[ERRATA COLLE N°9 Génome]

[Bapson_The_Pea]

Salut tout le monde !!

 

Voici le post où vous pourrez discuter des remarques que vous avez pour la colle n°9 en Génome 

(N'oubliez pas de préciser de quel QCM/Item vous parlez)

 

La tutobise confinée  

[jugouaze]

Salut, merci pour cette dernière colle !

 

J'avais une petite question par rapport à l'item D que QCM 10 : dans l'énoncé on parle de la réplication de l'ADN et dans cet item on nous demande si on a pu oublier de mettre des ribonucléotides ou des hélicases dans les boites de culture. Je ne comprend pas pourquoi il est compté vrai. on ne devrait pas mettre des désoxyribonucléotides plutôt ?

 

Je fais peut-être un contre sens, est-ce que quelqu'un pourrait m'expliquer?

[Linou]

il y a 44 minutes, jugouaze a dit :

Je fais peut-être un contre sens, est-ce que quelqu'un pourrait m'expliquer?

Je pense que c'est pour l'amorce, pour pouvoir débuter la réplication ! 

[audreyfdn]

Bonjour @jugouaze et @Alpassino!

Alors ici nous étudions la réplication dans sa globalité. 

Pour que la réplication se fasse bien dans le milieu de culture, il nous faut :

• Des ribonucléotides pour la synthèse des amorces (qui sont faites en ARN)
• Des désoxyribonucléotides pour la synthèse des brins d'ADN
• Les enzymes nécessaires pour la réplication des procaryotes: c'est à dire une primase, l'ADNpol III, l'ADNpol I, l'ADN ligase, les hélicases(permettant l'ouverture de l'ADN) et les protéines permettant de garder l'ADN ouvert durant la réplication (SSB pour les procaryotes)

Si la réplication ne se fait pas dans un des milieux de cultures, c'est qu'un des éléments au dessus est peut être manquant.

La réponse d' @Alpassino était donc juste, il est nécessaire d'avoir des ribonucléotides pour la synthèse des amorces, si il n'y en a pas, la réplication ne peut pas se faire.

j'espère avoir répondu à la question, si ce n'est pas clair n'hésitez pas à me le dire  

 

 

[jugouaze]

il y a 10 minutes, audreyfdn a dit :

Des ribonucléotides pour la synthèse des amorces (qui sont faites en ARN)

 

Merci @audreyfdn et @Alpassino

 

En effet j'avais pas pris en compte les amorces et le fait que ce soit de l'ARN et non de l'ADN.

 

Encore merci

[valentine2002]

Bonjour !

Dans le QCM 9 item A la correction nous dit que le promoteur est le numéro 2 et je ne comprends pas comment on pourrait le savoir, est ce que quelqu'un pourrait m'expliquer svp?

Merci beaucoup!!

[Dewey]

Je crois que c'est le fait qu'on commence en 5'. 

 

 

Edited November 27, 2020 by Vomito

[audreyfdn]

Bonjour @valetinemartineauu!

Effectivement, @Vomitoa raison, la transcription d'un gène se fait toujours dans le sens 5'-> 3', le promoteur est donc situé dans la partie 5' du gène, nous pouvons voir que c'est la partie 2 qui est située en 5' du gène, donc c'est le promoteur. 

J'espère avoir répondu à ta question, si jamais n'hésite pas à me le dire  

[Loupiotte]

Coucou !

Déjà merci pour cette superbe colle, et ensuite j'ai un petit trou de mémoire : quelqu'un se rappellerait-t'il de ce qu'est un "épissage cryptique" ?!

Merci beaucoup ! :3

Ah j'ai trouvé, en fair c'était écrit dans la correction de la colle ^^ (désolé pour le dérangement)

 

Edited November 27, 2020 by Loup-garou
Réponse trouvée

[valentine2002]

Salut @audreyfdn !

Merci beaucoup pour ta réponse j'ai compris  !!!

[julieocvl]

Bonjour,

 

La question est peut etre bete mais je ne comprend pas ce que veut dire "élément IS"?

[ludocoutens]

Salut @julieocvl les éléments IS sont des éléments mobiles ou transposables ( transposons ) se sont des séquences d'ADN qui peuvent se déplacer d'un point à un autre du génome c'est marqué dans le cours si tu veux vérifier. 

[julieocvl]

il y a 8 minutes, ludo82 a dit :

Salut @julieocvl les éléments IS sont des éléments mobiles ou transposables ( transposons ) se sont des séquences d'ADN qui peuvent se déplacer d'un point à un autre du génome c'est marqué dans le cours si tu veux vérifier. 

Ah oui d'accord, les lettres IS ne me disaient rien mais oui maintenant je vais le rapprochement merci!

 

[audreyfdn]

Coucou à vous deux @julieocvl @ludo82!

 

je me permet de rajouter un petit détail que je pense important pour les éléments IS. Ce sont effectivement des éléments transposables, donc des transposons, mais qui codent uniquement pour des protéines permettant la transposition.

 

Il existe d'autres transposons qui sont plus complexes, et qui codent, en plus des protéines nécessaires à la transposition, d'autres protéines. 

Toutes ces infos sont sur la diapo 17 du cours de génome n°3 du Professeur Couderc. 

 

Bonne journée à vous 

[mojito]

Bonjour!

Sur un graphique représentant l'évolution du taux d'ARN lors de la RT-PCR (graphique du QCM13), on observe toujours une quantité d'ARNc?

