séquence inversée

[DrR]

salut !

-> comment on fais pour savoir si c'est une séquence inversée ?

-> est ce qu'on aurait pu prendre les six autres bases (as soulignées) ? et pourquoi on a pas pris un morceau de séquence plus long ?

Edited October 17, 2019 by Docteurmrb

[Meredith]

Hello  

ici on te parle d'une répétition inversée d'un motif de 6 bases donc déjà tu regardes l'élément de réponse qui est la séquence qui contient un facteur de transcription dans l'élut et tu regardes les bases qui différentent par rapport aux autres séquences nucléotidiques testées. 

Là tu vois que tu as 12 bases différentes et en les séparant en 2 (comme c'est fait en pointillées) vu qu'on te parle d'un motif de 6 bases , et en complétant le brin   complémentaire avec les bases correspondantes tu vois qu'il y une répétions de 6 bases en lisant de 5'---> 3'  (soulignée en violet)

c'est plus clair pour toi? 

 

[DrR]

Il y a 11 heures, Meredith a dit :

Hello  

ici on te parle d'une répétition inversée d'un motif de 6 bases donc déjà tu regardes l'élément de réponse qui est la séquence qui contient un facteur de transcription dans l'élut et tu regardes les bases qui différentent par rapport aux autres séquences nucléotidiques testées. 

Là tu vois que tu as 12 bases différentes et en les séparant en 2 (comme c'est fait en pointillées) vu qu'on te parle d'un motif de 6 bases , et en complétant le brin   complémentaire avec les bases correspondantes tu vois qu'il y une répétions de 6 bases en lisant de 5'---> 3'  (soulignée en violet)

c'est plus clair pour toi? 

 

Salut ,merci pour ta réponse,   mais justement dans les 12 bases prises elles sont quasi toute comme les autres séquences d'eluat..

[Meredith]

Comme tu le dis elles sont quasi toutes identiques mais pas exactement pareil  si tu élimines toutes les bases identiques entre les 4 séquences tu vois qu'il te reste un motif à 12 bases qui varie entre ces séquences d'éluat 

[Moumou]

@Docteurmrb

 

Alors, pour reconnaitre une séquence inversé c'est "simple". Dans le cas de 12 bases tu vas avoir 6 bases qui se répètent mais au lieu de se répéter dans le même sens et dans le ordre (répétition directe) c'est le "complémentaire" des 6 bases de droite qu'on va retrouver à gauche mais comme un miroir. En vrai c'est assez difficile à expliquer mais avec des exemples c'est plus simple de comprendre.

Par exemple ta séquence est une répétition inversée parce que tu as : tatccc I gggata (tu vois c'est le complémentaire mais dans le sens inverse). Si c'était une répétition directe ru aurais eu : tatccc I tatccc.

Je sais pas si tu visualises ...

Je t'ai mis un exemple du cours aussi : 

 

Ensuite, en ce qui concerne ta deuxième question tu vois que les 6 bases du début et les 6 bases de la fin ne changent pas en fonction de ta séquence et surtout elles ne se "répètent" pas entre elle (on a ni de répétition inversée, ni de répétition directe). 

Ça veut dire que ces bases ne font pas partie de la séquence de reconnaissance. Ce sont uniquement les 12 bases du centre qui nous intéressent. Et ensuite, tu vois que si on change ne serait-ce qu'une base de la séquence, le facteur de transcription ne se lie plus à l'ADN parce qu'en plus de ça, les 3 séquences (sous la séquence liant le facteur de transcription dans le neurone) ne sont même plus des séquences répétitives. Je ne sais pas si c'est clair. En tout cas, si jamais c'est compliqué là, tu peux venir en perm le mardi entre 12h et 13h30. On t'expliquera probablement mieux, ce sera plus simple.