carla31 Posted October 21, 2017 Posted October 21, 2017 Salut ! Est ce que quelqu'un pourrait m'expliquer le qcm 6 du concours 2017, je ne comprends pas pourquoi C est vrai, j'aurai plutôt pensé que c'était B... Pareil pour D, je vois pas pourquoi c'est faux merci d'avance
Ouistiti Posted October 21, 2017 Posted October 21, 2017 Hello ! Pour le B et C je t'avoue que je ne vois plus trop ... Je cherche encore :/ Par contre, pour la D, c'est tout simplement parce que la transferase terminale ajoute des nucléotides en 3' et non en 5'. En fait si tu t'es trompé à la B, c'est normal que tu mettes la D vrai aussi puisque du coup tu es en 3'. Mais comme c'est le C qui est juste, tu as le T ajouté en 5' donc la transferase ne peut pas le faire ^^ Voilà pour une réponse très partielle !
malika Posted October 21, 2017 Posted October 21, 2017 Salut, Est ce que tu saurais pourquoi la E du même qcm est fausse??
Ouistiti Posted October 21, 2017 Posted October 21, 2017 Je ne suis pas sûre, attends que quelqu'un confirme mais je crois que comme ton ADN amplifié par PCR est "symétrique", c'est-à-dire qu'en gros tu peux le retourner et tu as la même chose, tu ne peux pas savoir avant dans quel sens il va s'insérer ! En espérant vous avoir aidés un peu ^^
carla31 Posted October 22, 2017 Author Posted October 22, 2017 D'accord merci pour ta réponse ! Mais ça me parait toujours bizarre que ce soit la C qui est correcte parce que même en faisant des recherches sur internet sur ce type de clonage, il est dit que le T est mis en 3' du plasmide... Voilà un lien que j'ai trouvé http://ol.saulnier.free.fr/espace_travail/clonage.html
VM-Varga Posted October 22, 2017 Posted October 22, 2017 Effectivement c'est bizarre... Même sur le lien que tu as fourni, l'extrémité 3' sortante s'hybride bien avec une extrémité 3' sortante, c'est logique, d'ailleurs c'est ce que l'on retrouve dans le cours avec le système des endonucléases : Xho 1 et Sal 1 créant toutes les deux une extrémité 5' sortante homologue et sont compatible, alors que Pst 1 et Sma 1 avec respectivement leur 3' et leur 5' sortante ne le sont pas Du coup il y a un couac avec ce QCM
Ouistiti Posted October 22, 2017 Posted October 22, 2017 Pour la C, je ne sais pas. Je sais juste que c'est ce que j'ai répondu donc je vais peut-être retrouver pourquoi j'avais répondu ça. Mais en le refaisant ça paraîtrait plus logique pour la B. Je continue à chercher. Sinon demandez en TD cette semaine, ou directement à Langin mais il me semble qu'il ne répond pas.
carla31 Posted October 22, 2017 Author Posted October 22, 2017 D'accord j'irai demander ! Merci quand même !