Comme aux items suivant on nous parle d'ARNm je ne comprend pas la distinction

Edited November 28, 2020 by mojito_rouge

[passionrepassage]

salut, j'ai pas bien compris pourquoi le parent 2 est hétérozygote au QCM 11 de génome merci d'avance pour vos réponses

[Sans-Visage]

Salut salut!!

Pour la 13A -> cette figure montre la quantité d'ARNm dans les différentes cellules (pour la RT-PCR)

En TD on avait eu une question sur une RT-PCR aussi, qui disait "Cette figure montre une analyse de l'ADN de Mme. X" comptée faux, parce qu'on part de l'ARNm, donc c'est une analyse de l'ARNm.

Du coup, je comprends bien la nuance entre les deux, on analyse l'ARN mais on observe de l'ADN, mais du coup c'est un piège récurrent ? Parce que des synonymes il y en a beaucoup quoi.... 

Merci beaucoup pour la colle d'ailleurs! ♥

[adrénalice]

Il y a 3 heures, passionrepassage a dit :

salut, j'ai pas bien compris pourquoi le parent 2 est hétérozygote au QCM 11 de génome merci d'avance pour vos réponses

Je pense que c'est par rapport à la parenthèse (A ou T) : ça veut dire qu'il aura A sur un brin et T sur l'autre donc il est hétérozygote 

 

D'ailleurs est ce que on parle de "hétérozygote" si la séquence de nucléotide n'est pas la même sur les 2 brins mais si ça code quand même pour le même AA? 

 

 

il y a 37 minutes, DuTACKauTac a dit :

En TD on avait eu une question sur une RT-PCR aussi, qui disait "Cette figure montre une analyse de l'ADN de Mme. X" comptée faux, parce qu'on part de l'ARNm, donc c'est une analyse de l'ARNm.

Justement ils avaient dit que c'était ambigu et qu'il fallait rajouter "ADN génomique" : on analyse bien de l'ADN mais il est produit à partir de l'ARNm par la reverse transcriptase 

[audreyfdn]

Bonsoir à vous deux @passionrepassage et @jePASSparla, alors effectivement, l'individu 2 est hétérozygote car son nucléotide est soit A, soit T. 

 

Au niveau de la définition, un allèle est une version variable d'un même gène. Les allèles se différencient par des variations dans leurs séquences nucléotidiques, donc même si l'AA est le même, la séquence nucléotidique est différente, et donc on peut parler d'Hétérozygote.

J'espère vous avoir aidé, si jamais ce n'est pas le cas, n'hésitez pas à me le dire 

[adrénalice]

Pour moi c'est bon merci! @audreyfdn

[passionrepassage]

@audreyfdn oui oui impeccable merci !  

[Sans-Visage]

Il y a 10 heures, jePASSparla a dit :

Justement ils avaient dit que c'était ambigu et qu'il fallait rajouter "ADN génomique" : on analyse bien de l'ADN mais il est produit à partir de l'ARNm par la reverse transcriptase 

 

Ils avaient dit ça en TD tu veux dire ? J'ai pas souvenir que nous on nous l'ai dit 

[adrénalice]

il y a 27 minutes, DuTACKauTac a dit :

Ils avaient dit ça en TD tu veux dire ? J'ai pas souvenir que nous on nous l'ai dit 

 

Oui en tout cas dans mon groupe elle l'avait précisé 

Après c'est bizarre si ils l'ont pas dit pour tout le monde...

[Sans-Visage]

il y a 1 minute, jePASSparla a dit :

 

Oui en tout cas dans mon groupe elle l'avait précisé 

Après c'est bizarre si ils l'ont pas dit pour tout le monde...

 

Ils ont tendance à rentrer dans les détails seulement quand on leur pose des questions  D'un coté c'est logique, sinon le TD ferait 3h, mais c'est dommage si on rate des infos importantes...

[victoranduran]

Il y a 16 heures, mojito_rouge a dit :

Bonjour!

Sur un graphique représentant l'évolution du taux d'ARN lors de la RT-PCR (graphique du QCM13), on observe toujours une quantité d'ARNc?

Comme aux items suivant on nous parle d'ARNm je ne comprend pas la distinction

Salut ! Alors l'ADNc (et non pas l'ARNc) correspond à l'ARNm mais qui a été re-transformé en ADN avec une reverse transcriptase. Donc l'ADNc correspond à l'ADN complémentaire de l'ARNm. 

J'espère qui tu as bien compris la nuance,sinon aucun problème je peux te re-expliquer 

Il y a 13 heures, DuTACKauTac a dit :

En TD on avait eu une question sur une RT-PCR aussi, qui disait "Cette figure montre une analyse de l'ADN de Mme. X" comptée faux, parce qu'on part de l'ARNm, donc c'est une analyse de l'ARNm.

Alors en RT-PCR on n'analyse pas l'ADN (sous entendu génomique ou global) de Mme X mais plutôt son ARNm qui sera comme le nom de la technique le dit, retro transcrit, c'est a dire qu'on passe d'un ARNm à un ADNc grâce à une reverse transcriptase. Du coup effectivement dans les deux styles de PRC on étudie de l'ADN mais dans la PRC classique on étudie tout l'ADN génomique, alors que dans la RT-PCR on n'étudie seulement l'ARNm qui à été transformé en ADN pour une question de stabilité car l'ADN est bien plus stable que l'ARN.