Traduction

[Pistache]

Hello,

Je ne comprends pas le mécanisme de ces schémas et ce qu’il y a d’important à retenir, si possible j’aimerais une explication avec un petit recap ! 

merci d’avance Archiver.zip

Le nouveau lien : car l’autre ne marchait pas compresse pass.pdf

[mrg]

Salut! @Pistache

 

Pour la traduction chez les procaryotes:

1. Ton premier schéma concerne l'initiation de la traduction:

 

La traduction débute par la formation d’un complexe d’initiation entre la petite sous-unité ribosomique(30S), le fMet-ARNt et l’ARNm. Cet assemblage est catalysé par plusieurs facteurs d’initiations IF et par le GTP:

–Le facteur IF-3 se fixe à la sous-unité 30S, ce qui permet la dissociation des deux sous-unités.

–Les facteurs IF-1 et IF-2 se fixent à la sous-unité 30S déjà liée à IF-3 : IF-2 lie le GTP et c’est lui qui reconnait l’ARNt portant la méthionine formylée, alors que l’IF-1 facilite le travail des deux autres facteurs.

 

La séquence Shine Dalgarno en amont de l’AUG permet le positionnement du complexe 30S/fMet-ARNt/IF-3/GTP sur l’ARNm, c'est à dire:

- ARNt 1 chargé par AA 1 = fmet (toujours fmet comme premier AA procaryote!!)

– petite sous unité du ribosome (30S)

– ARNm (codon)
– Facteurs d'initiation + GTP

 

IF-3 quitte le complexe d’initiation dès lors que celui-ci commence alors à scanner l’ARNm, Lors que le complexe arrive au codon AUG, la grande sous-unité (50S) s’associe pour former le ribosome (70S), le fMet-ARNt se situe alors au niveau du site P du ribosome. IF-2 hydrolyse son GTP en GDP ce que permet le départ d’IF1 et d’IF2-GDP.

 

 

La grande sous unité sous-unité 50S peut alors venir s’associer à l’unité 30S pour former le complexe d’initiation 70S : Ribosome

 

Un ribosome se compose de 3 sites successifs :

- Le A : lieu de fixation des ARNt porteurs de l’AA correspondant au codon.

- Le P : lieu d’élongation de la chaîne d’AA permise par la peptidyl transférase.

- Le E : lieu de libération de l’ARNt. Lors de l'initiation, le premier ARNt (AUG = fmet) se positionne directement sur le site P.

 

2. Ton second schéma concerne l'élongation:

 

Dans cet exemple, la fMet s’enchaîne avec une Arg.

 

Lorsque l’ARNt porteur de l’Arg est arrivé au niveau du site A, la fMet va passer dans le centre de la peptidyl-transférase (ne pas confondre avec site P) pour catalyser la formation de la 1 ère liaison peptidique de la chaîne entre ces 2 premiers AA. En même temps que la liaison se forme, il va y avoir déplacement de l’ARNt déchargé de la f-Met au site E où il sera libéré et déplacement de l’Arg (et du peptide) de A vers P (nécessite EF-G + GTP) : on parle de translocation (le ribosome se décale d'un codon) Ainsi, le site A est de nouveau libre pour accueillir le prochain ARNt, et ainsi de suite, jusqu'au codon STOP.

 

Retiens qu'il y a une exception pour le codon initiateur de la traduction qui ne passe pas dans le site A mais directement dans le site P du ribosome.

 

 

 

3. Le dernier schéma concerne la terminaison:

 

Il existe 3 codons STOP : UAA / UGA / UAG.

=> il n’y a pas d’anti-codons d’ARNt reconnaissant un codon STOP. C’est pour cela que lorsque l’on atteint le 1 er codon STOP de la chaîne, aucun ARNt ne pourra venir se fixer au site A du ribosome.

C’est une protéine spécifique dont la forme ressemble à celle d’un ARNt qui va venir se placer dans le site A : c’est le RF (Release Factor = facteur de libération) . Le RF est associé à un GTP. Il entraîne au niveau du centre de la peptidyl transférase une dernière réaction chimique : ajout d'une molécule d'eau au dernier AA, c'est à dire, hydrolyse la liaison peptide-ARNt et forme la terminaison COOH.

=> libération de la chaîne peptidique formée et des 2 sous-unités ribosomales qui pourront être réutilisées ultérieurement.

 

 

Voilà j'espère que c'est plus clair!!!

Bon courage!

 

Edited November 6, 2021 by mrg

[Pistache]

C'est parfait je vais tout reprendre merci d'avoir pris le temps pour moi !