Erratum colle du 16/10 - GENOME

[Batwoman]

Salut ! Vous pouvez poster ici les potentiels erratum de la partie GENOME de la colle

[Shiva]

Salut !

 

Deux petits problèmes en génome pour moi

 

4C je suis d'accord que par rapport à la séquence on pourrait parler de DNA bicatenaire or on nous parle de provirus donc un cDNA, le cDNA ne possède pas d'introns alors qu'un DNA classique oui ce qui fait que pour moi ce serait faux.

 

11B les liaisons phosphodiesters se font entre deux nucléoSides, sinon nous compterions deux fois le phosphate, c'est un piège qu'il me semble avoir déjà vu des annales, et on retrouve l'explication dans un schéma du cours

 

Merci pour la colle !

[petit_tonnerre]

Salut! Merci pour la colle!

 

Le QCM 7 A "L'ATP est une réserve biochimique d'énergie" est compté vraie, or l'ATP n'est pas stocké, du coup on ne peut pas parler de réserve selon moi...

 

ET Victor pour la 11 B, il me semble que dans des QCM d'annales il y a des items avec cette formulation et le prof le compte vraie aussi! parce que je pense qu'on parle de l'enchainement des désoxyriboses et pas juste des nucléotides. Et 4C d'accord avec toi

[fabien31]

Salut et merci pour la colle,

 

En effet si on parlait d'un enchaînement de desoxyriboses je suis d'accord qu'il pourrait s'agir de liaisons phospodiesters. Or ici ce sont des desoxyriboses de nucléoTides donc pour moi ce sont des liaisons esters.

Je suis d'accord avec toi Victor pour la 11B.

[petit_tonnerre]

Si vous regardez dans le poly d'annales dans la replication QCM 12 " les DNA polymérase DNA dependantes synthétisent des liaison phosphodiester 3'-5' (entre le nucléotide en amont et le nucléotide en aval" est compté vraie, je suis d'accord avec vous mais Salvayre a pourtant l'air de le compter vraie...

[MaryD]

Victor, un cDNA double brin reste un ADN bicaténaire, de la même façon qu'une séquence d'ADN sans intron reste de l'ADN bicaténaire

De plus c'est le DNA génomique des eucaryotes qui contient des introns, mais il ne caractérise en rien le "DNA classique".

 

Et en effet, il me semble que Salavayre considère que la polymérase synthétise des liaisons phosphodiester entre les nucléotides mais qu'entre deux nucléotides on parle de liaison ester (et de liaison phosphodiester entre deux nucléosides). Tout dépend de la façon dont la question est posée

 

Et les liaisons riches en énergies contenues dans l'ATP sont bien définies dans le cours comme des réserves biochimiques d'énergie (diapo 28).

[Netvink]

Salut,

 

4C : Il peut s'agir d'un cDNA d'un rétrovirus comme indiqué dans la proposition. On ne parle nullement d'introns ou d'exons.

7A : La molécule d'ATP est en elle-même une réserve d'énergie car elle peut potentiellement être clivée pour libérer cette énergie. On ne parle pas de son stockage.

11B : Cet item a été reformulé par le Pr.Salvayre de la sorte. On vous parle de désoxyriboses, donc que ce soit de nucléotides ou de nucléosides, cela désigne toujours un seul et même élement qu'est le désoxyribose (le sucre). Ils sont bien reliés par des liaisons phosphodiesters.

Par ailleurs, le Pr.Salvayre a lui même affirmé qu'il ne considérait pas important de distinguer liaison ester pour nucléotides, et liaison phosphodiester pour nucléosides dans le cadre du concours.

[Shtomal]

Coucou ! 

 

Super la colle

 

Juste une question : A l'item 8D, on ne précise pas que l'oligonucléotide ou que la protéine est marquée... Donc comment pourrions nous l'observer sur une électrophorèse ?

 

Merci

[Loorette]

Comme tu le vois sur la diapo du cours, l'oligonucléotide est toujours marqué et quand il est seul, il sert de "référence". En ajoutant la protéine et l'anticorps, il est plus lourd/encombrant et donc a un retardement plus important.

[Shtomal]

Oui mais dans l'item 8E, le piège se trouve dans le fait que l'oligonucléotide est non marqué...

Est ce qu'on considère qu'il est toujours marqué sauf quand on le précise ?

 

Merci

[Netvink]

Salut !

 

Oui tu peux penser cela. En fait, il est sous-entendu que l'oligonucléotide est marqué par l'emploi du pronom " l' " qui suggère qu'on se réfère à l'oligonucléotide dont on a déjà parlé. En l’occurrence, on se réfère à l'oligonucléotide marqué présenté en A. 

Lorsqu'on veut se référer à un nouvel oligonucléotide non marqué (et plus au précédent), on le précise dans la proposition (en E).

[Shtomal]

Merci beaucoup  

[Fugu]

Saut, 

 

J'ai un problème pour le dernier item (16.E) pour moi elle serait vrai si le sens de coupure est dans le même sens, comme AbcI et XhoI mais si une enzyme coupe dans l'autre sens (ATCAGA/T) on a la même séquence à l'intérieur mais ils ne peuvent se réassocier entre eux, non? 

[Netvink]

Salut !

 

Je suis parfaitement d'accord avec toi ! Je l'avais signalé mais apparemment ça n'a pas posé de problème au Pr.Levade.

Je pense que c'est lié au fait que cette proposition n'est pas exclusive : ainsi, des brins peuvent s'associer seulement si la séquence interne des enzymes est identique (condition requise) mais pas seulement (condition non suffisante) ! Il faut aussi que le site de coupure soit du même côté.

Donc cette proposition est vraie ; pour autant ça ne signifie pas que toutes les séquences qui satisfassent à cette proposition peuvent s'associer, c'est une condition requise mais pas suffisante

La formulation de l'item évoque une condition requise simplement !

[Fugu]

Ah d'accord, la formulation m'a posé problème alors, on devrait précisé du "même côté" je trouve, merci pour ta réponse!