QCM 16 ccb 2021

[CaPASSkrèm]

Saluuut

 

Je ne comprends pas ce QCM, le QCM 16 du ccb de cette année. Est ce que quelqu’un pourrait m’aider ? 
 

 

Merciiii à la gentille personne qui prendra de son temps pour me répondre

[SBY]

Hello @CaPASSkrèm ! 

 

A. L'épissage se fait sur l'ARN donc le splicéosome va se fixer sur un ADENYLATE en 3' et non un désoxyadénylte. Donc faux

B. Vrai c'est du cours. 

 

Pour les items C, D et E, il faut déterminer les exons/introns puis les codons. 

On sait que les introns commencent par GU et se terminent par AG. Donc on les retrouve au niveau des séquences gt....//.....ag.

On a donc : 

Exon 1 : 5'...GGCT CAG

Exon 2 : AAGTCGGGGACTTCCTCTCCCTGGACCTGGGTGGCACTAACTTCAGGGTGATGCTGGTGAAGGTGGGAGAAGGTGAGGAGGGGCAGTG

GAGCGTGAAGACCAAACACCAGATGTACTCCATCCCCGAGGACGCCATGACCGGCACTGCTGAGATG

Exon 3 : CTCTTC...3'

 

Pour déterminer le découpage des exons, il fallait utiliser une information qu'il y avait dans l'énoncé : ''le motif protéique VGDFLSL est codé par l'exon 2'' 

VGDFLSL correspond à la séquence : Val-Gly-Asp-Phe-Leu-Ser-Leu

Ici, au final c'était assez simple puisqu'on retrouvait la séquence au début de l'exon donc on perd pas beaucoup de temps à chercher.

Maintenant, reste plus qu'à découper notre exon 2. En violet, j'ai mis la séquence de l'énoncé. 

 

AA GTC GGG GAC TTC CTC TCC CTG GAC CTG GGT GGC ACT AAC TTC AGG GTG ATG CTG GTG AAG GTG GGA GAA GGT GAG GAG GGG CAG TGG 

       Val - Gly -Asp- Phe- Leu- Ser-Leu-Asp-Leu-Gly- Gly- Thr - Asn- Phe- Arg- Val- Met-Leu- Val - Lys-  Val- Gly - Glu - Gly-  Glu- Glu- Gly-  Gln-  Trp- 

AGC GTG AAG ACC AAA CAC CAG ATG TAC TCC ATC CCC GAG GAC GCC ATG ACC GGC ACT GCT GAG ATG

Ser- Val-  Lys- Thr-  Lys-  His-  Gln- Met- Tyr- Ser- Ile-  Pro- Glu- Asp - Ala - Met- Thr-  Gly-  Thr- Ala- Glu- Met

 

C. En ayant fait le bon découpage des codons, on peut voir que les deux premiers nt de l'exon 2 formeront un codon avec le dernier nt de l'exon 1 (l'intron 1 était donc un intron de phase 1).

Donc le dernier codon entièrement contenu dans l'exon 1 sera TCA qui code pour une sérine et non une glutamine ! L'item est donc faux

 

D. Faux l'ARNt initiateur n'intervient que pour la traduction du codon d'initiation. Pour les AUG à l'intérieur de la séquence, ce sera un ARNt différent qui interviendra. 

 

E. Le peptide DLGGTNF correspond à la séquence Asp-Leu-Gly-Gly-Thr-Asn-Phe que l'on retrouve bien au niveau de l'exon 2 (en bleu).

 

AA GTC GGG GAC TTC CTC TCC CTG GAC CTG GGT GGC ACT AAC TTC AGG GTG ATG CTG GTG AAG GTG GGA GAA GGT GAG GAG GGG CAG TGG 

       Val - Gly -Asp- Phe- Leu- Ser-Leu-Asp-Leu-Gly- Gly- Thr - Asn- Phe- Arg- Val- Met-Leu- Val - Lys-  Val- Gly - Glu - Gly-  Glu- Glu- Gly-  Gln-  Trp- 

AGC GTG AAG ACC AAA CAC CAG ATG TAC TCC ATC CCC GAG GAC GCC ATG ACC GGC ACT GCT GAG ATG

Ser- Val-  Lys- Thr-  Lys-  His-  Gln- Met- Tyr- Ser- Ile-  Pro- Glu- Asp - Ala - Met- Thr-  Gly-  Thr- Ala- Glu- Met

 

Donc l'item est bien vrai. 

 

 

Et voilàààà j'espère que c'est plus clair pour toi ! 

Bon courage pour cette dernière ligne droite 

[CaPASSkrèm]

Il y a 13 heures, SBY a dit :

Hello @CaPASSkrèm ! 

 

A. L'épissage se fait sur l'ARN donc le splicéosome va se fixer sur un ADENYLATE en 3' et non un désoxyadénylte. Donc faux

B. Vrai c'est du cours. 

 

Pour les items C, D et E, il faut déterminer les exons/introns puis les codons. 

