Larousse Posted December 29, 2017 Posted December 29, 2017 Salut salut la compagnie ! J'ai un problème avec le CC 2017 de Génome, le qcm 2, item C. Malgré la correction, je ne comprend pas pourquoi le site BtsC1 est éliminé lors de la coupure Pour moi, si on part de EcoR1, que l'on coupe jusqu'à la rencontre de HIND III, on se retrouve sans BamH1 ni BtsC1, or, ici c'est le cas et je ne comprend donc pas... Quote
Solution EmmaJu Posted December 29, 2017 Solution Posted December 29, 2017 Salut, L'ordre dans le MCS est le suivant BamHI SmaI EcoRI BtsCI HindIII. La correspondance en bases est la suivante : 5' GGATCCCCCGGGGAATTCCGGATGNNAAGCTT 3' On digére par EcoRI et HindIII, donc les coupures sont les suivantes : 5' GGATCCCCCGGGGA↓ATTCCGGATGNNA↓AGCTT 3' Le bout souligné est celui éliminé et tu peux voir qu'il correspond à une partie de EcoRI, le site BtsCI et une partie de HindIII. En sachant que sur le complémentaire de ce brin les coupures au niveau de EcoRI et HindIII serviront pour l'insertion donc ces sites sont conservés. J'espère que c'est un peu plus clair pour toi, n'hésite pas à redemander si ça reste flou! Bonne journée Quote
Larousse Posted December 29, 2017 Author Posted December 29, 2017 Merci beaucoup EmmaJu, je comprend mieux ! C'était l'ordre dans le MCS qui n'allait pas, comment as-tu trouvé le tien ? Quote
Ouistiti Posted December 29, 2017 Posted December 29, 2017 Coucou ! Tu as l'ordre de tes sites de restriction donné dans ton énoncé de QCM. Tu as 5'GGATGNNNNNNNNN3' et ensuite tu positionnes les sites de restriction donnés dans les items Les enzymes couperont ensuite aux sites indiqués, tu pourras voir ou coupe FokI. Est-ce plus clair ? Quote
Larousse Posted December 29, 2017 Author Posted December 29, 2017 Coucou Clémence ! En effet, je viens juste de remarquer que l'ordre qu'il fallait prendre était celui de l'item, j'avais pas compris l'item dans le bon sens, autant pour moi ! Merci beaucoup à vous deux, j'ai tout compris maintenant ! Quote
mariepoulhier Posted January 7, 2018 Posted January 7, 2018 Salut, J'ai pas compris la technique pour réussir l'exercice? Enfin, quand on écrit le brin avec les sites de restrictions donnés dans l'item, puis on coupe avec les deux sites de restrictions proposés, donc on se retrouve avec un fragment. Et à partir de là je ne sais pas ce qu'on cherche? Une compatibilité avec Fok1? Merci Quote
mariepoulhier Posted January 7, 2018 Posted January 7, 2018 Salut, J'ai pas compris la technique pour réussir l'exercice? Enfin, quand on écrit le brin avec les sites de restrictions donnés dans l'item, puis on coupe avec les deux sites de restrictions proposés, donc on se retrouve avec un fragment. Et à partir de là je ne sais pas ce qu'on cherche? Une compatibilité avec Fok1? Merci En fait j'ai finalement trouvé! Quote
Ouistiti Posted January 7, 2018 Posted January 7, 2018 C'est bon tu as compris ? Ou tu veux que je te réexplique ? Bon courage en tout cas Quote
Provencal_le_gaulois Posted January 8, 2019 Posted January 8, 2019 Bonsoir ! Je suis dans une légère impasse pour la résolution de ce QCM, je pense avoir trouvé la méthode mais j'avoue que je ne serais pas contre un légère explication pour me confirmer mon raisonnement ^^ Pourriez-vous m'aider s'il vous plait ? Quote
