qcm immuno

[carolineb]

Salut!

je ne comprends pas trop la correction de ces qcm : 

 

Révélation

 

QCM 9 à 11 :
Afin d’identifier de nouveaux marqueurs sériques du cancer, vous a analysez l’ensemble des protéines sécrétées (sécrétome) par une lignée cellulaire « C » dérivée d’un cancer du pancréas. Vous identifiez des polypeptides provenant d’une protéine de la famille des protéines membranaires Tat qui comprend plusieurs isoformes de tailles variables résultant d’un épissage alternatif.
Vous étudiez l’expression de Tat dans les cellules normales (N) du pancréas et dans la lignée C, grâce à un antisérum de lapin (AS) parfaitement caractérisé, spécifique de Tat, qui reconnaît toutes les formes et tous les fragments de Tat.
Vous utilisez également deux anticorps monoclonaux de souris, AC1 et AC2, dont la spécificité anti-Tat a été clairement établie.

 

QCM 9 :A partir des cellules N, vous réalisez un extrait protéique total contenant toutes les protéines cellulaires, dont on considérera dans la suite du problème qu’il ne contient aucune protéine du sécrétome. Vous analysez cet extrait en conditions non dénaturantes, par « dot blot ». L’intensité du marquage varie de 0 à 2. Vous analysez ensuite le même extrait, en conditions dénaturantes, par immunoempreinte après électrophorèse en PAGE-SDS

(« Western blot »). Vous analysez de même manière les protéines du sécrétome.

 

 

 

C. "La protéine de 85 kDa peut être issue de la dégradation de la protéine de 575 kDa et l’épitope reconnu par l’AC1 peut être un épitope conformationnel propre à la protéine de 575 kDa".--> VRAI

je comprends pas trop pourquoi l'item est vrai pcq si la protéine de 575kDa avait été clivée en un fragment de 85kDa, il aurait du apparaître dans la partie "sécrétome" non? 

 

Révélation

QCM 11 : Vous pensez que certaines formes (ou fragments) de Tat, spécifiquement présentes dans les cellules cancéreuses, pourraient constituer un marqueur diagnostique du cancer du pancréas. Vous pouvez rechercher ces formes (ou fragments) soit dans le sérum (protéines libérées par la tumeur), soit dans le tissu pancréatique, soit au niveau de cellules cancéreuses qui se sont détachées de la tumeur pancréatique et circulent dans le sang des patients (cellules cancéreuses circulantes).

La(les)quelle(s) de ces techniques vous semble(nt) adaptée(s) pour identifier les patients atteints de cancer du pancréas ?

 

B. "Vous pouvez doser la forme de 400 kDa dans le sérum, grâce à un ELISA sandwich réalisé avec l’AC1 et l’AC2." --> VRAI, l'AC2 reconnait la forme de 400kDa uniquement en conditions non dénaturantes c'est ça? du coup c'est pour ça qu'en Elisa sandwich l'Ac 2 peut être utilisé? 

 

un grand merci d'avance! 

[Ratus]

Coucou!

 

Il y a 6 heures, carolineb a dit :

C. "La protéine de 85 kDa peut être issue de la dégradation de la protéine de 575 kDa et l’épitope reconnu par l’AC1 peut être un épitope conformationnel propre à la protéine de 575 kDa".--> VRAI

je comprends pas trop pourquoi l'item est vrai pcq si la protéine de 575kDa avait été clivée en un fragment de 85kDa, il aurait du apparaître dans la partie "sécrétome" non? 

Non, parce que le sécrétome est ce qui est sécrété par la cellule et ce qui est clivé ET libéré (donc les protéines qui sont libérées dans des vésicules membranaires et la partie extracellulaire des protéines transmembranaires qui sont clivées à l'extérieur de la cellule). Or, une protéine peut très bien être clivée DANS la cellule et y rester, ne faisant pas partie du sécrétome. 

 

Il y a 6 heures, carolineb a dit :

B. "Vous pouvez doser la forme de 400 kDa dans le sérum, grâce à un ELISA sandwich réalisé avec l’AC1 et l’AC2." --> VRAI, l'AC2 reconnait la forme de 400kDa uniquement en conditions non dénaturantes c'est ça? du coup c'est pour ça qu'en Elisa sandwich l'Ac 2 peut être utilisé? 

C'est exactement ça!

 

J'espère que c'est plus clair!

[carolineb]

Il y a 14 heures, Ratus a dit :

Non, parce que le sécrétome est ce qui est sécrété par la cellule et ce qui est clivé ET libéré (donc les protéines qui sont libérées dans des vésicules membranaires et la partie extracellulaire des protéines transmembranaires qui sont clivées à l'extérieur de la cellule). Or, une protéine peut très bien être clivée DANS la cellule et y rester, ne faisant pas partie du sécrétome. 

 

ah oui merci! et aussi pour la suite de l'item"l’épitope reconnu par l’AC1 peut être un épitope conformationnel propre à la protéine de 575 kDa" parle de la protéine de 85kDa qui aurait pu apparaître si ça n'avait pas été dénaturant? je trouve ça bizarrement formulé parce qu'on n'est même pas sûrs que la protéine de 85kDa corresponde à la dégradation de la protéine de 575kDa si? 

[maech]

Dans cet item on veut dire que l'AC1 reconnait un épitope conformationnel qui sera ensuite détruit quand la protéine de 575 sera clivé en protéine de 85, ce qui explique qu'elle ne reconnaisse pas la protéines de 85. j'espère que c'est plus clair pour toi

 

[Ratus]

Il y a 4 heures, carolineb a dit :

ah oui merci! et aussi pour la suite de l'item"l’épitope reconnu par l’AC1 peut être un épitope conformationnel propre à la protéine de 575 kDa" parle de la protéine de 85kDa qui aurait pu apparaître si ça n'avait pas été dénaturant? je trouve ça bizarrement formulé parce qu'on n'est même pas sûrs que la protéine de 85kDa corresponde à la dégradation de la protéine de 575kDa si? 

maech a presque tout dit :

Il y a 1 heure, maech a dit :

Dans cet item on veut dire que l'AC1 reconnait un épitope conformationnel qui sera ensuite détruit quand la protéine de 575 sera clivé en protéine de 85, ce qui explique qu'elle ne reconnaisse pas la protéines de 85. j'espère que c'est plus clair pour toi

Juste une précision en plus : en effet on n'est pas sûr que ce soit ça, c'est pour ça que l'énoncé précise que ça "peut être" ça!

[carolineb]

@maech @Ratus ok merci beaucoup!

[Ratus]

De rien!