QCM supplémentaires

[Laurie12]

Hello ! J'ai pas mal de questions sur les QCM sup :

Q2 : pourquoi la C est fausse alors qu'on a bien 2 L hydrogène entre A et T ? C'est parce que c'est un brin d'ARN ? 

Q9 : Pourquoi on ne trouve pas les 60 % de GC et aussi les O.15 devraient être bons nn ? 

Q10 : les bactéries et bactériophages ne sont pas au prgm de pass non ? Je croyais que ct que pour les PACES

Q27 : pourquoi A n'est pas activateur alors qu'on voit qu'a 100 nm il y a plus de X ? Du coup pourquoi c'est pas un cis régulateur ?

Q29 30 : j'arrive pas trop à voir comment on calculer le nombre de fragments obtenus, enfin mes calculs sont faux

Q49 : pourquoi le B est faux et le C est vrai ? On voit sur la PCR que y a le d et pas le c...

C'est quoi une PCR stringeante ? 

Voilà merci beaucoup !! 

[audreyfdn]

coucou @Laurie12!

Désolé du retard  je vais essayer de faire de mon mieux pour te répondre !

Le 11/04/2021 à 10:52, Laurie12 a dit :

Q2 : pourquoi la C est fausse alors qu'on a bien 2 L hydrogène entre A et T ? C'est parce que c'est un brin d'ARN ?

Pour l'item 2C, je pense que cela est faux car les deux nucléotides qui sont encadrés ne sont pas A et T mais effectivement A et U. Le nucléotide de gauche est un Uracile.

Le 11/04/2021 à 10:52, Laurie12 a dit :

Q9 : Pourquoi on ne trouve pas les 60 % de GC et aussi les O.15 devraient être bons nn ? 

Pour le QCM 9 :

Il faut ici bien comprendre le pourcentage des nucléotides dans l'ADN. 

On nous dit qu'une molécule d'ADN comprend : 0,15 de A, 0,35 de G, 0,25 de C  et 0,25 de T. Dans une molécule d'ADN, les A s'apparient avec les T et les G avec les C. Normalement, le pourcentage de chaque nucléotide devrait être identique, cela signifie juste que les pourcentages que l'on te donne correspondent à un seul brin. 

Résumons les pourcentages du brin donné, et la déduction pour le brin complémentaire :

0,15  de A, le brin complémentaire aura donc 0,15 de T.

0,25 de T, le brin complémentaire aura donc 0,25 de A.

0,35 de G, le brin complémentaire aura donc 0,35 de C.

0,25 de C, le brin complémentaire aura donc 0,25 de G.

Au total, l'ADN sous forme double brin aura 0,15+0,25 de A et T, soit 0,40 de A et T, ce qui fait 0,20 de A et 0,20 de T (divisé par deux). 

0,25 + 0,35 de C et G, soit 0,60 de G et C, ce qui fait 0,30 de G et 0,30 de C. 

Tout les chiffres peuvent être multiplié par 100 pour trouver les pourcentages. 

L'item B est faux car le brin complémentaire comprend 0,25 de A, puisque le brin donné contenait 0,25 de T.

L'item C est vrai comme montre les calculs si dessus, soit 0,25 + 0,35 = 0,60 = 60% de G et de C. 

Le 11/04/2021 à 10:52, Laurie12 a dit :

Q10 : les bactéries et bactériophages ne sont pas au prgm de pass non ? Je croyais que ct que pour les PACES

En effet, ce QCM me semble un peu compliqué au vu de votre programme, le mieux serait de demander au professeur pour en être sûre. 

Le 11/04/2021 à 10:52, Laurie12 a dit :

Q27 : pourquoi A n'est pas activateur alors qu'on voit qu'a 100 nm il y a plus de X ? Du coup pourquoi c'est pas un cis régulateur ?

