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29E R16 - La levadance


ZinédineZidane
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Salut,

 

Elle est comptée faux, mais en faisant le brin opposé au 5'-3' qui part de bas en haut pour le patient témoin, bah on trouve un deuxième site ou ça peut couper. Du coup je me demandais si on devait chercher les sites de restriction uniquement sur le brin 5'-3', et pas sur le 3'-5' même en inversant le sens pour que l'enzyme coupe dans son sens normal (jsp si c'est clair mdr)

 

https://zupimages.net/viewer.php?id=20/52/wvi3.png

https://zupimages.net/viewer.php?id=20/52/swgy.png

Edited by ZinédineZidane
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  • Solution

Quand tu réalises le séquençage des brins du témoin, tu obtiens ceci

 

5' CATGTATATGAGTAAGTACT 3'

3' GTACATATACTCATTCATGA 5' 

 

L'enzyme de restriction coupe la séquence 5' GT/AC 3' : attention le sens de lecture est super important, il faut que tu lises bien GTAC dans le sens 5'-3'  ou CATG dans le sens 3'-5' ! Car c'est dans cette orientation que l'enzyme reconnaît la séquence et donc le site de coupure.

 

En regardant le couple de brin tu vois qu'il y a bien qu'un seul site de coupure :

 

5' CATGTATATGAGTAAGTACT 3'

3' GTACATATACTCATTCATGA 5' 

 

Celui ci (en vert) pourrait être juste mais non car GTAC se lit dans le sens 3'-5' et non dans le sens 5'-3' ! 

 

 

5' CATGTATATGAGTAAGTACT 3'

3' GTACATATACTCATTCATGA 5' 

 

Pour répondre à ton autre question, les enzymes de restriction coupent des séquences isoschizomères : donc par définition si tu trouves une séquence de coupure sur un brin, tu l'auras automatiquement sur l'autre. Donc tu peux rechercher les sites de coupure sur le brin matrice ou non matrice peu importe (cela t'évites à réécrire les 2 pour que tu gagnes du temps), mais il faut bien respecter le sens dans lequel tu lis la séquence ! les 5'-3' devant les enzymes ne sont pas là par hasard 🙂 

 

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