TD Biochimie

[chlorure]

Bonsoir, comment résoudre ce QCM s'il vous plait? Merci !

 

https://zupimages.net/viewer.php?id=21/45/cqwz.png

Q.C.M. 23

Après traitement par le dinitrofluorobenzène, un peptide permet d'isoler un dérivé DNP-Phe. Le peptide subit l'action d'un agent réducteur (-mercaptoéthanol). L'action secondaire de la trypsine permet ensuite d'isoler deux peptides. L'un est un tripeptide qui après plusieurs techniques d’hydrolyse combinées révèle la présence des résidus Phe, Cys et Arg. L’action du DNFB sur le deuxième met en évidence un dérivé DNP-Ala.

Parmi les propositions suivantes, donner celle(s) qui répond(ent) aux conditions précédentes : ....

 

[oce14m]

Salut, il y a sur moodle la correction du TD 

Pour répondre à ce QCM il faut apprendre les diapos du prof :

[nemnémo-raux]

Coucou @ninadpch !!

Dans ton cours sur les peptides et protéines, le prof a mis quelques diapos sur les analyses de peptides, avec tous les agents à connaître. Je te conseille de refaire ce qcm avec le cours ouvert !!

 

AGENTS DENATURANTS :

- Bromure de cyanogène = coupe après les méthionines

- Aminopeptidase = isole le premier AA du peptide

- Carboxypeptidase = isole le dernier AA du peptide

- Dinitrofluorobenzène DNFB = isole le premier AA (comme l'aminopeptidase) sous la forme : DNP-AA

- Bêta mercaptoéthanol = coupe les ponts disulfures, intra ou inter-chaîne, et donc un pont signale la présence de 2 cystéines

- Trypsine = coupe après les arginines et les lysines (mais pas les histidines attention piège récurrent !) 

- Chymotrypsine = coupe après les AA aromatiques, soient : Phénylalanine, Tyrosine et Tryptophane

- Hydrolyse acide = isolation de tous les AA, mais pas dans l'ordre.

 

Afin de connaître les AA composant un peptides, les chercheurs utilisent ces agents dénaturants. 

Ainsi, en appliquant toutes les étapes de ton énoncé, tu trouves : 

1) Phe est le premier AA 

2) On a un pont disulfure, mais on ignore s'il est intra ou inter-chaîne (tu le verras aux propositions dans les items)

3) Le peptide contient une Lys ou une Arg, en troisième position (car cela libère un tripeptide, et que la trypsine coupe APRES Lys ou Arg, et un autre bout de peptide qu'on n'analyse pas ici)

4) Le tripeptide en question contient Phe, Arg et Cys. Ainsi, tu sais que l'AA trouvé en 3) est l'Arg, et non la Lys. De plus, tu remarques la présence d'une Cys dans ce tripeptide, donc l'autre bout de peptide, après l'Arg, contiendra une Cys également (pour pouvoir former le pont disulfure) .

5) Le premier AA du deuxième peptide jusqu'ici non caractérisé est Ala. 

 

Cela te donne : Phe-Cys-Arg-Ala........ Cys (on ne connaît pas sa position exacte)

Donc les réponses C et E sont possibles. 

 

Voilàà !

Bisous glucidiques