Pour ce QCM, il faut faire attention à deux choses :

Dans la transcription, nous pouvons avoir des éléments des cis régulateurs, et des éléments trans régulateurs. Les éléments cis régulateurs sont des séquences régulatrices de gènes présentes dans le génome de la cellule. Les éléments trans régulateurs sont des protéines régulatrices de gènes. Ici, l'élément régulateur est une protéine A, donc ce n'est pas un élément cis régulateur, mais trans régulateur. 

 

Ensuite, pour ce qui est de la concentration de la protéine à 100nM. Nous pouvons voir dans le gel d'électrophorèse pour la piste à 100 nM que le gène X est + transcrit. Mais nous ne pouvons pas conclure grâce à cette piste car le gène domestique est aussi en plus grande concentration, or un gène domestique est un gène qui est transcrit dans les mêmes quantités quoiqu'il arrive, c'est un témoin. Le fait qu'il soit en plus grande quantité montre qu'il y a eu une erreur, ce qui fausse les résultats pour la protéine X. Nous ne pouvons donc pas conclure quant à l'induction de la transcription de X lorsque la protéine A est à une concentration de 100nM. 

Le 11/04/2021 à 10:52, Laurie12 a dit :

Q29 30 : j'arrive pas trop à voir comment on calculer le nombre de fragments obtenus, enfin mes calculs sont faux

Tout d'abord, il faut faire attention à l'endroit ou les amorces s'hybrident : à l'exon 1 et l'exon 5. L'exon 2 fait 200pb et l'exon 5 fait 400pb. Cela veut dire que si nous avons une amplification, la séquence fera au minimum 600pb car la présence des exons 1 et 5 est obligatoire pour qu'il y ai amplification. L'amplification de brins à moins de 600pb témoigne donc de contaminations/ amplifications parasites. L'item A est vrai. Ensuite, regardons la taille des fragments à chaque possibilité d'épissages alternatifs :

0 épissages : Exon 1+2+3+4+5 = 200 + 300 + 100 + 400 + 400 = 1400 pb

Epissage de l'exon 2 : 1400 - exon 2 = 1400 -300 = 1100 pb.

Epissage de l'exon 3 : 1400 - exon 3 = 1400 - 100 = 1300 pb.

Epissage de l'exon 4 : 1400 - exon 4 = 1400 - 400 = 1000pb.

Epissage des exon 2 + 3 : 1400 - (300 + 100) = 1000pb.

Epissage des exon 2 + 4 : 1400 - (300 + 400) = 700pb.

Epissage des exon 3 + 4 : 1400 - (100 + 400 ) = 900pb.

Epissage des exon 2 + 3 +4 : 1400 - (100+300+400) = 600pb. 

Grâce aux calculs si dessus, nous pouvons répondre aux items :

29 ) 

A - Vrai comme vu précédemment 

B- Faux car lorsque nous avons vu les épissages alternatifs, un fragment à 1200pb n'est pas possible. Cela signifie qu'il y a eu une mutation, mais ce n'est pas lié à un épissage alternatif. 

C- Vrai, ceci est une possibilité, l'exon 1 ou 5 peuvent être épissé, ce qui fait qu'aucun fragment n'est amplifié car l'amorce n'a pas pu s'hybrider.

D- Vrai, cela est une possibilité.

E - Vrai, on aurait eu des informations supplémentaires.

30) 

A - Vrai, La quantité d'ARN n'est pas spécifiée, donc on peut très bien avoir une mutation sur un des allèles.

B- Vrai, l'exon 3 fait 100pb.

C- Vrai, même si nous supposons un épissage alternatif, cela peut aussi être lié à une mutation.

D- Vrai, si il y a une mutation sur l'exon 5, l'amorce ne peut pas s'hybrider, et donc il n'y aura pas d'amplification.

E - Faux, car une mutation sur l'exon 3 n'aurait pas empêcher une amplification. 

