épissage alternatif

[loli]

salut, quelqu'un peut m'aider pour cet item de TD 6  de cette année? 

alors l'item C(vrai) me chiffonne!!  comment peut-on expliquer que l'épissage alternatif dans cette exo induit l'absence de protéine dans la moelle osseuse. évidemment j'ai posé la question en td et la répons était : court-circuitage de l'exon 1 ou 5 ?

je pensais que le premier exon et le dernier sont  intouchable car pas d'introns(sites d'épissage) de deux côté à la fois ??

merci et bonne journée 

[saraahh]

Salut ! c'est l'exon 1 qui porte l'AUG ! si tu l'enlèves tu n'as plus de protéines traduites, et si effectivement on peut l'enlever comme dans le cas présent par exemple, on peut aussi enlever le dernier d'ailleurs.

Bonne journée !

[loli]

coucou @saraahhje suis d'accord mais comment l'épissage alternatif peut l'enlever.  normalement " l'épissage alternatif n'induit en aucun cas l'absence d'expression de gène " mais on obtient des protéines de taille différentes justement étant donné que notre AUG reste en place dans tout les cas!! faut-il entendre par cet item l'absence de ce fragment 1100 dans la moelle osseuse mais on peut bel et bien obtenir des fragments d'une autre taille ??

[saraahh]

@lolinotre cours est hyper simplifié comparé à la réalité donc je sais pas le pourquoi du comment des mécanismes moléculaires mais ici en tout cas si tu as 1200pb dans la moelle osseuse c'est bien que tu as supprimé l'exon 1 donc t'as pas de produit vu que tu peux pas positionner ton amorce et toute façon ta traduction pourra pas démarrer ; et si tu as 1100pb dans le foie c'est que tu as supprimé l'exon 2, tout ça par épissage alternatif donc oui l'item C est vrai. Après je ne peux que te conseiller de te fier aux données et de les prendre pour suffisantes donc ici dans la moelle osseuse il faut faire comme si on n'avait que cette possibilité d'épissage alternatif. Y'a d'autres exos avec des western blot où tu as plus de données en général mais pour celui ci faut vraiment pas chercher loin!

[loli]

d'accord @saraahh je vois ce que tu veux dire. 

 on attends quand même l'avis de nos expertes en génomes pour lever mon doute  @alpanda et @Emmacarena

[alpanda]

Coucou @loli ! Désolée du retard, je suis d'accord avec @saraahh, avec ce prof on apprend pas les sites donneurs et accepteurs d'épissage donc tu ne peux pas mettre en application ce que tu as appris avec Mme Couderc ici 

 

Bonne journée !