calcul du Pi dun peptide

[JenesaisPASS]

saluuut

excusez moi  je poste ce msg car jsp comment calculer le Pi d'un peptide pr litem D et je comprends pas la correction non plus, pourriez-vous maider svp? merci beaucoup davance :))

 

 

https://zupimages.net/viewer.php?id=22/43/80it.png

 

https://zupimages.net/viewer.php?id=22/43/yj6n.png

[Pucca]

Salut @lilmkf,

Dans ton peptide seul Glu est chargé donc c'est lui qui nous intéresse pour le pHi du peptide.

Tu peux donc classer les pK des fonctions donc en reprenant la correction :

-à +1 c'est à dire que Glu est chargé 1 fois positivement, donc le groupement alpha carboxylique a été ionisé (normalement on te le donne dans l'énoncé pK = 2,1)

-à 0 c'est-à-dire forme Zwitterion donc neutre, c'est la référence pour choisir les pK à utiliser pour la calcul du pHi du peptide (tu prends les 2 pK entourant cette forme)

-à +1 c'est à dire Glu chargé 1 fois négativement, donc le groupement gamma carboxylique a été ionisé (là aussi on te le donne normalement pK =4)

-à +2 c'est-à-dire Glu chargé 2 fois négativement, donc le groupement alpha aminé a été ionisé (pK=9,3)

 

Donc pour le calcul final tu prends les pK entourant la forme Zwitterion soit : (2,1+4)/2 = 3,05

 

 

Voilà j'espère que c'est plus clair pour toi, n'hésite pas si jamais !

Edited October 30, 2022 by Pucca

[JenesaisPASS]

  On 10/30/2022 at 12:27 PM, Pucca said:

Salut @lilmkf,

Dans ton peptide seul Glu est chargé donc c'est lui qui nous intéresse pour le pHi du peptide.

Tu peux donc classer les pK des fonctions donc en reprenant la correction :

-à +1 c'est à dire que Glu est chargé 1 fois positivement, donc le groupement alpha carboxylique a été ionisé (normalement on te le donne dans l'énoncé pK = 2,1)

-à 0 c'est-à-dire forme Zwitterion donc neutre, c'est la référence pour choisir les pK à utiliser pour la calcul du pHi du peptide (tu prends les 2 pK entourant cette forme)

-à +1 c'est à dire Glu chargé 1 fois négativement, donc le groupement gamma carboxylique a été ionisé (là aussi on te le donne normalement pK =4)

-à +2 c'est-à-dire Glu chargé 2 fois négativement, donc le groupement alpha aminé a été ionisé (pK=9,3)

 

Donc pour le calcul final tu prends les pK entourant la forme Zwitterion soit : (2,1+4)/2 = 3,05

 

 

Voilà j'espère que c'est plus clair pour toi, n'hésite pas si jamais !

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merci bcp pr cette explication, je comprends maintenant mais comment sais tu que seul le Glu est chargé? tous (les 20) les acides aminés sont chargés normalement non? en tout cas a differents pH?

[Pucca]

  On 10/31/2022 at 7:57 AM, lilmkf said:

merci bcp pr cette explication, je comprends maintenant mais comment sais tu que seul le Glu est chargé? tous (les 20) les acides aminés sont chargés normalement non? en tout cas a differents pH?

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Oui mais en fait quand tu cherches à calculer le pHi du peptide, tu veux savoir à quel pH le peptide a une charge nulle.

Donc tu sais grâce à la classification que vous avez vu en cours que Lys, Arg et His (His ayant un pHi plus neutre) sont des AA polaires chargés + et que Glu et Asp sont polaires chargés -.

Tous les autres sont soit apolaires, soit polaires non chargés, donc leur pHi tourne autour de 7 (ils sont sous forme neutre à environ pH=7).

C'est pour ça que ce qui influence surtout le pHi d'un peptide, ce sont les polaires chargés, sinon le pHi du peptide serait environ à 7 et pas besoin de faire de calcul.

 

J'espère que tu as mieux compris tout ça  :)

[JenesaisPASS]

  On 10/31/2022 at 8:37 AM, Pucca said:

 

Oui mais en fait quand tu cherches à calculer le pHi du peptide, tu veux savoir à quel pH le peptide a une charge nulle.

Donc tu sais grâce à la classification que vous avez vu en cours que Lys, Arg et His (His ayant un pHi plus neutre) sont des AA polaires chargés + et que Glu et Asp sont polaires chargés -.

Tous les autres sont soit apolaires, soit polaires non chargés, donc leur pHi tourne autour de 7 (ils sont sous forme neutre à environ pH=7).

C'est pour ça que ce qui influence surtout le pHi d'un peptide, ce sont les polaires chargés, sinon le pHi du peptide serait environ à 7 et pas besoin de faire de calcul.

 

J'espère que tu as mieux compris tout ça  :)

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aaaah j'ai compris, merci davoir pris du temps je te souhaite une bonne journée

[Pucca]

  On 10/31/2022 at 8:46 AM, lilmkf said:

aaaah j'ai compris, merci davoir pris du temps je te souhaite une bonne journée

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Super, avec plaisir ! Bonne journée à toi aussi