Phi d'un peptide

[canevese]

Bonjour, 

 

J'ai un petit problème sur le calcul du Phi pour les peptides, pour un AA ça ne me pose pas de problèmes mais là je bloque sur ce QCM de concours. 

Dans mon TD j'ai mis 

 

 

L                 F          S          D                  W                 R                M                 I              V

Alpha NH2                       Beta COOH                  Guanidium                                        Alpha COOH

pK= 9.3                            Pk= 3.9                        pK= 12.5                                               Pk= 2.1 

 

J'ai mis un + au niveau de Lysine et Arginine car c'est les 2 positifs au départ  

Mais enfaite je ne comprend pas pourquoi c'est Valine qui a Alpha COOh et pas un autre AA  

On aurait pu Alpha COOH sur un autre AA?  

 

Après j'ai à peu près compris le raisonnement  

 

Voilà, merci  

 

 

[EAL]

Bonjour,
C'est car la valine est au bout de ce peptide et donc sa fonction COOH reste libre. D'emblée, n'importe quel AA peut avoir un alpha-COOH.

[canevese]

Ouais mais par exemple pour le peptide V S D F, je ne vois pas comment on arrive à pHi= 3 

On a comme pk 

alpha amine primaire 9.3 

alpha carboxylique 2.1

gamma carboxylique 3.9 

guanidium 12.5 

 

V+                    S                            D                                           F                                         

Alpha Amine primaire                                                                 Alpha carboxylique 

9.3                                                                                                2.1

 

C'est ça ou je me suis déja trompé? 

[EAL]

Tu oublies le D, l'aspartate (fonction gamma-carboxylique).
Donc c'est (2,1 + 3,9)/2 = 3

[canevese]

Oui mais c'est une ft Béta carboxylique pas gamma non? 

[EAL]

C'est bien gamma-carboxylique, je viens de le vérifier.

[canevese]

Ah bon d'accord, merci beaucoup de ton aide!  

[Guest Jeffrey]

Voila rien a rajouter :-)

Simplement c'est bien gamma, mais ça doit même pas changer grand chose d'un point de vue du pK parce que je crois qu'on leur donne un peu la même valeur.

Bon courage.