pHi/pkr

[nell-de-poule]

Salut, en voulant m'avancer sur les cours de biomol de maraicher, j'ai vu que l'on parlait de "pkr" pour les acides aminés. Je ne sais pas ce que c'est. Est-ce que cela à un lien avec le pHi que l'on voyait à purpan?

Merci d'avance

[Lbh]

Salut

Le "pKr" c'est le "pK du Radical de l'Acide Aminé". Certains AA ont effectivement un radical qui est dit "polaire" donc avec une fonction qui pourra se charger + ou - selon le pH du milieu.

Tu as 2 types d'AA polaire, les chargés à pH physiologique & non chargés à pH physiologique (pH normal du corps pour qu'il fonctionne de manière optimale) :

Chargés : Lysine, Arginine, Histidine, Glutamate, Aspartate ont tous un radical avec une fonction + ou - (regarde leur formule)

Non chargés : Sérine, Thréonine, Tyrosine, Cystéine, Glutamine, Asparagine ont tous un radical neutre à pH physiologique mais si celui ci monte ou descend ils prendront une charge

Si le radical de l'AA est chargé négativement (ex : Glu & Asp) alors le pHi = (pKc+pKr)/2 où le pKc est le pK de la fonction acide carboxylique en alpha de ton AA. Dans ce cas ton pKr sera bas (acide)

Si le radical de l'AA est chargé positivement (ex : Lys, Arg, His) alors le pHi = (pKn+pKr)/2 où le pKn est le pK de la fonction amine en alpha de ton AA. Dans ce cas le pKr serait élevé (basique)

Dans les énoncés on te donnera les valeurs de pKc, pKn & pKr. Mais il faut connaitre la formule pour trouver le pHi & savoir quel est le bon pKr de l'AA (car ils peuvent t'en donner plusieurs pour t'embrouiller). Donc repère bien sur chaque AA polaire les fonctions & leur positionnement (sur le C alpha, Beta, gamma..)

Voila globalement ce qu'il faut savoir desus

Edited September 2, 2020 by Lbh

[nell-de-poule]

Coucou, ben merci beaucoup pour cette explication! c'est super sympa @Lbh 

[Lbh]

Tkt