Glouglou Posted September 22, 2019 Posted September 22, 2019 bonsoir, j'ai un pb avec la notion de Tandem, je sais que c'est la répétition d'une séquence... mais si j'ai un ADN composé de 3 tandems, est ce que ça peut être par exemple, (dans le cas où c'est un seul nct qui se répète): - AAAAAAAGATTTTTTTTCACCCCCCCC ? - ou est ce que c'est une répétition du type AAAAAAAAGGAAAAAAAAGCAAAAAAAA ? j'espère que ma question n'est pas trop brouillon... merci Quote
Solution Sakamain Posted September 22, 2019 Solution Posted September 22, 2019 (edited) Coucou ! Alors j'ai pas mon cours sous la main mais en regardant différentes publications scientifiques (https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00333225/document ; http://www.edu.upmc.fr/sdv/masselot_05001/polymorphisme/microsatellites.html ), on peut conclure que : Un tandem est la répétition d'une séquence (le plus souvent un motif court) sur une "longueur" plus ou moins importante Tu as deux type de tandems : des séquences courtes répétées de dinucléotides Par exemple : CGC GCG CGC G des grands blocs de répétitions en tandem (ADN satellite), comme les centromères, les télomères... Par exemple : ATC ATC ATC ATC ATC Un petit schéma pr illustrer l'exemple de l'ADN satellite : Reveal hidden contents Si ça t'intéresse, la définition complète donnée dans le premier article : Reveal hidden contents Une répétition en tandem est une succession de motifs d’ADN répétés les uns derrière les autres, par opposition aux répétitions dispersées dont les unités répétées sont éparpillées dans le génome (comme décrit au paragraphe 1.1.2.1). Les différentes unités formant la répétition en tandem ne sont pas nécessairement identiques entre elles : le degré de conservation au sein d’une répétition en tandem est très variable. Les répétitions en tandem ont été en premier lieu étudiées chez les mammifères, où trois catégories ont été distinguées : les satellites, les minisatellites, et les microsatellites. Cette distinction correspond à différentes plages de taille (pour la longueur totale) et a été faite de façon plus ou moins arbitraire : l’ADN « satellite » a tout d’abord été observé et isolé par centrifugation sur gradient de densité, où il constituait une fraction particulière (dite « satellite ») (Britten 1968 ; Meneveri 1984). Ensuite, des répétitions en tandem de taille inférieure, pouvant être analysées grâce à la technique de Southern Blot, ont été caractérisées (Wyman 1980) puis appelées « minisatellites » (Jeffreys 1985a). Enfin, les répétitions en tandem de taille encore inférieure ont été nommées « microsatellites » lorsque l’avènement de la technique de PCR (« polymerase chain reaction ») en a fait des outils courants de génétique moléculaire. Avec le recul, les études menées, principalement chez les eucaryotes, sur les mécanismes de création et de mutation de ces structures souvent polymorphes laissent penser que cette distinction recouvre une réalité biologique, comme nous le verrons dans les paragraphes suivants. Les répétitions en tandem sont présentes, dans des proportions variables, chez tous les organismes : eucaryotes, procaryotes, et même virus. Dans ces deux derniers groupes, les mécanismes sous-jacents n’ont quasiment pas été étudiés, et la distinction entre microsatellites et minisatellites est rarement faite. D’autres termes sont couramment employés, chez les procaryotes, mais également parfois chez les eucaryotes, pour désigner les répétitions en tandem : les SSR (« simple sequence repeat ») et STR (« short tandem repeat ») désignent des répétitions en tandem « simples » : elles correspondent aux microsatellites et aux minisatellites de petite taille (quelques centaines de paires de bases). Les VNTR (« variable number of tandem repeats ») désignent les répétitions en tandem polymorphes, qui peuvent appartenir à la classe des microsatellites ou des minisatellites. Ca répond à ta question ? Edited September 22, 2019 by Sakamain Quote
Glouglou Posted September 22, 2019 Author Posted September 22, 2019 @Sakamain Merci bp pour les images et tout et tout Juste pour vérifier si j'ai bien compris: quand je prends l'ARNm, il est composé de tandems; 18S, 5,8S et tout.... les séquences constituants 18S, 5,8S et 28S peuvent être différentes: elles n'ont pas le même motif de répétition de nucléotides les unes par rapport aux autres c'est ça? j'ai donc "3 séquences de tandem différentes"......? Merci Quote
Sakamain Posted September 22, 2019 Posted September 22, 2019 Oui c'est ça ! Comme l'ADN est polymorphe tu as des possibilités infinies de combinaisons/ d’enchaînements Quote
Glouglou Posted September 22, 2019 Author Posted September 22, 2019 On 9/22/2019 at 7:45 PM, Sakamain said: Comme l'ADN est polymorphe tu as des possibilités infinies de combinaisons/ d’enchaînements Expand Et est ce que c'est possible qu'elles aient la même séquence mais qui auront des tailles différentes (genre celle de 5,8<28...)? Quote
Sakamain Posted September 22, 2019 Posted September 22, 2019 Hum je comprend pas trop ta question En gros est ce que c'est possible que par exemple la seq ATT sois répétée 23 fois qqpart et 13 fois autre part par exemple ? Si oui, oui je suppose que ça doit être possible, comme je te l'ai dit tu as une possibilité infinie de combinaison et on a pas fini de les explorer Quote
Glouglou Posted September 22, 2019 Author Posted September 22, 2019 On 9/22/2019 at 7:54 PM, Sakamain said: En gros est ce que c'est possible que par exemple la seq ATT sois répétée 23 fois qqpart et 13 fois autre part par exemple ? Si oui, oui je suppose que ça doit être possible, comme je te l'ai dit tu as une possibilité infinie de combinaison et on a pas fini de les explorer Expand D acc ok merci bp bp bp Quote
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