Les autres sont "éliminés" par la liaison peptidique ! Ensuite tu prends les groupements ionisables de tes acides aminés du peptide et partir de là tu peux faire la méthode de Maoww Je sais pas si tu comprends mieux ^^ Link to comment Share on other sites More sharing options...
plumane Posted December 31, 2015 Share Posted December 31, 2015 J'ai enfin compris avec votre méthode car en fait, je mettais avant le pHi des carboxyliques alors qu'il faut mettre 0. Link to comment Share on other sites More sharing options...
Maowww Posted January 1, 2016 Share Posted January 1, 2016 Cool ! Link to comment Share on other sites More sharing options...
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