 

Le 11/04/2021 à 10:52, Laurie12 a dit :

Q49 : pourquoi le B est faux et le C est vrai ? On voit sur la PCR que y a le d et pas le c

 

Il me semble que tu parles plutôt du QCM 39. Reprenons ensemble ce QCM. 

Avec les Amorces et les pb sur l'électrophorèse, nous pouvons conclure que :

Dans le foie, il y a : 

Avec les amorces A et B, un fragment à 500pb, soit l'exon I (300) et II (200).

Avec les amorces A et C, rien.

Avec les amorces A et D, un fragment à 750pb. Ici, nous pouvons voir une amplification avec l'amorce D, donc l'exon IV sera forcément présent dans l'ARNm. Pour arriver à 750pb, il nous faut donc 200pb car l'exon I fait déjà 300pb et l'exon IV 250pb. Le seul exon possible est donc l'exon II. l'ARNm sera donc : I+II+IV.

L'item B est donc faux, si l'ARNm était  I+II+III, on aurait pas eu d'amplifications avec les amorces A et D puisque l'exon IV est épissé, et donc l'amorce D n'aurait pas pu s'hybrider. 

Dans le muscle, il y a :

Avec les amorces A et B, 0 amplifications.

Avec les amorces A et C, une amplification à 600pb, ce qui correspond à I+III.

Avec les amorces A et D, une amplification à 850pb, ce qui correspond à I+III+IV.

J'espère que pour ce QCM tout est clair pour toi, n'hésite pas à me redemander des explications si jamais ce n'est pas le cas.

Le 11/04/2021 à 10:52, Laurie12 a dit :

C'est quoi une PCR stringeante ? 

Enfin, pour répondre à cette question, il me faudrait peut être un contexte.

Je vais néanmoins essayer de t'expliquer ce qu'est la stringence. La stringence correspond aux conditions d'appariement de l'ADN et de l'ARN. Dans une PCR, en fonction de la température par exemple, l'appariement des deux brins se fera de façon plus ou moins spécifique. A haute température, l'appariement est difficile, cela veut dire que pour qu'il y ai appariement, la spécificité entre les deux brins doit être élevée, on parle de haute stringence.

A basse température, l'appariement est facile, cela veut dire que deux séquences pourront s'hybrider entre elles alors qu'elles n'ont pas forcement une séquence totalement complémentaire (un nucléotide peut changer mais on aura quand même appariement), on parle de basse stringence. 

Après, je ne suis pas certaine de ce que veut dire une PCR stringente, as tu un contexte ? 

 

Voila,  j'espère t'avoir aidé , est ce que tout est bon pour toi ? 

[Laurie12]

Il y a 10 heures, audreyfdn a dit :

coucou @Laurie12!

Désolé du retard  je vais essayer de faire de mon mieux pour te répondre !

Pour l'item 2C, je pense que cela est faux car les deux nucléotides qui sont encadrés ne sont pas A et T mais effectivement A et U. Le nucléotide de gauche est un Uracile.

Pour le QCM 9 :

Il faut ici bien comprendre le pourcentage des nucléotides dans l'ADN. 

On nous dit qu'une molécule d'ADN comprend : 0,15 de A, 0,35 de G, 0,25 de C  et 0,25 de T. Dans une molécule d'ADN, les A s'apparient avec les T et les G avec les C. Normalement, le pourcentage de chaque nucléotide devrait être identique, cela signifie juste que les pourcentages que l'on te donne correspondent à un seul brin. 

Résumons les pourcentages du brin donné, et la déduction pour le brin complémentaire :

0,15  de A, le brin complémentaire aura donc 0,15 de T.

0,25 de T, le brin complémentaire aura donc 0,25 de A.

0,35 de G, le brin complémentaire aura donc 0,35 de C.

0,25 de C, le brin complémentaire aura donc 0,25 de G.

Au total, l'ADN sous forme double brin aura 0,15+0,25 de A et T, soit 0,40 de A et T, ce qui fait 0,20 de A et 0,20 de T (divisé par deux). 