Larousse Posted January 8, 2019 Author Posted January 8, 2019 (edited) Salut Amandie3695 ! Je vais essayer de t'expliquer mais je ne garantis pas du tout mes talents d'explication n'hésites surtout pas à redemander si tu comprends pas quelque chose Alors, tu as FokI qui a pour site de restriction : 5' - GGATG(N)9 ... 3' - CCTAC(N)13 ... Il coupe donc 9 bases après le "GGATG" sur le brin sens et 13 bases après "CCTAC" sur le brin non sens. Or, on peut remarquer que ce site de restriction se retrouve sur celui de BtsCI, donc pour que FokI puisse couper, il faut qu'il y ait ce site de restriction de BtsCI présent. On sait aussi qu'après insertion de ton clone par les deux enzymes proposées, FokI ne doit pas couper dans le plasmide mais dans ce clone. Donc en clair, petite méthode : Tu regardes par qui tu coupes pour insérer ton clone (à l'item C : EcoRI - HindIII) Tu prends tes enzymes dans l'ordre dans lequel elles te sont proposées et tu coupes entre tes deux enzymes pour y mettre ton clone. Ici on a : BamHI - SmaI - EcoRI - BtsCI - HindIII puis on coupe et on met le clone, ce qui nous donne : BamHI - SmaI - EcoRI - CLONE - HindIII Tu vérifies que FokI puisse bien couper dans le clone. Pour ça il faut remplir des conditions : il doit y avoir le site de restriction BtsCI présent le site ne doit pas être trop éloigné de manière à ce que, quand FokI coupe (après 9 et 13 bases), cette coupure soit situé dans le clone et non dans le plasmide. En gros s'il n'y a qu'une enzyme qui sépare BtsCI et le clone t'auras : "GGATGNN - bases qui restent après coupure de ton enzyme (donc moins de 9 bases) - CLONE" sur le brin sens (de même sur le brin non sens). Du coup FokI pourra couper dans le clone mais plusieurs enzymes l'obligera à couper dans le plasmide et c'est pas ce qu'on veut Conclusion pour l'item C : lorsqu'on a coupé avec EcoRI et HindIII on a perdu BstCI qui nous est indispensable pour mettre en action FokI : l'item est faux par perte du site de restriction. J'espère t'avoir un peu éclairée sur le sujet, n'hésites pas si une chose n'est pas claire Et puis bon courage Edited January 8, 2019 by Larousse Quote
Provencal_le_gaulois Posted January 8, 2019 Posted January 8, 2019 Salut @Larousse ! C'est super ! Merci beaucoup ! Je pense que j'ai finalement bien compris ! Merci pour ton explication, je te rassure c'était clair ^^ Bonne soirée ! Quote
Larousse Posted January 8, 2019 Author Posted January 8, 2019 Chouette Passes une bonne soirée ! Quote
Leïlaa Posted January 12, 2019 Posted January 12, 2019 Bonjour, je relance le sujet parce que moi je comprends pas pourquoi la D est fausse... J'ai bien compris les autres mais là même si le site Fok1 est situé entre les sites de clonage HindIII et BamH1 il coupe dans le fragment de cloné non ? Merci de votre aide !! ^^ Quote
Larousse Posted January 12, 2019 Author Posted January 12, 2019 Coucou @Leïlaa A chaque fois que tu coupes par deux enzymes, tu perds tout ce qu'il y a eu milieu. Ici tu as : HindIII - BtsCI - SmaI - EcoRI - BamHI Quand tu coupes par HindIII et BamHI, tu te retrouves avec : Hind III - place pour le clone - BamHI Tu as donc perdu la séquence dont FokI a besoin impérativement pour pouvoir couper (la séquence de BtsCI), donc ton item est faux ^^ Quote
Guest Bounty Posted December 29, 2019 Posted December 29, 2019 Bonjour, quel est le fragment qu’on insert et cb de bases fait il ? dans la correction y’a 15 petites croix, à quoi correspondent elles? Merci beaucoup Pour le reste j’ai bien compris Quote
Guest Bounty Posted December 29, 2019 Posted December 29, 2019 En fait j’ai du mal à voir à cb de base est BTSCI est par rapport a la ou on coupe Quote
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