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partie 3 poly


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Bonjour, alors je suis désolée j'ai plein de questions, voici les items qui m'ont posé soucis, merci par avance !!!

 

l'action de la primes au cours de la réplication des procaryotes nécessite l'action d'une helicase ... (item compté vrai dans le poly, or la primase ce n'est pas pour les eucaryotes ?)

 

ensuite on dans un exercice comme info : longueur chromosome E.coli 4,6Mpb et le pas de la double hélice de 3,4nm. On cherche à prouver que le périmètre du chromosome est de 1,55 mm sachant que l'ARNm a une longueur de 2,56kb. j'ai cherche en faisant un produit en croix mais je n'arrive pas au résultat

 

https://zupimages.net/viewer.php?id=19/52/szur.jpg : je ne comprends pas comment on fait pour la A et B : la A est vraie 

https://zupimages.net/viewer.php?id=19/52/u8gk.jpg : je ne comprends pas pourquoi la D est vraie puisqu'on le retrouve dans le foie sur les PCR ?

 

_ énonce https://zupimages.net/viewer.php?id=19/52/845l.png

https://zupimages.net/viewer.php?id=19/52/i3b0.png : la E est fausse mais comment le savoir ? 

 

- énonce https://zupimages.net/viewer.php?id=19/52/vcms.png 

https://zupimages.net/viewer.php?id=19/52/xwal.png : la C est vraie mais je ne comprends pas pourquoi ce n'est pas la B car on obtient deux fragments non ? 

 

https://zupimages.net/viewer.php?id=19/52/q8s5.png

https://zupimages.net/viewer.php?id=19/52/3h9e.png

 

la je ne comprends pas comment on fait pour la C et D qui sont vraies

 

https://zupimages.net/viewer.php?id=19/52/jksi.png

https://zupimages.net/viewer.php?id=19/52/l90s.png 

la je ne comprends pas non plus car quand c'est muté ça devrait être coupé et on ne devrait pas retrouver 7,3kpb non ? 

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Coucouu

 

QCM1/ A VRAI/ B FAUX/ Il ne manque pas des données ? Genre sur un QCM précédent ou quoi

 

QCM 2/ D VRAI/ En effet, tu vois deux bandes : une de 360 kpb et une de 240 kpb. Or on te dit que l'exon 3 = 120 kpb et 360 - 120 = 240. Un épissage alternatif c'est lorsque tu as un exon qui va sauter ou non lors de la maturation de l'ARNm, ce qui permet de varier au maximum l'expression d'un gène.

 

QCM3/ E FAUX/ C'est l'amorce oligodT qui est marquée en 5' avec du P32, pas l'ADNc

 

QCM4/ C VRAI/ Tu vas observer ta séquence grace à une sonde radioactive qui va s'amorcer au hasard, donc comme tu coupes en deux elle va s'hybrider sur l'un ou l'autre des morceaux donc tu n'auras qu'une bande

 

Pour le reste je n'ai pas le temps là, j'y reviendrais si personne ne le fait avant

 

 

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Il y a 4 heures, Sakamain a dit :

Or on te dit que l'exon 3 = 120 kpb et 360 - 120 = 240. Un épissage alternatif c'est lorsque tu as un exon qui va sauter ou non lors de la maturation de l'ARNm, ce qui permet de varier au maximum l'expression d'un gène

mais si il saute on ne devrait pas le retrouver si ? 

 

Il y a 4 heures, Sakamain a dit :

Il ne manque pas des données ? Genre sur un QCM précédent ou quoi

non a part la sequence que j'ai mis dans un lien 

 

merci beaucoup en tout cas !

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  • Solution

Coucou @Léabricot!

pour le QCM 1 item A vrai / item B faux : en fait ce qcm est en rapport avec ceux d'avant, où on te parle de l'ADN de la PLA2 ! et dans le QCM d'avant on te dit qu'on veut isoler l'exon II grace aux bons oligodesoxynucléotides, or l'exon II il fait 159 pb donc à peu près 0,1 kpb (pour trouver ça j'ai fait 2422 - 2263) ! voilà pourquoi avec tes cycles de PCR tu trouves des fragments de 0,1 kpb

 

QCM 5 C et D vraies : 

item C : alors ici il faut t'aider des résultats de PCR mais aussi du schéma. en gros grace aux résultats de PCR, tu arrives à savoir la taille de tes fragments sur l'ADNc, donc ce que je te conseille c'est de les écrire. tu sais que

- exon I + exon II (sonde a + c) = 475 pb

- exon II (sonde b + c) = 275 pb

-> exon I = 475 - 275 = 200 pb

ensuite une fois que t'as bien calé ça, tu regarde la piste 3 qui te donne ce qu'on a obtenu avec les sondes a + c (soit exon I + exon II) et une digestion par EcoRI. tu te retrouves avec 2 fragments (un de 300 pb et un de 175 pb), ce qui signifie que tu n'as qu'un seul site EcoRI. après t'as 2 possibilités sur la position de ton site EcoRI

- 1e possibilité : on obtient (dans l'ordre, après coupure par EcoRI), le fragment de 175 pb PUIS le fragment de 300pb : ton site se situe donc dans l'exon I