0,25 + 0,35 de C et G, soit 0,60 de G et C, ce qui fait 0,30 de G et 0,30 de C. 

Tout les chiffres peuvent être multiplié par 100 pour trouver les pourcentages. 

L'item B est faux car le brin complémentaire comprend 0,25 de A, puisque le brin donné contenait 0,25 de T.

L'item C est vrai comme montre les calculs si dessus, soit 0,25 + 0,35 = 0,60 = 60% de G et de C. 

En effet, ce QCM me semble un peu compliqué au vu de votre programme, le mieux serait de demander au professeur pour en être sûre. 

Pour ce QCM, il faut faire attention à deux choses :

Dans la transcription, nous pouvons avoir des éléments des cis régulateurs, et des éléments trans régulateurs. Les éléments cis régulateurs sont des séquences régulatrices de gènes présentes dans le génome de la cellule. Les éléments trans régulateurs sont des protéines régulatrices de gènes. Ici, l'élément régulateur est une protéine A, donc ce n'est pas un élément cis régulateur, mais trans régulateur. 

 

Ensuite, pour ce qui est de la concentration de la protéine à 100nM. Nous pouvons voir dans le gel d'électrophorèse pour la piste à 100 nM que le gène X est + transcrit. Mais nous ne pouvons pas conclure grâce à cette piste car le gène domestique est aussi en plus grande concentration, or un gène domestique est un gène qui est transcrit dans les mêmes quantités quoiqu'il arrive, c'est un témoin. Le fait qu'il soit en plus grande quantité montre qu'il y a eu une erreur, ce qui fausse les résultats pour la protéine X. Nous ne pouvons donc pas conclure quant à l'induction de la transcription de X lorsque la protéine A est à une concentration de 100nM. 

Tout d'abord, il faut faire attention à l'endroit ou les amorces s'hybrident : à l'exon 1 et l'exon 5. L'exon 2 fait 200pb et l'exon 5 fait 400pb. Cela veut dire que si nous avons une amplification, la séquence fera au minimum 600pb car la présence des exons 1 et 5 est obligatoire pour qu'il y ai amplification. L'amplification de brins à moins de 600pb témoigne donc de contaminations/ amplifications parasites. L'item A est vrai. Ensuite, regardons la taille des fragments à chaque possibilité d'épissages alternatifs :

0 épissages : Exon 1+2+3+4+5 = 200 + 300 + 100 + 400 + 400 = 1400 pb

Epissage de l'exon 2 : 1400 - exon 2 = 1400 -300 = 1100 pb.

Epissage de l'exon 3 : 1400 - exon 3 = 1400 - 100 = 1300 pb.

Epissage de l'exon 4 : 1400 - exon 4 = 1400 - 400 = 1000pb.

Epissage des exon 2 + 3 : 1400 - (300 + 100) = 1000pb.

Epissage des exon 2 + 4 : 1400 - (300 + 400) = 700pb.

Epissage des exon 3 + 4 : 1400 - (100 + 400 ) = 900pb.

Epissage des exon 2 + 3 +4 : 1400 - (100+300+400) = 600pb. 

Grâce aux calculs si dessus, nous pouvons répondre aux items :

29 ) 

A - Vrai comme vu précédemment 

B- Faux car lorsque nous avons vu les épissages alternatifs, un fragment à 1200pb n'est pas possible. Cela signifie qu'il y a eu une mutation, mais ce n'est pas lié à un épissage alternatif. 

C- Vrai, ceci est une possibilité, l'exon 1 ou 5 peuvent être épissé, ce qui fait qu'aucun fragment n'est amplifié car l'amorce n'a pas pu s'hybrider.

D- Vrai, cela est une possibilité.

E - Vrai, on aurait eu des informations supplémentaires.

30) 

A - Vrai, La quantité d'ARN n'est pas spécifiée, donc on peut très bien avoir une mutation sur un des allèles.

