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Calcul de pHi


Lu97
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Salut, alors le pHi correspond a la forme zwiterionique (charge nul). Enfaite dans ta molécule tu regardes tes AA et tes groupements ionisables --> tous tes AA possèdent le groupement alpha NH2 et alphaCOOH sauf l'acide glutamique (qui poosède en plus le groupement gamma carboxyl). Donc le pHi du peptide correspond a celui de l'acide glutamique.

Or d'après tes connaissance de folies tu sais que le pH de E est très bas donc inférieur a 6.75 

Donc c'est faux --> tu peux me confirmer (pr voir si jai pas fais d'erreur ahah)

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  • Ancien Responsable Matière
  • Solution

Salut @Lu97

 

Je t'ai fais l'item sur du papier pour que tu comprennes, essaie de suivre avec mes explications ?

 

Pour calculer le pHi du peptide tu vas analyser tous les AA qui composent le peptide :

 

Tu vas utiliser le ⍺ NH2terminal du peptide qui se trouve sur C (en rose)

Tu vas utiliser le ⍺ COOHterminal du peptide qui se trouve sur E (en orange)

Et après tu essaies de voir dans ton peptide quel AA pourrait avoir une particularité 

A G L I S (en bleu) rien de fou, ils comportent des C, H, O donc rien qui va faire varier avec le pH 

Mais tu sais que E à un γ COOH

 

Tu vas donc aussi utiliser le γ COOH de E pour calculer ton pHi (aussi en orange)

 

De la tu fais ton tableau avec la variation du pH (à gauche pH très bas, à droite pH élevé)

Variation des signes de NH2 et COOH

Quand tu trouves un équilibre = 0, tu prends les 2 pkA qui entoure ce 0 et tu calcules ton pHi 

 

pHi = (pKa + pKb)/2 

 

Bon là sur ce peptide tu avais juste E qui pouvait faire varier le pHi (sinon pHi +/- 5,7) 

Donc par déduction tu sais que le pHi ne sera pas de 6,75 mais sera bien acide, dans les 3 (avec E) : pas besoin de faire toute cette méthode 

Mais tu aurais pu avoir 3 AA qui auraient faire varier ton pKi (R avec le groupement guanidium, K avec le ε NH2 et D avec le β COOH) par exemple, et là cette méthode est nécessaire

 

 

 

 

 

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