pHi

[Mamamia]

Bonjour, 

je comprends pas pourquoi à l'item D on ne compte pas l'acide glutamique dans le calcul du pHi? J'avais fait le tableau avec le passage d'étape en étape avec les valeurs des pKa concernés (j'ai obtenu pHi=6,6)mais là ils ne semblent prendre en compte que l'histidine.

https://docs.google.com/document/d/1ntU_9wFDx91RFSVhJ0KDIfcYeYwusuyqm-kb7tqWbII/edit?usp=sharing

merci par avance :))

[Insolence]

Coucou @Maheva_med!

 

Je vais bien expliciter la résolution pour que tu comprennes :

 

MEHQK : Met-Glu-His-Gln-Lys

 

Les AA qui nous intéressent :

Met : pKb = 9.5 (N terminal) → charge [0 : 1+]

Glu : pKr = 4.1 → charge [1- : 0]

His : pKr = 6.1→ charge [0 : 1+]

Lys : pKa = 2.1 & pKr = 10.5 (C terminal) → charge [1- : 1+]

La charge de MEHQK peut aller de 2- à 3+.

 

Si on fait varier le pH :

 

à pH < 2.1 :

Met : 1+

Glu : 0

His : 1+

Lys : 1+

 

à 4.1< pH < 6.1 :

Met : 1+

Glu : 1-

His : 1+

Lys : 0

 

à 6.1< pH < 9.5 :

Met : 1+

Glu : 1-

His : 0

Lys : 0

 

On observe que la charge totale du peptide est neutre entre ces deux pH. Ainsi pHi = (6.1 + 9.5)/2 = 7.8

 

C'est plus clair ?

 

Edited December 3, 2022 by Insonoëlence

[Fabulo]

Méthode ancestrale de @Insolence, la technique parfaite pour réussir à coup sûr 

[Mamamia]

Le 29/11/2022 à 13:40, Insonoëlence a dit :

Met : pKb = 9.5 (N terminal) → charge [0 : 1+]

Donc là on compte le Met parce qu'il est en début (alors que s'il était au milieu il ne serait pas compté car neutre)?

Le 29/11/2022 à 13:40, Insonoëlence a dit :

Lys : pKa = 2.1 & pKr = 12.5 (C terminal) → charge [1- : 1+]

Je croyais que pour les basiques on ne faisait que (pKb + pKr)/2 

Le 29/11/2022 à 13:40, Insonoëlence a dit :

[1- : 1+]

je comprends pas la notation entre crochets à chaque fois TT

https://docs.google.com/document/d/1ENfnjdFpEU_fwYGj41E-HkgD5Tqz_hcxzrMzPGXy4rs/edit?usp=sharing

je faisais avec un tableau comme ça (en adaptant les fonctions à gauche selon l'énoncé)

Le 29/11/2022 à 13:40, Insonoëlence a dit :

pKr = 12.5 (C terminal)

je comprends pas non plus pourquoi on compte le noyau guanidium alors qu'il n'y a pas d'Arginine ^^'

[Insolence]

Coucou @Maheva_med!

Il y a 2 heures, Maheva_med a dit :

Donc là on compte le Met parce qu'il est en début (alors que s'il était au milieu il ne serait pas compté car neutre)?

Exactement

 

Il y a 2 heures, Maheva_med a dit :

Je croyais que pour les basiques on ne faisait que (pKb + pKr)/2 

Ca c'est pour calculer le pHi d'un AA.

 

Il y a 2 heures, Maheva_med a dit :

je comprends pas la notation entre crochets à chaque fois TT

 

C'est juste les charges de l'AA suivant le pH. je peux te refaire l'explication sous forme de tableau si c'est plus clair pour toi.

 

Il y a 2 heures, Maheva_med a dit :

je comprends pas non plus pourquoi on compte le noyau guanidium alors qu'il n'y a pas d'Arginine ^^'

Ptdrrr alors là c'est juste une énorme erreur de ma part et heureusement ça n'interfère pas avec le calcul. Je corrige ça de suite !! Bien vu ;)

[Mamamia]

Le 03/12/2022 à 13:23, Insonoëlence a dit :

C'est juste les charges de l'AA suivant le pH. je peux te refaire l'explication sous forme de tableau si c'est plus clair pour toi.

Oui je veux bien ^^' ça m'aiderait pas mal

merci beaucoup pour ton aide!

[Insolence]

Re @Maheva_med!

Je t'ai fait ce schéma :

J'espère que ça va t'éclaircir un peu :) 

 

Si ça ne t'aide pas n'hésite pas à me le dire 

[Mamamia]

Le 04/12/2022 à 22:28, Insonoëlence a dit :

Re @Maheva_med!

Je t'ai fait ce schéma :

J'espère que ça va t'éclaircir un peu :) 

 

Si ça ne t'aide pas n'hésite pas à me le dire 

aaah ça y est c'est bon j'ai refait en recroisant les différentes méthodes et c'est bon j'ai compris merciiii

il y a 1 minute, Maheva_med a dit :

aaah ça y est c'est bon j'ai refait en recroisant les différentes méthodes et c'est bon j'ai compris merciiii

ça m'aura pris du temps ^^' merci beaucoup