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Séquençage selon la méthode Sanger


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Bonsoir, 

J'aurais 2 petites questions par rapport au cours de cet après-midi.

 

J'ai noté que pour déterminer l'ordre des nucléotides, il fallait tout d'abord mettre dans un seul et même tube l'ADN à analyser, une amorce, l'ADN polymérase, du dXTP et du ddATP, ddCTP, ddGTP, ddTTP ainsi que des sels et de l'eau.

 

Premièrement, on est bien d'accord que l'ADN polymérase ajoutée n'est pas forcément du taq polymérase (comme utilisée en PCR) car cette dernière est seulement utilisée pour ses propriétés thermiques permettant de créer de l'ADN à 72 degrés évitant que l'ADN double brin ne se reforme ?

 

Et dans un deuxième temps, dans les polys du TAT de l'an dernier, il est marqué que le séquençage doit se faire dans 4 tubes différents avec les 4 ddXTP séparés.

Alors est-ce que ça a changé entre temps car j'ai l'impression que Madame Couderc a bien précisé que le processus se faisait dans un seul tube avec des couleurs différentes selon les nucléotides synthétiques ?

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Guest Juju230632

Bonjour, 

 

La TAQ polymérase est utilisée notamment pour ses propriétés thermiques lors d'une PCR cependant lors d'un séquençage selon Sanger c'est une autre ADN polymérase qui va allonger l'amorce (Le Pr Couderc n'a pas précisé son nom et son type). Cependant, celle-ci sera maintenue par des ADN polymérases thermostables (stables à haute température) mais ce n'est pas à retenir. 

 

Le séquençage selon Sanger il y a 30 ans se faisait avec 4 tubes et 1 ddNTP différent dans chaque tube et après on réalisait une electrophorese pour distinguer les différentes tailles d’acides nucléiques obtenus tandis que le séquençage selon Sanger de nos jours de fait avec 1 seul tube et avec des couleurs différentes ajoutés au ddXTP (fluorescence) pour distinguer ensuite quels ddXTP c’est fixe en dernier (on réalise tjrs une elctrophorese mais du coup pas besoin de 4 tubes  


Bonne journée

Julie Tutrice Génome 

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