On sait que les introns commencent par GU et se terminent par AG. Donc on les retrouve au niveau des séquences gt....//.....ag.

On a donc : 

Exon 1 : 5'...GGCT CAG

Exon 2 : AAGTCGGGGACTTCCTCTCCCTGGACCTGGGTGGCACTAACTTCAGGGTGATGCTGGTGAAGGTGGGAGAAGGTGAGGAGGGGCAGTGGAGCGTGAAGACCAAACACCAGAT

              GTACTCCATCCCCGAGGACGCCATGACCGGCACTGCTGAGATG

Exon 3 : CTCTTC...3'

 

Pour déterminer le découpage des exons, il fallait utiliser une information qu'il y avait dans l'énoncé : ''le motif protéique VGDFLSL est codé par l'exon 2'' 

VGDFLSL correspond à la séquence : Val-Gly-Asp-Phe-Leu-Ser-Leu

Ici, au final c'était assez simple puisqu'on retrouvait la séquence au début de l'exon donc on perd pas beaucoup de temps à chercher.

Maintenant, reste plus qu'à découper notre exon 2. En violet, j'ai mis la séquence de l'énoncé. 

 

AA GTC GGG GAC TTC CTC TCC CTG GAC CTG GGT GGC ACT AAC TTC AGG GTG ATG CTG GTG AAG GTG GGA GAA GGT GAG GAG GGG CAG TGG 

       Val - Gly -Asp- Phe- Leu- Ser-Leu-Asp-Leu-Gly- Gly- Thr - Asn- Phe- Arg- Val- Met-Leu- Val - Lys-  Val- Gly - Glu - Gly-  Glu- Glu- Gly-  Gln-  Trp- 

AGC GTG AAG ACC AAA CAC CAG ATG TAC TCC ATC CCC GAG GAC GCC ATG ACC GGC ACT GCT GAG ATG

Ser- Val-  Lys- Thr-  Lys-  His-  Gln- Met- Tyr- Ser- Ile-  Pro- Glu- Asp - Ala - Met- Thr-  Gly-  Thr- Ala- Glu- Met

 

C. En ayant fait le bon découpage des codons, on peut voir que les deux premiers nt de l'exon 2 formeront un codon avec le dernier nt de l'exon 1 (l'intron 1 était donc un intron de phase 1).

Donc le dernier codon entièrement contenu dans l'exon 1 sera TCA qui code pour une sérine et non une glutamine ! L'item est donc faux

 

D. Faux l'ARNt initiateur n'intervient que pour la traduction du codon d'initiation. Pour les AUG à l'intérieur de la séquence, ce sera un ARNt différent qui interviendra. 

 

E. Le peptide DLGGTNF correspond à la séquence Asp-Leu-Gly-Gly-Thr-Asn-Phe que l'on retrouve bien au niveau de l'exon 2 (en bleu).

 

AA GTC GGG GAC TTC CTC TCC CTG GAC CTG GGT GGC ACT AAC TTC AGG GTG ATG CTG GTG AAG GTG GGA GAA GGT GAG GAG GGG CAG TGG 

       Val - Gly -Asp- Phe- Leu- Ser-Leu-Asp-Leu-Gly- Gly- Thr - Asn- Phe- Arg- Val- Met-Leu- Val - Lys-  Val- Gly - Glu - Gly-  Glu- Glu- Gly-  Gln-  Trp- 

AGC GTG AAG ACC AAA CAC CAG ATG TAC TCC ATC CCC GAG GAC GCC ATG ACC GGC ACT GCT GAG ATG

Ser- Val-  Lys- Thr-  Lys-  His-  Gln- Met- Tyr- Ser- Ile-  Pro- Glu- Asp - Ala - Met- Thr-  Gly-  Thr- Ala- Glu- Met

 

Donc l'item est bien vrai. 

 

 

Et voilàààà j'espère que c'est plus clair pour toi ! 

Bon courage pour cette dernière ligne droite 

Une réponse vraiment génialeeee !! Mercii beaucoup @SBY 

[Hugoccipital]

Salut je viens de reprendre ce QCM et j'ai une petite interrogation ! Je pensais qu'on devait considérer les protéines lors de la traduction qu'à partir un codon ATG, pourtant là, le motif est avant le codon initiateur ???

Merci !!

[SBY]

Hello @Hugoméostasie ! 

 

Ici pour nous repérer on avait la séquence protéique donnée dans l'énoncé.

Il ne fallait pas se baser sur l'AUG.  Il doit sûrement se trouver au niveau de l'exon 1 mais sa séquence n'est pas donnée en entière.

Si aucune séquence protéique n'est donnée, tu peux essayer de trouver le codon d'initiation. Mais tu auras toujours une information pour t'aider. 

 

J'espère que c'est plus clair pour toi ! 

Bon courage 

 

[Hugoccipital]

Ok Merci beaucoup !