qcm ED 2020

[PassPartout_]

Coucou,

Je vous joint un qcm assez long, mais dont seul l'item D me pose problème..

 

Je comprends pas comment on est sensé savoir à quelle base débute l'exon 4.

 

Merci d'avance!

[SBY]

Coucou @PassPartout_ ! 

Mdrrr ça fait 1h que je me creuse la tête sur cet item mais tu vas voir que la réponse était assez évidente au final 

Dans le QCM précédent on avait trouvé normalement que : 

 - Foie = Exons 2,3, 4 à 12

          ou Exons 2, 4 à 12 (donc avec un épissage alternatif de l'exon 3)

- Pancréas = Exons 1, 4 à 12

On nous disait également dans l'énoncé que l'intron 3 est de phase 0 ce qui signifie que cet intron est entre deux codons donc entre le dernier codon de l'exon 3 et le premier de l'exon 4. 

Donc on voit ici que entre le fois et le pancréas les exons 4 à 12 sont communs. Donc on va bien retrouver le début de l'exon 4 dans les deux transcrits donnés. L'item C est donc vrai. 

Pour l'item D, il suffit tout simplement de chercher le début de cette partie commune entre les transcrits, en partant de la fin pour être sûr de ne pas se tromper. Et on trouve que le premier codon commun est gta. Celui-ci code pour une Valine. L'item d est donc faux. 

Voilà j'espère que c'est plus clair pour toi ! 

Bon courage pour le CCB 

[PassPartout_]

Le 01/11/2021 à 14:45, SBY a dit :

Coucou @PassPartout_ ! 

Mdrrr ça fait 1h que je me creuse la tête sur cet item mais tu vas voir que la réponse était assez évidente au final 

Dans le QCM précédent on avait trouvé normalement que : 

 - Foie = Exons 2,3, 4 à 12

          ou Exons 2, 4 à 12 (donc avec un épissage alternatif de l'exon 3)

- Pancréas = Exons 1, 4 à 12

On nous disait également dans l'énoncé que l'intron 3 est de phase 0 ce qui signifie que cet intron est entre deux codons donc entre le dernier codon de l'exon 3 et le premier de l'exon 4. 

Donc on voit ici que entre le fois et le pancréas les exons 4 à 12 sont communs. Donc on va bien retrouver le début de l'exon 4 dans les deux transcrits donnés. L'item C est donc vrai. 

Pour l'item D, il suffit tout simplement de chercher le début de cette partie commune entre les transcrits, en partant de la fin pour être sûr de ne pas se tromper. Et on trouve que le premier codon commun est gta. Celui-ci code pour une Valine. L'item d est donc faux. 

Voilà j'espère que c'est plus clair pour toi ! 

Bon courage pour le CCB 

merci beaucoup pour ta réponse c'est parfait  

[-manon]

Le 01/11/2021 à 14:45, SBY a dit :

e l'intron 3 est de phase 0 ce qui signifie que cet intron est entre deux codons donc entre le dernier codon de l'exon 3 et le premier de l'exon 4

Salut ! Je reviens sur ce sujet car je ne comprends par trop cette partie 

Si un intron de phase 0 est situé juste après le codon, il n'y aura pas alors de décalage du cadre de lecture lors de la traduction.

Mais je ne comprends pas comment un intron de phase 1 par exemple peut se décaler, et donc décaler le cadre de lecture? Est-ce que cela voudrait dire qu'il y aurait rien entre la fin du codon et le début de l'intron de phase 1?

Merci d'avance  @SBY

[SBY]

Coucou @-manon ! 

 

Quelle que soit la phase de l'intron, il n'y a pas de décalage du cadre de lecture puisque c'est quelque chose de ''normal''. Le décalage du cadre de lecture va être retrouvé en cas d'insertion ou de délétion de nt, quand leur nombre ne correspond pas à un multiple de 3.

 

Pour reprendre les différentes phases : 

- Phase 0 : intron situé entre deux codons. Donc quand l'intron est excisé ça ne pose aucun soucis, le dernier codon de l'exon 1 fera suite au premier codon de l'exon 2. 

- Phase 1 : intron situé après le premier nt d'un codon, et donc les deux autres nt de ce codon appartiendront à l'exon suivant

- Phase 2 : après le deuxième nt du codon 

 

Dans le QCM 16 du CCB par exemple, l'intron 1 était de phase 1. 

 

Bon courage ! 

[-manon]

@SBY Merci beaucoup!!! bonne journée