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Taille du Plasmide


Go to solution Solved by emylyyy,

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Salut ,

Dans le QCM3 page 168 du poly du Tat je ne comprend pas la question D je ne voit pas du tt comment faire pour connaitre la taille du plasmide Pleasee helpp merciii bcpp !!!!!!

  • Solution
Posted

Coucou, pour les questions de recherche il faut tu les poses dans la partie UE8/ 11 Recherche, ici c'est la partie pharmacocinétique et galénique ! 

 

Les enzymes qu'on choisit sont bamH1 et Xho1 donc tu regardes sur ton fragment et sur ton plasmide ou tu ouvres et ce que tu vas enlever et rajouter 

 

Sur le fragment on a bamH1 670 et Xho1 1300 : pour savoir ce que tu rajoutes tu fais la différence, ici tu ajoutes 630 pb 

 

Sur le plasmide on a bamH1 1350 et Xho1 1400 : pour savoir ce que tu enlèves tu fais la différence, ici tu enlèves 50 pb

 

Ensuite tu prends le nombre de paire de base de ton plasmide de base et tu fais le calcul, ici ça nous donne : 6200 - 50 + 630 = 6780 pb

Posted

Ah mince dslll je savais pas 

mais je comprend pas comment on sait que l'ont s'intéresse a c'est deux enzyme et pas au autre par exemple 

@emylyyy

  • Ancien Responsable Matière
Posted

Coucou @Selm

Déjà de manière générale(= 99% du temps), il faut que tes enzymes de restriction (j'écrirai EdR) soient présentes à la fois sur l'insert et sur le vecteur plasmidique 

Ici, sur l'insert tu en as seulement 3 : BamH1, HindIII (2 sites) et Xho1

Tu as donc toutes les possibilités d'association des EdR suivantes à envisager : 

 

Bam H1 + Hind III :

- fragment 1 : du début à BamH1 

- fragment 2 : de BamH1 à Hind III : tu vas couper juste après la séquence de la GFP mais tu ne prends pas la séquence de p53

- fragment 3 : de Hind III à Hind III : tu vas aussi couper juste après la séquence de p53

- fragment 4 : de Hind III jusqu'à la fin : il restera un bout

 => tu ne peux pas les utiliser ensemble 

 

BamH1 + Xho1 :

- fragment 1 : du début à BamH1 

- fragment 2 : de BamH1 à Xho1 : tu vas couper en prenant à la fois la séquence de la GFP et la séquence de p53

- fragment 3 : de Xho1 jusqu'à la fin 

=> tu auras seulement 3 fragments dont 1 qui comprend à la fois le gène de la GFP et le gène de p53 -> tu peux utiliser ces enzymes ensemble 

 

Hind III + Xho1 :

- fragment 1 : du début à Hind III : tu vas couper juste après la séquence de la GFP

- fragment 2 : de Hind III à Xho1 : tu auras un deuxième fragment correspondant à la séquence de p53

- fragment 3 : de Xho1 à Hind III 

- fragment 4 :  de Hind III jusqu'à la fin

=> tu ne peux pas les utiliser ensemble 

 

Hind III (2 fois) :

- fragment 1 : du début à Hind III : tu vas couper juste après la séquence de la GFP

- fragment 2 : de Hind III à Hind III : tu vas couper après p53

- fragment 3 : de Hind III jusqu'à la fin 

=> tu ne peux pas les utiliser ensemble 

 

Voici un schéma qui récapitule tout ce que je viens de te dire de manière un peu plus visuelle on va dire : https://zupimages.net/viewer.php?id=23/01/8ip8.jpeg

 

Comme le but dans l'exo est d'avoir à la fois la GFP et p53, tu peux uniquement utiliser BamH1 et Xho1

 

C'est plus clair pour toi ? 

Bon courage pour la suite ;) 💜

  • Ancien du Bureau
Posted
Le 03/01/2023 à 14:43, emylyyy a dit :

Coucou, pour les questions de recherche il faut tu les poses dans la partie UE8/ 11 Recherche, ici c'est la partie pharmacocinétique et galénique ! 

 

Les enzymes qu'on choisit sont bamH1 et Xho1 donc tu regardes sur ton fragment et sur ton plasmide ou tu ouvres et ce que tu vas enlever et rajouter 

 

Sur le fragment on a bamH1 670 et Xho1 1300 : pour savoir ce que tu rajoutes tu fais la différence, ici tu ajoutes 630 pb 

 

Sur le plasmide on a bamH1 1350 et Xho1 1400 : pour savoir ce que tu enlèves tu fais la différence, ici tu enlèves 50 pb

 

Ensuite tu prends le nombre de paire de base de ton plasmide de base et tu fais le calcul, ici ça nous donne : 6200 - 50 + 630 = 6780 pb

Salut je me permets d'intervenir ! 

Je ne comprends pas bien pourquoi on enlève "50" est-ce que vous pouvez m 'expliquer svp

Posted

Dans cette situation on voit qu'on utilise 2 enzymes de restriction différentes pour couper et insérer le fragment dans notre plasmide. 

Donc quand on coupe le plasmide on va avoir 2 bouts de plasmide : un petit de 50 pb et un grand de 6150 pb

Vu la taille du petit il ne nous sert pas à grand chose donc on va juste garder notre grand morceau pour y insérer le fragment. 

 

Je sais pas si c'est hyper clair donc dis moi si tu veux que j'explique plus en détail que ça  @Marmotte

  • Ancien du Bureau
Posted
il y a 5 minutes, emylyyy a dit :

Dans cette situation on voit qu'on utilise 2 enzymes de restriction différentes pour couper et insérer le fragment dans notre plasmide. 

Donc quand on coupe le plasmide on va avoir 2 bouts de plasmide : un petit de 50 pb et un grand de 6150 pb

Vu la taille du petit il ne nous sert pas à grand chose donc on va juste garder notre grand morceau pour y insérer le fragment. 

 

Je sais pas si c'est hyper clair donc dis moi si tu veux que j'explique plus en détail que ça  @Marmotte

Ah oui ok j'avais pas vu ça comme ça je crois que  j'ai compris je vais essayer d'en faire d'autres !

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