decortication peptides

[iamsaa8]

bonsoir désoler de vous déranger a cette heure ci mais je fessais des annales et j'ai du mal a réussir  les exercices de décortication des peptides je sais pas comment on fait  pour savoir quelle peptide et avant l'autre  est ce que vous pouvez me résumer ce qu'on doit savoir pour réussir cette exercice car je bloque tout le temps dessus

merci beaucoup

[TheoPF]

Tu parles de quel type d'exo ? Lorsqu'on doit trouver les séquences peptidiques ? genre ça ? 

[iamsaa8]

Il y a 8 heures, TheoPF a dit :

Tu parles de quel type d'exo ? Lorsqu'on doit trouver les séquences peptidiques ? genre ça ? 

oui exactement

 

[TheoPF]

il y a une heure, iamsaa8 a dit :

oui exactement

 

 

Okk, alors déjà ce que tu dois savoir absolument :

 

=> Bromure de Cyanogène : coupe après une Méthionine 

=> Chymotrypsine : coupe après les AA aromatiques (Phe ; Tyr ; Trp) 

=> Trypsine : coupe après Lysine (Lys) et Arginine (Arg)

=> βMercaptoéthanol : coupe un pont Disulfure (S-S) (donc entre 2 cystéines qui sont pas dans la même chaine peptidique) 

=> Carboxypeptidase : coupe le dernier AA de la chaine peptidique 

=> Aminopeptidase : coupe le premier AA de la chaine peptidique 

 

Maintenant, 

 

Tu sais que la trypsine coupe après une Lys ou une Arg donc 

 

Peptide C => FAUX

car si on coupe après le premier Arg (item C) on aura un AA + 1 peptide et si on coupe après le dernier Arg bah ça changera rien

 

Tu sais que la chymotrypsine coupe après les AA aromatiques 

 

Peptide A =>  Vrai

 

car 3ème AA (Phe) on coupe après ça nous fait Gly-Arg-Phe + Ser-Phe-Arg                       

Ser-Phe-Arg => mais on a encore un AA aromatique dans ce peptide donc on coupe après Phe => Ser-Phe + Arg 

Donc pour résumé : on a donc au début Gly-Arg-Phe-Ser-Phe-Arg et on coupe après Phe => Gly-Arg-Phe (1peptide) + Ser-Phe (1peptide) + Arg (1 AA)

=> On a donc bien 2 peptides + 1 AA 

 

 

Peptide B => Vrai

Là aussi on a que Phe comme AA dans la chaîne donc on coupe après "Phe"

=> Phe (1AA) + Arg-Phe (1peptide) + Ser-Gly-Arg (1 peptide)

=> On a donc 1AA + 2 peptides 

 

Peptide D => Faux

Encore une fois les seuls AA aromatiques sont des Phe donc on coupe après Phe

=> Gly-Arg-Phe (1 peptide) + Arg-Ser-Phe (1 peptide)

=> On a donc 2 peptides 

Edited June 2, 2022 by TheoPF

[TheoPF]

Peptide E => Faux

Encore une fois les seuls AA aromatiques sont les Phe donc on coupe après Phe

=> Ser-Phe (1 peptide) + Arg-Phe (1 peptide) + Gly-Arg (1 peptide)

=> On a donc 3 peptides 

 

J'espère que j'ai pas fait d'erreurs dis moi si y a des trucs qui sont pas clairs, c'est dur d'expliquer à l'écrit 

 

et fais gaffe dans l'énoncé on fait 2 réactions indépendantes donc tu testes la première réaction sur chaque chaîne tu vois si ça correspond et puis après tu passes à l'autre réaction en reprenant les chaines peptidiques initiales mais des fois les réactions sont inter dépendantes et du coup tu dois faire étape par étape (ET TU NE RECOMMENCES PAS AVEC LA CHAINE PEPTIDIQUE INITIALE pour la réaction d'après) 

 

Si admettons on dit qu'on utilise du Bromure de Cyanogène tu coupes après la Met et tu gardes les produits comme tels et tu recoupes (selon la prochaine enzyme) jsp si t'as capté 

Attends la confirmation des RM au cas où j'ai fait une erreur 

Edited June 2, 2022 by TheoPF

[iamsaa8]

merci beaucoup oui c'est très claire je referais des qcmpour bien assimiler tout sa