Jump to content

Acide aminé Phi, PKr tout ça tout ça


Neutrino11
Go to solution Solved by Nymma,

Recommended Posts

  • Ancien Responsable Matière

Salut salut @Neutrino11  (enfin plutot re ☺️) !!

 

Alors, pour les protéines, tu as 4 notions qui découlent du pH :

- le pHi qui est le pH pour lequel l'acide aminé (ou la protéine) est sous forme zwitterion c'est-à-dire que l'acide aminé a une charge globale nulle 

- le pKr est le pH délimitant la forme acide et la forme basique du radical d'un acide aminé donné : en dessous du pKr, le radical est acide et au-dessus du pKr, ce radical est basique. Le pKr est propre a chaque acide aminé et il faut aussi savoir que les acides aminés hydrophobes n'ont pas de pKr

- le pKn est le pH délimitant la forme acide et basique de l'amine liée au carbone alpha (l'amine de la liaison peptidique), elle fonctionne sur le même principe que le pKr et elle a pour valeur pKn = 9,5

- le pKc qui est le pH délimitant la forme acide et basique du carbone lié au carbone alpha (le carbone de la liaison peptidique), elle fonctionne sur le même principe que le pKr et elle a pour valeur pKc = 2

 

Pour finir, on peut également calculer le pHi qui est égal

- à (pKc + pKn)/2 pour les acides aminés hydrophobes

- à (pKc + pKr)/2 pour les acides aminés polaires à pKr bas (donc acide comme Asp ou Glu)

- à (pKn + pKr)/2 pour les acides aminés polaires à pKr haut (donc basiques comme Lys ou Arg)

 

Est-ce que c'est bon pour toi ??

Link to comment
Share on other sites

  • Ancien Responsable Matière
  • Solution
Il y a 3 heures, Neutrino11 a dit :

D'accord!  mais comment je procède lorsqu'on me demande par exemple à un certain pH donné, si l'AA est ionisé?

 

Pour savoir s'il est ionisé, il faut que tu regardes sous quelle forme est ton acide aminé au pH donné. Je te met un exemple :

Ici, pour l'Asp, les formes A+, A2+ et A- sont des formes protonées. 

 

Il y a 3 heures, Neutrino11 a dit :

et si je comprends bien tous les AA hydrophobes ont un pHi identique soit = 5,75??

Exactement !

 

Est-ce que c'est plus clair pour toi ? (d'ailleurs n'oublie pas de me mentionner pour que je puisse être notifiée de ta réponse !)

Link to comment
Share on other sites

Join the conversation

You can post now and register later. If you have an account, sign in now to post with your account.
Note: Your post will require moderator approval before it will be visible.

Guest
Reply to this topic...

×   Pasted as rich text.   Paste as plain text instead

  Only 75 emoji are allowed.

×   Your link has been automatically embedded.   Display as a link instead

×   Your previous content has been restored.   Clear editor

×   You cannot paste images directly. Upload or insert images from URL.

  • Recently Browsing   0 members

    • No registered users viewing this page.
×
×
  • Create New...