- 2e possibilité : on obtient le fragment de 300pb PUIS le fragment de 175 pb, ton site se situe donc dans l'exon II 

comment savoir laquelle est la bonne ? c'est la que tu dois regarder le schéma de l'ADN génomique :

on te dit qu'on a coupé par EcoRI (donc dans ta tête tu penses aux 2 possibilités citées précédemment). MAIS quand tu regardes ton schéma, tu vois qu'au début, on ne voit qu'une partie de l'exon II (= la partie y !!!). alors si tu te visualise tes 2 possibilités, ça correspond à la 2e ! tu as coupé DANS L'EXON II, donc tu te retrouves avec seulement un bout de l'exon II. (si ça avait été la 1e possibilité, on aurait coupé dans l'exon I, donc on aurait eu un bout de l'exon I + LA TOTALITE de l'exon II !!)

et donc (ENFIN), si tu coupes dans l'exon 2, ça veut dire que la partie AVANT ton site de coupure fait 300pb, et celle APRES (= la partie y) fait 175pb.

 

item D : 

DE MANIERE GENERALE POUR TROUVER LA TAILLE D'UN INTRON : tu dois toujours comparer ce que tu obtiens en PCR (ou autre) avec de l'ADNc (issu de l'ARN donc SANS les introns) avec ce que tu obtiens pour de l'ADN génomique (AVEC les introns). 

ici, l'intron 1 suit directement l'exon I. donc tu regarde entre tes sondes a et c (puisqu'on a besoin de pouvoir comparer AVEC et sans l'intron, qui se situera donc entre l'exon I et l'exon II), t'as la taille sans l'intron (PCR de l'ADNc donc piste 1) et avec l'intron (PCR de l'ADN génomique donc piste 4), et la faut juste faire du calcul :

- on sait que : exon I + exon II SANS INTRON = 475 pb

- exon I + exon II AVEC INTRON = 1575 pb

DONC intron = 1575 - 475 = 1100 pb = 1,1 kpb.

 

ces items sont pas super compliqués mais on s'embrouille assez vite, voila pourquoi c'est important de bien se noter tout sur les schémas !!

 

QCM 6 : en northern blot on étudie l'ARN qui est simple brin, et les enzymes de restriction ne coupent que du double brin !!! (sauf si on a une enzyme de restriction spécifique pour couper du simple brin mais dans ce cas la ce sera dit dans l'énoncé). Donc on ne verra jamais de coupure sur le NB. 

 

j'espère que ça te va !

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@mathltr vraiment merci x 1000

en t'embêtant encore un peu est ce que tu pourrais m'aider pour ce calcul, merci encore ! 

ensuite on dans un exercice comme info : longueur chromosome E.coli 4,6Mpb et le pas de la double hélice de 3,4nm. On cherche à prouver que le périmètre du chromosome est de 1,55 mm sachant que l'ARNm a une longueur de 2,56kb. j'ai cherche en faisant un produit en croix mais je n'arrive pas au résulta

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Il y a 10 heures, Léabricot a dit :

@mathltr vraiment merci x 1000

en t'embêtant encore un peu est ce que tu pourrais m'aider pour ce calcul, merci encore ! 

ensuite on dans un exercice comme info : longueur chromosome E.coli 4,6Mpb et le pas de la double hélice de 3,4nm. On cherche à prouver que le périmètre du chromosome est de 1,55 mm sachant que l'ARNm a une longueur de 2,56kb. j'ai cherche en faisant un produit en croix mais je n'arrive pas au résulta

est ce que tu peux me dire quel qcm c'est stp ? 

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@mathltr

Bonjour je profite des questions posées concernant le QCM 2 / ITEM D (27 page 34 du poly de génome) 

Je ne comprends pas dans ce QCM pourquoi il est indiqué que dans le foie on retrouve un une bande à 140pb (exon 3) alors que dans l’énoncé il est dit que l’exon 3 contient 120pb ?

Car pour l’item E j’avais fait le calcul 4750 - 120 et trouve faux alors qu’en faisant 4750 - 140 on trouve bien la bonne réponse 

Merci d’avance !

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Le 04/01/2020 à 14:30, Invité ChFGN a dit :

@mathltr

Bonjour je profite des questions posées concernant le QCM 2 / ITEM D (27 page 34 du poly de génome) 

Je ne comprends pas dans ce QCM pourquoi il est indiqué que dans le foie on retrouve un une bande à 140pb (exon 3) alors que dans l’énoncé il est dit que l’exon 3 contient 120pb ?

Car pour l’item E j’avais fait le calcul 4750 - 120 et trouve faux alors qu’en faisant 4750 - 140 on trouve bien la bonne réponse 

Merci d’avance !

hello

dans les résultats de PCR tu as les couples des amorces genre on te dit que l'exon 3 a 120pb mais dans tes résultats de PCR le couple d'amorce comprend l'intron entre l'exon 3 et l'exon 4 ! du coup c'est pour ça que tu as une bande plus grande que l'exon dit dans l'énoncé 😉 

bon courage pour demain !!

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