séquençage =(

[saraahh]

bonsoir à tous ! j'ai un problème d'orientation des brins en séquençage je crois...

en temps normal quand la flèche va en bas (comme dans le QCM qui vient après) je fais la séquence non codante de haut en bas et de 3' en 5' et la complémentaire codante en face de 5' en 3' et je pensais que c'était bon mais un QCM vient visiblement de me démontrer le contraire...

je met le lien c'est sur le QCM 21 et il y a la correction en suivant : S1 - Génome - PACES - 2019.pdf (tutoweb.org)

si quelqu'un peut m'expliquer comment on obtient les séquences j'avais trouvé l'orientation inverse

@YEAHBOY si jamais tu peux m'aider 

Edited January 2, 2021 by saraahh

[YEAHBOY]

Ce que tu dis est presque bon mais attention : le brin sur le gel se lit de bas en haut car c'est le sens de lecture du brin... Et le sens de lecture d'un brin c'est... de 5' en 3' et non pas l'inverse ! 

 

Lecture = de bas en haut et de 5' en 3'

 

Est-ce bien là ton erreur ?

 

[saraahh]

@YEAHBOY je fais pareil mais en lisant de haut en bas en orientant de 5' en 3' pardon je voulais dire l'inverse, si c'est bien le brin non codant je ne comprends pas 

(j'essaie de t'envoyer ce que j'ai fait sur le sujet même si c'est pas du tout propre)

Edited January 2, 2021 by saraahh

[YEAHBOY]

Ah non en lisant de haut en bas il faut l'orienter de 3' en 5'

Puisque de haut en bas tu lis le brin de sa fin vers son début

[saraahh]

voilà j'ai fait le brin non codant sur la gauche et le codant à droite, je fais toujours ça mais du coup c'est peut-être que je fais toujours mal ... https://zupimages.net/viewer.php?id=21/53/1zme.jpeg

 

[YEAHBOY]

Ou alors je ne comprends pas bien ta question  

[saraahh]

oui pardon de 3' en 5' de haut en bas mais c'est peut-être le mauvais brin

[YEAHBOY]

Tu t'es trompé sur la première base du brin sur le gel : tu m'as mis un T à la place du A  

[saraahh]

ohlala !!!! mais quelle conne merci @YEAHBOYhaha 

l'orientation est ok sinon?

[YEAHBOY]

Eheh oui sinon c'est bon

 

Après petite précision sur le séquençage du DNA génomique : le brin du gel c'est pas toujours le brin codant. Le brin que tu lis c'est celui qui suit l'amorce. Certes on te parle d'exon mais un exon est double brin, donc si on ne te précise rien sur l'amorce (càd si elle s'hybride avec le brin codant ou non codant), ou qu'on ne te dit rien sur le caractère du brin du gel tu ne peux rien conclure.

 

En gros si t'as zéro info tu peux juste dire que le brin du gel il suit l'amorce.

[saraahh]

ok je vois ce que tu veux dire merci beaucoup @YEAHBOY!!

[YEAHBOY]

Quand tu me dis j'ai fais le brin codant à droite et le non codant à gauche en vrai tu peux pas savoir (sauf si tu avais les infos aux qcm précédents j'ai pas regardé)

[saraahh]

oui oui effectivement @YEAHBOY on n'avait pas d'info c'était ancré dans ma tête comme ça mais du coup je ne ferais pas l'erreur si jamais, merciii