cutieheartx Posted September 29, 2019 Share Posted September 29, 2019 Saluuut, J'aimerais connaitre le raisonnement pour savoir si un peptide peut-être la partie N-terminale (et pourquoi pas la partie C-terminale) ou non d'une protéine ? Par ex., le peptide : M-K-F-I-S-V-Y-L-E-G -> comment je sais si il peut être la partie N-terminale d'une protéine ? Merci d'avance Quote Link to comment Share on other sites More sharing options...
Ancien Responsable Matière ValentineMartel Posted September 29, 2019 Ancien Responsable Matière Share Posted September 29, 2019 Salut, Normalement tu peux utiliser des composés qui vont agir sur une partie de la protéine de façon préférentielle. Pour déterminer les extrémités N-terminale, tu peux utiliser deux composés : - Le Phénylisothiocyanate (PITC ou méthode d’Edman) va se complexer avec l’acide aminé N-terminal. En présence d’un acide faible, la réactivité du PITC va s’adresser à l’extrémité N-terminale et à la fonction carboxyle de cet acide aminé. On obtient un dérivé phényl-thiohydantoïne (c'est pas à savoir le nom exact tqt) de l’acide aminé N-terminal (PTH) et le reste du peptide intact. Le PTH est facile à repérer en chromatographie. Cette méthode permet une détermination séquentielle complète au cours du temps (analyse de l’importance quantitative des dérivés PTH au cours du temps). En gros dans l'énoncé on va te dire "En présence de PITC, on obtient des concentrations décroissantes d'alanine, de glycine et d'acide aspartique par exemple, ça veut dire que le début de ton peptide c'est A-G-D. - Le Di-Nitro-Fluoro-Benzène (DNFB) réagit avec les extrémités aminoterminales pour donner un dérivé, le dinitrophényl, de cet acide aminé N-terminal. On fait ensuite une hydrolyse acide qui va rompre toutes les liaisons peptidiques et respecter la liaison entre le DNP et l’acide aminé. Le dérivé DNP-AA est coloré (jaune orangé) et repérable sur une électrophorèse. Ca te permet uniquement de savoir le premier AA ça par contre, donc c'est "moins bien" que le PITC. Voilà, j'espère que ca a bien répondu à ta question Quote Link to comment Share on other sites More sharing options...
cutieheartx Posted September 29, 2019 Author Share Posted September 29, 2019 Salut @ValentineMartel, merci pour ta réponse détaillée ! Mais si je suis dans le cas où j'ai aucune info sur les composés utilisés sur ma protéine ? Je te donne l'exemple du QCM (item B) qui me pose problème : Quote Link to comment Share on other sites More sharing options...
Ancien Responsable Matière Solution ValentineMartel Posted September 29, 2019 Ancien Responsable Matière Solution Share Posted September 29, 2019 Aaah c’est pas le même problème ! En fait l’item est vrai parce que le premier AA c’est une methionine, et comme tu le sais (ou tu le sauras en genome), le codon initiateur c’est AUG ce qui te donne une methionine. Par conséquent, toutes les protéines directement à l’issue de la traduction commencent par une méthionine ! (après tu peux avoir des phénomènes de proteolyse qui vont couper cette methionine par exemple) Quote Link to comment Share on other sites More sharing options...
cutieheartx Posted September 29, 2019 Author Share Posted September 29, 2019 Ahh d'accord t'as répondu à ma question, merciii beaucoup @ValentineMartel j'ai compris Quote Link to comment Share on other sites More sharing options...
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