extraction protéines MP

[zizou-]

salut, je ne comprend pas bien un point du cours sur la MP : dans le III- B extraction des protéines pour les protéines transmembranaires, il est écrit que si l'on veut extraire des protéines chargées négativement il faut utiliser un détergent ex SDS chargé négativement. Je ne comprend pas pq il ne faudrait pas plutôt utiliser un détergent positif pour que les charges s'attirent... 

Merci d'avance  

[ValentineMartel]

Bonjour ! 

 

Alors en fait tu n'extrais pas des protéines chargées négativement. Tu vas utiliser du SDS, qui lui est un solvant chargé négativement, pour extraire des protéines transmembranaires (peu importe si elles sont chargées ou pas). Et en fait, ce détergent est tellement puissant qu'en plus de dénaturer ta protéine (donc lui faire perdre sa structure secondaire), il va la recouvrir de charges négatives. C'est pour ça qu'elles seront par la suite chargées négativement !  

[cvh2813a]

il y a 32 minutes, ValentineMartel a dit :

 (donc lui faire perdre sa structure secondaire)

Salut, je suis d'accord avec toi ValentineMartel le SDS va chargé négativement les proteines mais ATTENTION le SDS va rompre les liaisons hydrophobes d'une proteine qui serait composée de sous unités (comme on peut le voir sur certains qcm de biomol). Il respecte donc la structure terciaire des proteines et en aucun cas il ne lui fais perdre sa structure terciaire. 

Voila sur ce bonne soirée

[ValentineMartel]

Pourtant à mon sens @cvh2813a, la dénaturation d'un protéine passe par la "rupture" de toutes les liaisons faibles. Donc à part la présence de ponts disulfures ou tout autre liaison covalente au sein de la protéine, elle va perdre sa structure tridimensionnelle  

[ValentineMartel]

@Dine mais structure secondaire c'est pas hélices alpha par exemple ? parce que cette structure est stabilisée par des liaisons hydrogènes si je me trompe pas 

[Dine]

@ValentineMartel j'ai enlevé mon message ahah, parce que je suis pas totalement sure, mais oui structure secondaire c'est helice alpha, feuillets béta etc

Edited September 26, 2018 by Dine

[ValentineMartel]

En fait c'est vraiment parce que la prof de biocell a dit ajd qu'avec la dénaturation on obtenait la structure primaire de la protéine, c'est à dire l'enchaînement peptique déplié (elle a pas précisé ponts disulfures etc) 

[Ayrann]

Salut ! 

je suis daccord avec @ValentineMartel quand on dit qu'une protéine est dénaturée c'est qu'elle perd sa structure tridimensionnelle (et effectivement la prof la dit en cours aujourd'hui) et donc sa structure secondaire 

[zizou-]

Merci bcp pour vos réponses, c'est bien plus clair !!