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oligodésoxynucléotides


vicgregori
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Bonjour à tous je ne comprend pas du tout la démarche a suivre pour répondre à ce genre d'items, si quelqu'un peut m'aider je suis preneuse. ( les réponses vrai sont ACE) 😕

 

Une partie de la séquence d’une protéine est la suivante : VAMNCELGRK
On désire synthétiser des oligodésoxynucléotides de 15 désoxynucléotides correspondant à une partie de cette séquence 
:

 

A : si l’on choisit les acides aminés MNCEL, on doit utiliser un mélange de 48 oligodésoxynucléotides pour être sur d’avoir au moins une séquence identique à celle de l’ADNc correspondant

B : si l’on choisit les acides aminés CELGR, on doit utiliser un mélange de 192 oligodésoxynucléotides pour être sur d’avoir au moins une séquence identique à celle de l’ADNc correspondant

C : si l’on choisit les acides aminés VAMNC, on doit utiliser un mélange de 64 oligodésoxynucléotides pour être sur d’avoir au moins une séquence identique à celle de l’ADNc correspondant

D : si l’on choisit les acides aminés ELGRK, on doit utiliser un mélange de 192 oligodésoxynucléotides pour être sur d’avoir au moins une séquence identique à celle de l’ADNc correspondant

E : la séquence AMNCE permet la synthèse du plus petit nombre d’oligodésoxynucléotides dont un correspondra à l’ADNc

 

Abrévation: A:alanine;C:cysteine;E:acglutamique;G:glycocolle;K:lysine;L:leucine; M : méthionine ; N : asparagine ; R : arginine ; V : valine

 

 

Merci d'avance 🙂 

Edited by vicgregori
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  • Solution

VAMNCELGRK est une protéine qui est constitué d'AA qui peuvent être donné par plusieurs codons différents, ce qui fait qu'il existe plusieurs séquences codantes d'ADN possible correspondant à VAMNCELGRK

 

Pour être sûr qu'on est au moins une séquence qui s'hybride avec l'adnc, il faut donc que notre mélange de nucléotides puisse former toutes les possibilités de séquences liées à la séquence d'AA que l'on a choisi

 

Pour cela , il faut multiplier le nombre de codons que chaque AA donne entre eux pour avoir toutes les possibilités

 

A) MNCEL : M donne 1 codon, N 2 codons, C 2 codons, E 2 codons et L 6 codons. Donc le nombre de séquences possibles pour MNCEL est 1*2*2*2*6=48

Il faudrait donc un mélange de 48 nucléotides pour être sûr qu'il forme au moins 1 séquence complémentaire de l'ADNc

 

B) CELGR = 2*2*6*4*6=576

C) VAMNC = 4*4*1*2*2=64

D) ELGRK = 2*6*2*6*2=288

 

E) il faut prendre la séquence d'AA (qui suit l'ordre de VAMNCELGRK) qui donne le moins de codons différents : les autres séquences que l'on n'a pas testé sont :

 

AMNCE = 4*1*2*2*2=32

MNCEL= 1*2*2*2*6=48

NCELG = 2*2*2*6*2=96

 

donc c'est bien AMNCE qui donne le plus petit mélange

 

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