brin transcrit

[C'estPASSimple]

Bonjour, je n'arrive pas à savoir si il faut remplacer les T par U dans les "brins transcrits" car pour moi il correspond au brin 3' 5' complémentaire du brin codant mais les U c'est pour les ARN non ? 

https://ibb.co/58WgMCB

[Vector]

Helloooo

 

Alors la réponse est toute simple : un transcrit c'est un ARNm.

 

Le mot "transcrit" fait référence à la molécule issue de la transcription, c'est-à-dire un ARNm. Il est bien complémentaire au brin d'ADN matrice (anti-sens).

Le transcrit primaire correspond à l'ARN pré-messager (avant la phase d'épissage et de maturation)alors qu'un transcrit mature correspond à une ARNm mature (ARN épissé avec la coiffe et la queue poly-A).

 

La thymine est donc bien remplacée par l'uracile dans les transcrits.

 

Mais attention au vocabulaire :

- quand on parle de "transcrit" on fait bien référence à un brin d'ARNm 

- quand on parle "du brin transcrit" on fait référence au brin qui a subi la transcription (c'est à dire le brin matrice d'ADN) par opposition au brin non-transcrit (=brin codant). 

 

J'espère que c'est clair et que ça a répondu à ton problème !

 

La tutobise

Edited November 22, 2023 by Vector

[C'estPASSimple]

il y a 54 minutes, Vector a dit :

Helloooo

 

Alors la réponse est toute simple : un transcrit c'est un ARNm.

 

Le mot "transcrit" fait référence à la molécule issue de la transcription, c'est-à-dire un ARNm. Il est bien complémentaire au brin d'ADN matrice (anti-sens).

Le transcrit primaire correspond à l'ARN pré-messager (avant la phase d'épissage et de maturation)alors qu'un transcrit mature correspond à une ARNm mature (ARN épissé avec la coiffe et la queue poly-A).

 

La thymine est donc bien remplacée par l'uracile dans les transcrits.

 

Mais attention au vocabulaire :

- quand on parle de "transcrit" on fait bien référence à un brin d'ARNm 

- quand on parle "du brin transcrit" on fait référence au brin qui a subi la transcription (c'est à dire le brin matrice d'ADN) par opposition au brin non-transcrit (=brin codant). 

 

J'espère que c'est clair et que ça a répondu à ton problème !

 

La tutobise

Yess j'ai compris merci ! Et autre question comment on sait pour l'item E ? https://ibb.co/HqNR4y8 

[Vector]

Dans ce cas la, le QCM insiste sur la différence entre la PCR et la RT-PCR :

 

Quand tu fais une PCR, tu pars de l'ADN génomique (introns + exons) et tu l'amplifies pour en avoir plein de copies (qui contiennent donc les introns et les exons). Qu'il y ai une mutation ou pas, l'exon concerné sera toujours présent dans le génome, donc cette mutation n'aura pas d'impact sur la PCR (sauf bien sur si la mutation concerne le site d'hybridation des amorces, ce qui n'est pas le cas dans ce QCM puisqu'elle se trouve dans l'intron 1).

 

Quand tu fais une RT-PCR tu pars d'un brin d'ARNm mature, donc épissé (ne contenant que des exons) et à partir de cet ARNm tu fais une rétro-transcription (RT) afin d'obtenir pleins de copies d'ADNc (ne contenant que des exons aussi). Donc si une mutation entraine l'excision d'un exon dans la séquence de l'ARN et que cet exon correspond au site de fixation des amorces tu n'auras pas d'amplification.

 

en bref pour cet item : 

On fait une PCR donc il y a amplification de l'ADN génomique (introns + exons) donc la mutation n'a pas de conséquence : l'exon 2 est toujours présent dans le génome et n'a pas été modifié donc l'amorce peut s'hybrider.

Imaginons maintenant le cas où on réalise une RT-PCR : l'ADN nucléaire est transcrit en ARN pré-messager -> lors de l'épissage la mutation de l'intron 1 entraine l'excision de l'exon 2 -> l'ARNm mature ne contient que les exons 1 et 3 -> l'ADNc amplifié ne contient que les exons 1 et 3 -> pas d'amplification car l'amorce se fixe sur l'exon 2 (éliminé lors de l'épissage).

 

Si ce n'est pas clair ou si tu as d'autres questions n'hésite pas !

Edited November 22, 2023 by Vector

[C'estPASSimple]

il y a 8 minutes, Vector a dit :

Dans ce cas la, le QCM insiste sur la différence entre la PCR et la RT-PCR :

 

Quand tu fais une PCR, tu pars de l'ADN génomique (introns + exons) et tu l'amplifies pour en avoir plein de copies (qui contiennent donc les introns et les exons). Qu'il y ai une mutation ou pas, l'exon concerné sera toujours présent dans le génome, donc cette mutation n'aura pas d'impact sur la PCR (sauf bien sur si la mutation concerne le site d'hybridation des amorces, ce qui n'est pas le cas dans ce QCM puisqu'elle se trouve dans l'intron 1).

 

Quand tu fais une RT-PCR tu pars d'un brin d'ARNm mature, donc épissé (ne contenant que des exons) et à partir de cet ARNm tu fais une rétro-transcription (RT) afin d'obtenir pleins de copies d'ADNc (ne contenant que des exons aussi). Donc si une mutation entraine l'excision d'un exon dans la séquence de l'ARN et que cet exon correspond au site de fixation des amorces tu n'auras pas d'amplification.

 

en bref pour cet item : 

On fait une PCR donc il y a amplification de l'ADN génomique (introns + exons) donc la mutation n'a pas de conséquence : l'exon 2 est toujours présent dans le génome et n'a pas été modifié donc l'amorce peut s'hybrider.

Imaginons maintenant le cas où on réalise une RT-PCR : l'ADN nucléaire est transcrit en ARN pré-messager -> lors de l'épissage la mutation de l'intron 1 entraine l'excision de l'exon 2 -> l'ARNm mature ne contient que les exons 1 et 3 -> l'ADNc amplifié ne contient que les exons 1 et 3 -> pas d'amplification car l'amorce se fixe sur l'exon 2 (éliminé lors de l'épissage).

 

Si ce n'est pas clair ou si tu as d'autres questions n'hésite pas !

Ah oui d’accord pcq enfait l’excision ne concerne que l’épissage avec les ARN ? Même si il y a mutation sur l’intron il n’y aura pas excision de l’exon 2 sur l’ADN ?

[Vector]

c'est exactement ça, la mutation de l'intron 1 n'a pas de conséquence sur l'ADN nucléaire par contre elle entrainera l'excision de l'exon 2 lors de l'épissage alternatif de l'ARNm.

[C'estPASSimple]

il y a 1 minute, Vector a dit :

c'est exactement ça, la mutation de l'intron 1 n'a pas de conséquence sur l'ADN nucléaire par contre elle entrainera l'excision de l'exon 2 lors de l'épissage alternatif de l'ARNm.

Super j’ai compris merci bcp!