Amorces

[COOH]

Bonjour! Quand la prof nous met ce genre d'exercice, l'amorce de droite (la rouge) se fixe toujours sur le brin du bas et la gauche (la verte) toujours sur le brin du haut?

Merci

[Flantier]

Salut ! Pour qu'une amorce se fixe il faut qu'elle soit complémentaire au brin matrice. Pour cela il faut que l'amorce soit inversé par rapport au brin matrice : 5' --> 3' avec en face 3'<--5 comme sur le schéma. Peu importe le haut et le bas, il faut juste que ça soit complémentaire  

 

J'ai repondu à ta question ? 

 

 

[COOH]

D'accord je vois!

 

Et par contre il faut que les deux amorces soit sur un brin différents ?

 

Et dans ce genre de QCMS ce qu'elle propose pour la première amorce se trouve à gauche du // et pour la deuxième amorce à droite du //?

[Roux-carnage]

Alors oui dans le cadre de la PCR où on veut amplifier une séquence d'ADN double brin, il va nous falloir 2 amorces: une amorce pour chaque brin. Il faut évidemment que chaque amorce soit complémentaire et anti-parallèle au brin concerné. Mais attention, le sens des amorces est ultra important, il faut vérifier l'orientation des amorces: c'est le 5'-3' qui va te donner l'orientation de l'amorce (cf diapo de la prof). 

Et oui, comme tu l'as dit, il faut une amorce d'un côté du //, et une amorce de l'autre

 

Je vais te faire un exemple:

                                                                                <------ 3' CAATGCTT 5'

5' AGCTCGCTACGTACGTACCCGGATACGGTACGTACGTTACGAACTG 3'

3' TCGAGCGATGCATGCATGGGCCTATGCCATGCATGCAATGCTTGAC 5'

        5' TCGCTACG 3' ------->

 

=> donc ici tu vois bien qu'on a une amorce pour chaque brin. Chaque amorce est complémentaire et anti-parallèle à son brin

=> les 2 amorces se "croisent" (----> <-----)

 

Voila, j'espère t'avoir un peu éclairci sur le sujet

Cdlt

[COOH]

Super merci beaucoup!