génétique inverse et classique

[Lelea]

salut !

 

j'ai du male à comprendre la différence entre  l'analyse génétique classique et inverse si quelqu'un peut m'expliquer ? 

[AAAAH]

Coucou !

 

Je te remets la diapo de la prof pour clarifier un peu mon explication.

 

Tout d'abord, au niveau des similitudes, l'analyse génétique, qu'elle soit classique ou inverse, cherche à comprendre l'interaction entre la fonction et les protéines ("Quelle fonction correspond à quelle protéine ?"). 

 

Dans le cadre de l'analyse génétique classique, tu pars d'une fonction de la cellule ou de l'organisme, prenons pour la suite l'exemple d'une cellule cancéreuse qui vient créer tout un réseau veineux autour d'elle. L'angiogenèse est ici la fonction. On va donc comparer le génome de cette cellule cancéreuse avec le génome d'une cellule "sauvage" c'est à dire une cellule normale, non mutée. A partir de cette comparaison, on va pouvoir trouver un gène qui sera différent dans la cellule cancéreuse anormale. Pour l'instant, on ne sait pas à quoi sert ce gène. On va donc aller le surexprimer en laboratoire sur des cellules modifiées par les moyens qui ont été développés plus en détail dans le chapitre précédent. De cette surexpression du gène, on remarquera qu'une protéine, le VEGF, est bien plus présente que les autres, on vient alors la purifier. A la fin de ce processus, on peut conclure que le VEGF, surexprimé dans la cellule cancéreuse à cause d'une mutation du gène X, sera responsable de l'angiogenèse. 

 

L'analyse génétique inverse, c'est, comme son nom l'indique, l'inverse. On remarque une quantité trop élevée de VEGF. En séquençant la protéine, on peut déterminer le code génétique qui permet de la créer. On va alors alors surexprimer ou inactiver ce gène dans une cellule ou un organisme transgénique, ici on peut imaginer qu'on vient surexprimer ce facteur de croissance dans un rat par exemple. On va donc voir que le rat transgénique va avoir une angiogenèse bien plus importante que ses pairs "Wild Type", c'est à dire "normaux" ou plutôt non mutés.  On déduit alors que le VEGF est à l'origine de l'angiogenèse. 

 

Une fois que l'on a pu relier une protéine à une fonction, on peut développer des composés actifs qui vont venir supplémenter (l'insuline pour les diabétiques) ou inhiber (aspirine, inhibitrice de la COX2, et donc par extension des molécules à l'origine de l'inflammation) les protéines que l'on cible. 

 

Ces notions sont un peu difficiles à comprendre au départ, mais c'est assez simple de déterminer si tu es dans un cas d'analyse génétique classique ou inverse quand tu connais l'information de départ : si tu commences avec la fonction et que tu remontes vers l'origine en cherchant la protéine, c'est une analyse génétique classique. Si tu pars de la protéine et que tu descends vers sa fonction, c'est une analyse génétique inverse.

 

J'espère que c'est plus clair pour toi sinon n'hésite pas !

 

[Lelea]

Le 12/01/2023 à 17:50, AAAAH a dit :

Coucou !

 

Je te remets la diapo de la prof pour clarifier un peu mon explication.

 

Tout d'abord, au niveau des similitudes, l'analyse génétique, qu'elle soit classique ou inverse, cherche à comprendre l'interaction entre la fonction et les protéines ("Quelle fonction correspond à quelle protéine ?"). 

 

Dans le cadre de l'analyse génétique classique, tu pars d'une fonction de la cellule ou de l'organisme, prenons pour la suite l'exemple d'une cellule cancéreuse qui vient créer tout un réseau veineux autour d'elle. L'angiogenèse est ici la fonction. On va donc comparer le génome de cette cellule cancéreuse avec le génome d'une cellule "sauvage" c'est à dire une cellule normale, non mutée. A partir de cette comparaison, on va pouvoir trouver un gène qui sera différent dans la cellule cancéreuse anormale. Pour l'instant, on ne sait pas à quoi sert ce gène. On va donc aller le surexprimer en laboratoire sur des cellules modifiées par les moyens qui ont été développés plus en détail dans le chapitre précédent. De cette surexpression du gène, on remarquera qu'une protéine, le VEGF, est bien plus présente que les autres, on vient alors la purifier. A la fin de ce processus, on peut conclure que le VEGF, surexprimé dans la cellule cancéreuse à cause d'une mutation du gène X, sera responsable de l'angiogenèse. 

 

L'analyse génétique inverse, c'est, comme son nom l'indique, l'inverse. On remarque une quantité trop élevée de VEGF. En séquençant la protéine, on peut déterminer le code génétique qui permet de la créer. On va alors alors surexprimer ou inactiver ce gène dans une cellule ou un organisme transgénique, ici on peut imaginer qu'on vient surexprimer ce facteur de croissance dans un rat par exemple. On va donc voir que le rat transgénique va avoir une angiogenèse bien plus importante que ses pairs "Wild Type", c'est à dire "normaux" ou plutôt non mutés.  On déduit alors que le VEGF est à l'origine de l'angiogenèse. 

 

Une fois que l'on a pu relier une protéine à une fonction, on peut développer des composés actifs qui vont venir supplémenter (l'insuline pour les diabétiques) ou inhiber (aspirine, inhibitrice de la COX2, et donc par extension des molécules à l'origine de l'inflammation) les protéines que l'on cible. 

 

Ces notions sont un peu difficiles à comprendre au départ, mais c'est assez simple de déterminer si tu es dans un cas d'analyse génétique classique ou inverse quand tu connais l'information de départ : si tu commences avec la fonction et que tu remontes vers l'origine en cherchant la protéine, c'est une analyse génétique classique. Si tu pars de la protéine et que tu descends vers sa fonction, c'est une analyse génétique inverse.

 

J'espère que c'est plus clair pour toi sinon n'hésite pas !

 

Beaucoup plus clair avec l'exemple merci beaucouppp !!

[AAAAH]

Avec plaisir !

 

N'hésite pas si tu as d'autre questions !

Bonne soirée et bonne chance pour la colle de demain !