Acides Aminés

[Cloé23]

Salut ! Je ne comprends pas la correction de ce qcm, est-ce que quelqu'un peut m'aider s'il vous plait ?

 

QCM 54 - QCM type épreuve classante : Lors de l’hydrolyse acide d’un hexapeptide A, on a pu identifier les composants suivants : Ser, Glu, Thr, Gly, Asp, Phe.

- L’action isolée d’une carboxypeptidase sur le peptide A libère un AA dicarboxylique.

- L’action isolée d’une aminopeptidase sur le peptide A libère un AA avec un alcool primaire.

- Le traitement avec la chymotrypsine du peptide donne deux tripeptides, dont un possède côté N-terminal un AA n’ayant pas de carbone asymétrique. Parmi les propositions suivantes, quelles structures du peptide A sont possibles ?

A. Gly-Thr-Ser-Phe-Asp-Glu

B. Ser-Glu-Phe-Gly-Thr-Asp

C. Asp-Thr-Gly-Phe-Glu-Ser

D. Ser-Thr-Phe-Gly-Asp-Glu

E. Ser-Asp-Phe-Thr-Gly-Glu

 

QCM 54 - BD QCM assez simple, il faut bien rester concentré.e et travailler sur brouillon. On retrouve en N-ter la Sérine (qui est le seul alcool primaire), en C-ter un AA dicarboxylique : Glu ou Asp. La chymotrypsine coupe après un AA aromatique, ici la phénylalanine. Un des deux tripeptides possède une glycine en N-ter.

[ElCassoulet]

@Cloé23

re

 

L'objectif du QCM est de retrouvée l'ordre des 6 aa donnés dans l'énoncé en fonction des enzymes que tu vas utiliser et des positions N-/C-terminales.

Je vais prendre les étapes dans le sens donné dans le qcm :

→ la carboxypeptidase coupe l'aa à l'extrémité C-ter du peptide (comme son nom l'indique), si tu libère un aa dicarboxylique, ça veut dire que l'aa en C-ter est soit le Glutamate (Glu) soit l'aspartate(Asp), si on a pas plus d'infos, on devrait avoir au moins 2 possibilités donc.

→ l'aminopeptidase coupe en N-ter, la sérine est le seul aa protéinogène à contenir un alcool secondaire, ça tombe bien elle fait partie de l'énoncé; donc en N-ter c'est de la sérine.

→ la chymotrypsine coupe après un aa aromatique, le seul qu'on ait ici est la PhénylAlanine (Phe), comme on obtient un trypeptide et qu'à la base on a un hexapeptide, ça veut dire que ça coupe au milieu. Aussi, le seul aa sans carbone asymétrique est la glycine, pareil c'est dans l'énoncé !

 

Donc de part et d'autre du centre du peptide, on a la Phe et la Gly, comme c'est marqué que la glycine compose le coté N-ter d'un des trypeptide, on peut déduire une structure approximative :

Sérine-?-Phe-Gly-?-Asp/Glu

 

On a donc plusieurs réponses possibles puisqu'on a pas pu identifier précisément la position et la nature de chaque aa !

 

Tu vois mieux ?

 

 

[TheoPF]

Salut!

Alors déjà ce que tu dois savoir absolument :

 

=> Bromure de Cyanogène : coupe après une Méthionine 

=> Chymotrypsine : coupe après les AA aromatiques (Phe ; Tyr ; Trp) 

=> Trypsine : coupe après Lysine (Lys) et Arginine (Arg)

=> βMercaptoéthanol : coupe un pont Disulfure (S-S) (donc entre 2 cystéines qui sont pas dans la même chaine peptidique) 

=> Carboxypeptidase : coupe avant le dernier AA de la chaine peptidique 

=> Aminopeptidase : coupe après le premier AA de la chaine peptidique 

 

Maintenant on fait étape par étape 

 

1 : On coupe avec une carboxypeptidase et on libère un AA dicarboxylique, tu sais que carboxypeptidase coupe avant le dernier AA donc ça veut dire que ton dernier AA est un di carboxylique (soit Asp soit Glu) 

=> l'item C est faux 

 

2 : On coupe avec une aminopeptidase et on libère un AA avec un alcool primaire, tu sais que les aminopeptidases coupent après le premier AA donc ça veut dire que ton premier AA contient un alcool primaire

La glycine ne contient pas d'alcool car son radical est un H (rappel : c'est le seul AA qui contient aucun C*)

=> L'item A est faux 

 

3 : On coupe avec la chymotrypsine et ça donne 2 tripeptides, donc on sait déjà qu'il y a un unique AA Aromatique (soit Phe soit Tyr) dans la chaîne car ça donne que 2 peptides.

On remarque que B,D,E contiennent chacun un AA Aromatique qui est la Phénylalanine, elle est placée en 3 ème position donc ça veut dire que pour B,D,E la chymotrypsine donne 2 tripeptides 

 

Il nous faut donc d'autres infos pour pouvoir les distinguer

 

On nous dit que l'un des tripeptides contient un AA N-terminal (donc en début de chaine) qui ne contient pas de C* 

Autrement dit un tri peptide contient une Glycine en début de chaine, donc en théorie, il faut que dans les propositions il y ait une Glycine placée soit en 1ère soit en 4ème position, MAIS ça peut pas être en première position car il faut un AA qui contient un alcool primaire (rappelle toi) 

=> L'item E est faux 

 

Donc réponse : B et D 

Edited October 28, 2023 by TheoPF

[POMME]

Salut, pour résoudre ce QCM il faut résonner par étapes.

 

D’abord tu sais que ta carboxypetidase va libéré le AA C-terminal (à droite) et on te dit que ce AA est un dicarboxylique (Acide glutamique/glutamate ou Acide aspartique/aspartate. Donc dans un premier temps tu peux éliminé toutes les proposition qui ne termine pas par Glu ou Asp.

 

Ensuite tu sais que ton aminopeptidase va libéré le AA N-terminal (à gauche) et on te dit que ce AA est un alcool primaire, le seul de la liste est la sérine donc tu peux en plus éliminé toutes les proposition qui ne commence pas par Ser.

 

Enfin on te dit que la chymotrypsine du peptide vas le coupé en deux morceau de trois acide aminé. Hors tu sais que la chymotrypsine va couper le peptide après un AA aromatique. Dans la liste le seul AA aromatiques est la phénylalanine donc tu peux aussi éliminer toutes les réponses qui ne comportent pas un Phe comme troisième AA.

On te dit aussi que l’un des morceaux aura un AA sans carbone asymétrique en N-terminal. Le seul AA qui n’en possède pas est la Glycine. Hors on a vu que notre peptide d’origine avais une sérine en N-terminal. Cela signifie que c’est le deuxième morceau qui commence par une Gly donc tu peux enfin éliminer toutes les réponse qui n’ont pas une Gly comme quatrième AA. 

 

Est-ce que c’est plus clair?

[Cloé23]

AHHHH ok je n'avais pas vraiment compris et là c'est très clair ! Merci beaucoup !!