carla31 Posted October 23, 2017 Author Posted October 23, 2017 Oui pas de problème, mais le prochain TD de génome n'est que après le CCB
Zoee Posted October 24, 2017 Posted October 24, 2017 Bonjour! Le génome n'étant pas ma tasse de thé, j'aurai besoin qu'on m'aide à analyser la consigne et les items parce que j’ai souvent l’impression d’y arriver et au final je me trompe à cause de l’analyse de la consigne, je me base sur de mauvaises informations et du coup je me trompe bêtement ou j'ai juste pour les mauvaises raison #item C apparemment J’aurai donc besoin qu’on m’aide en me disant si mon raisonnement est juste ou non. PS: j'ai lu avec soin les réponses précédentes mais elles ne m'ont pas beaucoup éclairée :/ PS2: y a de la lecture désolée, j'ai essayée d'être le plus clair possible pour qu'on m'aide au mieux CONSIGNE: " La partie codant les 4 doigts de Zinc est insérée dans un vecteur plasmidique par la technique de clonage TA. " → je comprend pas quelle info est importante ici, est-ce qu'on veut simplement amplifier et/ou cloner un gène en particulier qu'on a choisi ( celui doant les 4 doigts de zinc )? " cette approche est basée sur une propriété de la Taq ADN Pol : " → j'imagine qu'on va amplifier par PCR du coup? on va donc faire pleiiin de copies du gène "l'enzyme ajoute un A en 3' des fragments d'ADN amplifiés lors des cycles PCR selon le schéma suivant : 5' --------- A 3' 3' A --------- 5' " → ah bah oui apparemment on fait une PCR, j'imagine qu'on ajoute le A pour le sens d'insertion en jouant sur la complémentarité, si il y a une autre raison: dites moi laquelle ITEM A B C: j'ai mis A faux, B juste ( mais il est faux normalement!), C Juste pour 50% des cas suivant le sens d'insertion ( si c'est pas clair dites le moi ) : https://www.noelshack.com/2017-43-2-1508862282-img-2566.jpg (en rouge: fragment d'ADN amplifié; en bleu: le plasmide ( à gauche ce qu'on a en haut - le plus proche de Ori - et à droite ce qu'on a en bas sur le cercle du plasmide, ça peut sembler un peu etrange comme explication de schéma mais j'espère que mon petit dessin parle déjà de lui même ) ce que j'ai fait pour le C ( imaginer un sens puis l'autre, et donc un fonctionne et l'autre non) j'aurai pu le faire pour le B ça aurait été pareil: 1 sur 2 fonctionne, du coup sur quel sens se baser ? ) ITEM D : "Le plasmide pour clonage TA peut être produit en coupant le site multiple de clonage avec une enzyme de restriction qui génère des bouts francs, → alte : sortez vos poly: pour moi ça correspond à la diapo 117 avec l'exemple de la diapo 111, rien de fou enfin je crois puis en incubant le plasmide coupé avec une transférase terminale et du dTTP " → on a des bouts francs sur la plasmide au niv de la coupure du MCS, puis on rajoute des T en 3' ca devrait donner : https://www.noelshack.com/2017-43-2-1508861163-img-2565.jpg donc on est dans le cas de l'item B, donc ça me semble en effet faisable on pourra insérer le fragment d’adn amplifié etc etc : j’aurais mis juste mais il est compté faux ! ITEM E la réponse de Clémence semble tout à fait logique donc c'est bon pour cet item REMARQUE: je pense que mon problème concerne l'orientation de l'insertion de mon ADN amplifié, ou le sens de lecture du plasmide je sais pas enfin je dois inverser quelque chose mais je vois pas quoi et où merci à ceux qui ont pris 10 mn de leur temps juste pour me lire et keur sur ceux qui me répondront
AlexandreTrapé Posted October 24, 2017 Posted October 24, 2017 autant pour moi je ne peux te répondre enfaite
VM-Varga Posted October 24, 2017 Posted October 24, 2017 Salut Alexandre, Pour première question il faut que vous ayez les 5’ du plasmide en face du 5’ de l’an sequence PCR et non 5’ en face de 3’ et là ça fonctionne Il faut donc le T en 5’ du plasmide pour qu’il aille en face d’un A en 3’ de la séquence J'ai du mal à comprendre, du coup, c'est quoi en face de quoi au final ?
Zoee Posted October 24, 2017 Posted October 24, 2017 aaah d'acc c'etait tout bete en fait comme d'hab, j'imagine que du coup j'avais bien fait le qcm si rien d'autre n'a été relevé ( troforte lol ) merci pour la petite astuce qui change tout
AlexandreTrapé Posted October 24, 2017 Posted October 24, 2017 Je vous ai dit une bêtise il me semble..