B- Vrai, l'exon 3 fait 100pb.

C- Vrai, même si nous supposons un épissage alternatif, cela peut aussi être lié à une mutation.

D- Vrai, si il y a une mutation sur l'exon 5, l'amorce ne peut pas s'hybrider, et donc il n'y aura pas d'amplification.

E - Faux, car une mutation sur l'exon 3 n'aurait pas empêcher une amplification. 

 

 

Il me semble que tu parles plutôt du QCM 39. Reprenons ensemble ce QCM. 

Avec les Amorces et les pb sur l'électrophorèse, nous pouvons conclure que :

Dans le foie, il y a : 

Avec les amorces A et B, un fragment à 500pb, soit l'exon I (300) et II (200).

Avec les amorces A et C, rien.

Avec les amorces A et D, un fragment à 750pb. Ici, nous pouvons voir une amplification avec l'amorce D, donc l'exon IV sera forcément présent dans l'ARNm. Pour arriver à 750pb, il nous faut donc 200pb car l'exon I fait déjà 300pb et l'exon IV 250pb. Le seul exon possible est donc l'exon II. l'ARNm sera donc : I+II+IV.

L'item B est donc faux, si l'ARNm était  I+II+III, on aurait pas eu d'amplifications avec les amorces A et D puisque l'exon IV est épissé, et donc l'amorce D n'aurait pas pu s'hybrider. 

Dans le muscle, il y a :

Avec les amorces A et B, 0 amplifications.

Avec les amorces A et C, une amplification à 600pb, ce qui correspond à I+III.

Avec les amorces A et D, une amplification à 850pb, ce qui correspond à I+III+IV.

J'espère que pour ce QCM tout est clair pour toi, n'hésite pas à me redemander des explications si jamais ce n'est pas le cas.

Enfin, pour répondre à cette question, il me faudrait peut être un contexte.

Je vais néanmoins essayer de t'expliquer ce qu'est la stringence. La stringence correspond aux conditions d'appariement de l'ADN et de l'ARN. Dans une PCR, en fonction de la température par exemple, l'appariement des deux brins se fera de façon plus ou moins spécifique. A haute température, l'appariement est difficile, cela veut dire que pour qu'il y ai appariement, la spécificité entre les deux brins doit être élevée, on parle de haute stringence.

A basse température, l'appariement est facile, cela veut dire que deux séquences pourront s'hybrider entre elles alors qu'elles n'ont pas forcement une séquence totalement complémentaire (un nucléotide peut changer mais on aura quand même appariement), on parle de basse stringence. 

Après, je ne suis pas certaine de ce que veut dire une PCR stringente, as tu un contexte ? 

 

Voila,  j'espère t'avoir aidé , est ce que tout est bon pour toi ? 

Coucou ! Tkt pas de pb. 

Juste pour les QCM 29 et 30 comment on sait quels exons s'amorcent ? 

Merci pour toutes tes explications le reste est plus clair ! 

[audreyfdn]

il y a une heure, Laurie12 a dit :

Juste pour les QCM 29 et 30 comment on sait quels exons s'amorcent ? 

 

Tu peux voir sur l'énoncé que les amorces sont indiquées par des flèches. L'emplacement des flèches t'indique sur quels exons elles s'hybrident. La première flèche (amorce) s'hybride avec l'exon 1 et la deuxième amorce s'hybride avec l'exon 5. 

C'est bon pour toi ? 

 

 

[Laurie12]

il y a 47 minutes, audreyfdn a dit :

Tu peux voir sur l'énoncé que les amorces sont indiquées par des flèches. L'emplacement des flèches t'indique sur quels exons elles s'hybrident. La première flèche (amorce) s'hybride avec l'exon 1 et la deuxième amorce s'hybride avec l'exon 5. 

C'est bon pour toi ? 

 

 

Ah ok je suis bête mdrr J'avais pas compris que ça servait à ça 

Merci beaucoup !