QCM Fragments et Plasmides

[francisco]

Bonsoir, j'aurais besoin d'aide pour ce genre de QCM en Recherche, j'ai beaucoup de mal à calculer la taille des fragments après avoir ajouté les cassettes d'expressions et lorsqu'il faut couper le plasmide recombinant avec les enzymes.

Je voudrais savoir si quelqu'un pouvait m'expliquer juste la méthode pour trouver la taille des fragments svp.

Je laisse ce QCM en tant qu'exemple avec la réponse pour faciliter l'explication.

Merci d'avance.

https://zupimages.net/viewer.php?id=24/04/m6nv.jpg

 

[Aaronigashima]

59 minutes ago, francisco said:

Bonsoir, j'aurais besoin d'aide pour ce genre de QCM en Recherche, j'ai beaucoup de mal à calculer la taille des fragments après avoir ajouté les cassettes d'expressions et lorsqu'il faut couper le plasmide recombinant avec les enzymes.

Je voudrais savoir si quelqu'un pouvait m'expliquer juste la méthode pour trouver la taille des fragments svp.

Je laisse ce QCM en tant qu'exemple avec la réponse pour faciliter l'explication.

Merci d'avance.

https://zupimages.net/viewer.php?id=24/04/m6nv.jpg

 

Ok en gros pour calculer la nouvelle taille avec ton exemple : tu regardes a quel plasmide on va integrer la petite partie qu'on coupe. Ici l'hote c'est le A donc tu retiens sa taille normale (6000). Tu le coupes avec Bam1 (ici il ne perd pas de taille pcq il n'y a qu'un site a bam1 dans le plasmide, c'est comme une corde -> si tu la coupe a un seul endroit elle retrecit pas). Tu as toujours une taille de 6000. Ensuite la partie dans le plasmide 2 que tu viens retirer fait 600 et tu l'integre au A. Ton nouveau plasmide fait donc 6000+600 = 6600 pdb

 

Par contre ya des situations ou le plasmide receveur contient 2 fois l'enzyme de restriction : dans ce cas la le petit bout qui est enleve au plasmide degage et tu le retires donc au calcul final (si par exemple le plasmide A contenait un autre endroit qui reagit a bam1 au 900e nucleotide, tu aurais enleve 50 au produit final ce qui donne 6550 pdb)

Edited January 25, 2024 by Aaronigashima

[francisco]

il y a 12 minutes, Aaronigashima a dit :

Ok en gros pour calculer la nouvelle taille avec ton exemple : tu regardes a quel plasmide on va integrer la petite partie qu'on coupe. Ici l'hote c'est le A donc tu retiens sa taille normale (6000). Tu le coupes avec Bam1 (ici il ne perd pas de taille pcq il n'y a qu'un site a bam1 dans le plasmide, c'est comme une corde -> si tu la coupe a un seul endroit elle retrecit pas). Tu as toujours une taille de 6000. Ensuite la partie dans le plasmide 2 que tu viens retirer fait 600 et tu l'integre au A. Ton nouveau plasmide fait donc 6000+600 = 6600 pdb

 

Par contre ya des situations ou le plasmide receveur contient 2 fois l'enzyme de restriction : dans ce cas la le petit bout qui est enleve au plasmide degage et tu le retires donc au calcul final (si par exemple le plasmide A contenait un autre endroit qui reagit a bam1 au 900e nucleotide, tu aurais enleve 50 au produit final ce qui donne 6550 pdb)

Salutt merci pour ta réponse, ducoup juste pour m'assurer, le plasmide il commence à "ORI" c'est bien ça? Et aussi ducoup on rajoute la cassette d'expression à l'endroit où on a coupé le plasmide A? Je crois avoir compris mon erreur ducoupp.

[orthosympathique]

@francisco, Ori est l'origine de réplication, c'est là où débute tout ce qui va pouvoir etre répliqué, transcrit et traduit jusqu'au site de terminaison "terminateur" 

et oui tu ajoutes la cassette d'expression à l'endroit de l'ouverture du plasmide. Tu as ouvert pour mettre la cassette! 

si tu as besoin d'autre chose n'hésite pas !