Phi

[Romane18]

Bonjour, je n'arrive pas a comprendre comment on répond a ce type de qcm, si quelqu'un pouvais m'aider ca serait très gentil ! 

[Julyse]

Bonjour @Romane18 

 

Pour calculer le pHi de chaque peptide, je te mets la super explication d'un autre tuteur :

 

Bon courage  

[Romane18]

il y a 45 minutes, Julyse a dit :

Bonjour @Romane18 

 

Pour calculer le pHi de chaque peptide, je te mets la super explication d'un autre tuteur :

 

Bon courage  

Merci beaucoup, son explication est au top mais j'arrive quand même pas à l'appliquer, je comprends pas comment on sait dans quel ordre classer les aa et comment leur associé le pK? Il faut connaitre la charge de chaque aa ? 

Je suis désolé je comprends vraiment rien  

[Julyse]

Non, les valeurs des pK seront données dans l'énoncé, par contre il faut savoir quels groupes sont présents dans quel AA( par exemple, il faut savoir que la lysine possède un groupe epsilon-aminé ). 

 

Pour savoir quels pK utiliser :

1) Tu as toujours les groupes en alpha des extrémités Nter et Cter du peptide

2) Puis il faut que tu identifies les groupes acides ou basiques des radicaux des AA .

 

Pour le premier peptide par exemple: tu as le alpha carboxylique en Cter du peptide (acide) + le alpha-aminé (basique) en Nter du peptide + epsilon-aminé (basique) de la Lysine.

Ensuite on te donne les pK pour chaque groupe donc tu sais que pour le premier peptide, tu as 1 pK acide (carboxyle) à 2,1 puis tu as deux pK basiques (avec les amines) à 9,3 et 10,5. 

 

Donc grâce aux deux groupes basiques, tu as deux charges + et grâce au groupe acide, tu as 1 charge - .

Tu mets les charges (en noir dans l'explication) par ordre décroissant (+2 / +1 / 0 / -1) 

Ensuite entre les charges, tu mets les pK identifiés au dessus dans l'ordre croissant. 

Pour le premier peptide ça fait donc : +2 / 2,1 / +1 /  9,3 / 0 /  10,5 / -1

 

Est-ce que là tu y arrives ? 

 

[Romane18]

@Julyse Okkk je comprends mieux, merci beaucoup !

 

Juste dernière petite question pour être sûr, il faut donc apprendre pour chaque aa qu'elle liaison il a? mais après comment on sait si c'est epsilon, alpha, beta... ? et aussi on sait que c'est acide ou basique en fonction de si c'est supérieur ou inférieur a 7 ? 

[Julyse]

Pour les radicaux tu as: 

Arg -> guanidium 

Asp -> beta-carboxylique 

Glu -> gamma-carbonxylique 

Lys -> epsilon aminé

histidine -> imidazole 

tous les aa -> alpha aminé + alpha carboxylique 

 

C'est la position du groupe sur la chaine carbonée, alpha =C1, beta=C2 etc... 

 

Il y a 3 heures, Romane18 a dit :

acide ou basique en fonction de si c'est supérieur ou inférieur a 7

oui voilà 

[Romane18]

d'accord merciii bcppp @Julyse