Ilyatrogène Posted November 27, 2020 Share Posted November 27, 2020 Bonjour, je ne vois pas comment il faut s'y prendre pour répondre aux items C et D ? Qqun peut m'aider svp https://goopics.net/i/dW3mL https://goopics.net/i/NW3LP Quote Link to comment Share on other sites More sharing options...
Ancien du Bureau Solution Vaiana Posted November 27, 2020 Ancien du Bureau Solution Share Posted November 27, 2020 (edited) il y a 31 minutes, Ilyana31 a dit : Bonjour, je ne vois pas comment il faut s'y prendre pour répondre aux items C et D ? Qqun peut m'aider svp https://goopics.net/i/dW3mL https://goopics.net/i/NW3LP Salut, non en fait ignore ce que j'ai dit j'ai peur de te dire des conneries mdrrrr, j'suis pas sûre Je viens de relire le td deuspi, et en effet en 5' on cherche toujours la séquence codante SENS et en 3' on cherche toujours la "anti-sens" d'où le fait que la D est fausse, mais ça il me semble que la prof de TD nous en avait parlé , tu sais le procédé pour vérifier si les amorces peuvent être utilisés pour une séquence donnée Edited November 27, 2020 by rara31 Quote Link to comment Share on other sites More sharing options...
adrénalex Posted November 27, 2020 Share Posted November 27, 2020 Salut, Alors ces items sont fait pour voir si t'as compris comment les amorces s'hybrident sur l'ADN. Je prend ce schéma pour t'expliquer, sachant que les flèches noires sont les amorces. La première amorce (celle du bas) s'hybride sur la partie 3' du brin non sens de façon complémentaire et anti parallèle, donc cela veut dire qu'elle aura la même séquence que la partie 5' du brin codant (car les 2 brins sont complémentaire et anti-parallèles). On dit que la première amorce contient la séquence sens de la partie 5' de la séquence codante (la même) ou la séquence anti sens de la partie 3' de la séquence non codante (complémentaire et anti-parallèle). A l'inverse, la deuxième amorce (celle du haut) s'hybride sur la partie 3' du brin sens de façon complémentaire et anti parallèle donc elle contiendra la séquence sens de la partie 5' de la séquence non codante ou la séquence anti sens de la partie 3' de la séquence codante. Essai de t'aider du schéma pour comprendre mes explications, j'espère que c'est clair! N'hésite pas si t'as d'autres questions Quote Link to comment Share on other sites More sharing options...
Ilyatrogène Posted November 28, 2020 Author Share Posted November 28, 2020 @adrénalex d'accord merci mais en fait ce que je ne comprends pas c'est que je ne vois pas à quoi correspondent les amorces 1 et 2 car sur le schéma du bas je ne retrouve pas les mêmes enchaînements de bases et en plus ce schéma correspond à l'item A donc je ne vois pas à quoi on doit se référer pour dire que c'est la séquence sens ou anti-sens de telle ou telle séquence ? Est-ce qu'on doit lire l'amorce 2 dans l'autre sens de manière à ce qu'elle soit complémentaire à l'amorce 1 ? Mais ici on ne nous donne que les amorces donc on n'a aucune séquence de base auxquelles se référer.. Je ne sais pas si c'est compréhensible c'est vraiment flou pour moi Quote Link to comment Share on other sites More sharing options...
adrénalex Posted November 28, 2020 Share Posted November 28, 2020 (edited) Je ne comprend pas de quel schéma tu parles en disant le "schéma du bas" parce qu'il n'y a pas de schéma pour l'item A. Mais si tu parle du schéma pour l'item B, ça sert à rien de t'en servir pour les item C et D car ces items sont indépendants! Enfaite je crois que tu te prends trop la tête, les items C et D sont des items théoriques: les amorces 1 et 2 s'hybrident toujours de la même façon, l'amorce 1 sera toujours complémentaire et anti-parallèle à la séquence antisens et l'amorce 2 sera toujours complémentaire et antiparallèle à la séquence sens qu'elles devront amplifier. De ce fait l'amorce 1 contiendra toujours la séquence sens de la partie 5' de la séquence codante et l'amorce 2 contiendra toujours la séquence anti-sens de la partie 3' de la séquence codante. Les amorces 1 et 2 ne doivent pas être complémentaire l'une à l'autre puisque elles ne s'hybrident pas ensemble, elles s'hybrident à la séquence sens ou antisens (qu'on ne te donne pas ici). Je t'ai fais un schéma avec les données du QCM pour que tu comprennes comment les amorces s'hybrident et quel séquence du brin codant (brin sens) elles contiennent mais tu n'as pas besoin de faire tout ça pour répondre à ces items c'est pour te montrer. J'essai de t'expliquer du mieux que je peux, mais si c'est toujours pas clair hésite pas Edited November 28, 2020 by adrénalex Ilyatrogène 1 Quote Link to comment Share on other sites More sharing options...
Ilyatrogène Posted November 28, 2020 Author Share Posted November 28, 2020 @adrénalex d'accord merci je comprends beaucoup mieux ! juste ce que je ne comprends toujours pas (désolée..) c'est quels "indices" permettent de savoir que c'est parce qu'il y'a un ATG dans l'amorce 1 et un codon stop dans l'amorce 2 ? Quote Link to comment Share on other sites More sharing options...
SApaces Posted November 28, 2020 Share Posted November 28, 2020 Saluut ! Du coup je vais essayer de te réexpliquer autrement et avec un autre schéma ! En effet, tu as raison ! Pour la première amorce (amorce 1 en orange sur mon schéma), c'est bien parce qu'elle contient un ATG qu'on peut en déduire qu'elle est identique à la séquence codante au niveau du 5' (comme les schémas et les explications précédentes te le montrent). L'amorce 1 contient le ATG donc avant le ATG elle contient de la séquence non codante et après le ATG de la séquence codante. Pour la deuxième amorce (amorce 2 en verte), en revanche elle ne contient pas le codon stop, comme tu le vois ici, elle s'hybride sur le brin sens (codant) mais comme elle est complémentaire, sa séquence est identique au brin anti-sens. Sachant que dans notre énoncé, on veut amplifier la séquence codante, si la deuxième amorce contient le codon stop, on va amplifier l'ADN après le codon stop et donc cela ne sera pas la séquence codante. Sur le schéma, l'amorce verte serait en face du codon stop du brin du bas et cette configuration ne permet pas d'effectuer la réaction de PCR. Pour la deuxième amorce, si on sait que l'amorce 1 est celle complémentaire au brin anti-sens et qui a une séquence identique au brin sens, alors on peut en déduire que l'amorce 2 sera complémentaire au brin sens avec une séquence identique au brin anti-sens. Au final, on a l'amorce 1 qui contient la partie 5' de la séquence codante et l'amorce 2 qui contient la partie 5' de la séquence codante également. C'est très brouillon comme explication, désolé, c'est clair dans ma tête mais difficile à réexpliquer J'espère ne pas t'avoir plus embrouillé... En gros, ce qu'il fallait retenir de l'énoncé, c'est que l'objectif est d'amplifier la séquence CODANTE et donc il faut mettre les amorces au début la séquence codante sur chaque brin. Quote Link to comment Share on other sites More sharing options...
Ilyatrogène Posted December 2, 2020 Author Share Posted December 2, 2020 @SApaces très honnêtement je ne comprends pas vraiment mais tes explications sont très claire merci ! c'est juste moi qui ai du mal avec ça, c'est rien au pire si ça tombe au concours je répondrai pas Quote Link to comment Share on other sites More sharing options...
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