Zoee Posted October 24, 2017 Posted October 24, 2017 oh lala du coup ça me donnait ça et c'était bin: https://www.noelshack.com/2017-43-2-1508874740-img-2570.jpg mais c'est vrai que ça colle pas avec https://www.noelshack.com/2017-43-2-1508874825-capture-d-ecran-2017-10-24-a-21-53-32.png où un 3' est sensé se lié à 5' ( en gros )
Clemsoin Posted October 24, 2017 Posted October 24, 2017 Vous prenez pas la tête avec cette item, pour moi c'est une errata. Après vous pouvez tjrs demander au TD ou à la séance de questions/réponses... https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC333802/?page=1 "The vector ends [by] a single 3'overhanging T"
Zoee Posted November 2, 2017 Posted November 2, 2017 Je re-up le sujet ( ça se dit ? ) parce que le sujet est tombé ajd, et peut -etre que quelqu'un a eu l'idée qu'on a pas eu qui explique pourquoi C est juste et B et D faux.. Je suis peut-être maso mais même en connaissant la correction, j'ai quand même mis que B et D etaient justes et C faux parce que selon moi c'est ça qui est logique, en espérant que comme a dit clemsoin c'est un errata, sinon bah tant pis vive les ccB PS: plusieurs personnes autour de moi disaient que C est juste et BD faux, mais personne n'a été capable de me donner une explication claire ou qui tiennent la route
VM-Varga Posted November 2, 2017 Posted November 2, 2017 Moi j'ai fais ma grosse tête de mule, j'ai coché B vrai En attente d'explications
carla31 Posted November 2, 2017 Author Posted November 2, 2017 J'ai fait la même chose que vous Pour moi B est juste !
Zoee Posted November 2, 2017 Posted November 2, 2017 ah la famille vous faites plaisir moi j'attends les gens qui m'ont regardé avec des gros yeux en disant non C est juste haha
Tommayeur Posted November 4, 2017 Posted November 4, 2017 Salut tout le monde, si j'ai bien compris y'a un gros mystère sur la C. Perso j'ai mis B etC juste parce que la question nous demande si on peut le cloner donc l'insérer et pas si ça donne une protéine fonctionnelle. Du coup dans les deux cas le fragment peut être inséré en étant tourné. B et C justes pour moi. Et la D totalement fausse parce qu'avec une transférase terminale non sélective ( qui fout du dTTP en 3' et 5' du coup ) on se retrouve avec 4 extrémités dTTP et c'est pas le but, en plus si y'a pas déphosphoryllation le plasmide se referme si on est sur du bout franc. Voilà j'espère que mon explication est pas foireuse c'est comme ça que je le vois après je me plante peut être
VM-Varga Posted November 7, 2017 Posted November 7, 2017 Bonjour ! J'apporte du nouveau sur l'affaire via des on dit À ce qu'il paraît l'incohérence a été soumise à Langin qui après un blanc d'incompréhension à répondu : "Je ne voudrais pas vous répondre trop vite donc je vais m'y pencher dessus". Autrement dit, il y a bien un problème, auquel cas la réponse aurait été instantané. Pourtant ça a du être réfléchis, puisque les sujets sont faits et relus par le prof + les chargés de TD. Donc encore une fois problème. Un problème lourd en conséquence, car toute errata non remarquée au concours offre l'année à des chanceux, et coûte l'année à d'autres... Autrement dit ce QCM a une portée bien plus grande que ce que l'on imaginait... Affaire à suivre
Zoee Posted November 7, 2017 Posted November 7, 2017 Salut Tommayeur! Je comprend pas en quoi il aurait pu etre inséré dans les deux cas ( B et C ) car tu dis qu'on a juste à tourner le fragment, donc à changer son orientation, or dans un sens ou dans un autre, le fragment est le meme vu que on a tjr 3'A ( ou 5'A je l'ai pas sous les yeux ) mais on a pas les même " site de restrictions " sur chaque plasmide, donc y a forcément un plasmide ( B ou C ) qui ne peut accueilir le fragment. Bon je m'exprime vraiment très mal mais il me semble que dans ce sujet sur la page un quelqu'un l'explique mieux que moi.. MAIS: je n'ai pas la science infuse loin de là donc voila je ne donne que mon humble avis le mieux est d'avoir la suite de l'histoire avec notre messager royal Varga ( ps: ça m'étonnerait que ça aille jusqu'à changer la donne pour certains, mais ça reste très excitant à mes yeux qu'un qcm de langin eu été potentiellement "mal" corrigé au cc officiel hihi )
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