Annale Génome 2012 QCM 23

[ArtiPasChaud]

Bonjour ! J'ai du mal à comprendre pourquoi l'amorce C est fausse , quelqu'un aurait bien l'amabilité de m'expliquer.

 

[eleonorecartry]

Coucou @ArtiPasChaud,

la première amorce de l’item C est juste c’est la deuxième qui est fausse, en effet si on écrit sa complémentaire on obtient : 5’ TTGTAACAGCTGCT 3’ et qu’on la retourne ( 5’ -> 3’ en 3’ -> 5’) on a 3’ TCGTCGACAATCTT 5’. Et on ne retrouve pas cette séquence dans le la deuxième partie du brin codant cette amorce est donc fausse. 

Si c’est pas très clair n’hésite pas a me le dire sinon le TAT a une fiche qui est vraiment bien pour ce type de QCM : https://tutoweb.org/PDFs/Librairie/Innovations Pédagogiques/PASS/Semestre 1/UE 1 - GENOME/S1 - Fiche Astuce - PASS - Genome (Déterminer les amorces).pdf

 

bon courage 

[Cassolnousmanque2]

Coucou @ArtiPasChaud, 

Déjà avant tout, je te conseille aussi d'aller voir la fiche qui t'explique comment trouver des amorces 

 

Je reprends l'item C ici : 

Tu as la séquence d'ADN suivante :

5' GTAAAGGAGAAGAACTTTTCACTGGAGTT ... // ... GAGTTTGTAACAGCTGCTGGGATTTCACTA 3' 

 

Comment faire face à ce type de qcm ? Je reprends la méthode et si tu la suis (en complément de la fiche) tu devrais arriver à résoudre ce type de qcm à chaque fois : 

 

1) J'écris mon complémentaire (A en face de T, T en face de A, C en face de G, G en face de C)

 

5' GTAAAGGAGAAGAACTTTTCACTGGAGTT ... // ... GAGTTTGTAACAGCTGCTGGGATTTCACTA 3' 

3' CATTTCCTCTTCTTGAAAAGTGACCTCAA ... // ... CTCAAACATTGTCGACGACCCTAAAGTGAT 5' 

 

2) Je réfléchis à quel endroit mes amorces peuvent se fixer : Je sais que les extrémités 5' font TOUJOURS face à des extrémités 3' donc je vérifie que j'ai bien orienté mon brin 

-> ici c'est bon

 

Je sais donc que mes amorces doivent suivre cette même règle pour pouvoir se fixer donc je regarde comment elles sont orientées (je sais qu'on insiste beaucoup sur l'orientation des brins et des amorces mais c'est super important et si vous ne le faites pas vous avez énormément de chances de vous tromper dans les qcm)

 

Ici mes amorces peuvent se fixer comme ça : 

Amorce 1 : 5' ......... 3' 

Amorce 2 : 5' ..........3' 

 

5' GTAAAGGAGAAGAACTTTTCACTGGAGTT ... // ... GAGTTTGTAACAGCTGCTGGGATTTCACTA 3' 

                                                                                                                                           <-    3' ........ 5' (amorce 2)

5' ......... 3'  (amorce 1) -> 

3' CATTTCCTCTTCTTGAAAAGTGACCTCAA ... // ... CTCAAACATTGTCGACGACCCTAAAGTGAT 5' 

 

(les flèches représentent le sens de polymérisation) 

 

ou 

 

5' GTAAAGGAGAAGAACTTTTCACTGGAGTT ... // ... GAGTTTGTAACAGCTGCTGGGATTTCACTA 3' 

                                                                                                                                           <-    3' ........ 5' (amorce 1)

5' ......... 3'  (amorce 2) -> 

3' CATTTCCTCTTCTTGAAAAGTGACCTCAA ... // ... CTCAAACATTGTCGACGACCCTAAAGTGAT 5' 

 

(les flèches représentent le sens de polymérisation) 

 

Donc si on revient au qcm item C : 

Amorce 1 : 5' AAGGAGAAGAACTTT 3' 

Amorce 2 : 5' AACATTGTCGACGA 3' 

 

Donc on reprend toujours le même schéma : 

 

5' GTAAAGGAGAAGAACTTTTCACTGGAGTT ... // ... GAGTTTGTAACAGCTGCTGGGATTTCACTA 3' 

                                                                                       <- 3' AACATTGTCGACGA 5'               

      5' AAGGAGAAGAACTTT 3' ->

3' CATTTCCTCTTCTTGAAAAGTGACCTCAA ... // ... CTCAAACATTGTCGACGACCCTAAAGTGAT 5' 

 

Le piège ici ce n'était pas la séquence de la deuxième amorce qui est bien complémentaire au brin du haut (donc correspond au brin du bas), mais c'était l'orientation !!!!! Elle était orientée 5'->3' au lieu de 3'->5' 

 

Attention à ce type de piège qui est très très fréquent 

 

Est-ce que tu comprends mieux ou pas, n'hésite pas à nous dire si tu as encore des difficultés, ce type de question tombe tous les ans alors il faut que tu t'assures les points là dessus !! 

 

Bon courage tu vas y arriver, t'es un Warrior

 

[ArtiPasChaud]

Merci pour vos réponses ! J'ai tout compris maintenant. En fait j'avais réussi à faire la procédure sans vraiment comprendre pour la B. Pour la C j'avais vu que l'amorce 1 était la même. Mais par contre j'avais pas fait attention au "5' 3' " de la seconde amorce de la C , ce qui fausse tout... 

Tout est bien clair maintenant.

 

Merci beaucoup la team génome !

(meilleure matière btw)

Bonne journée à vous  !