comment recopier un brin complémentaire

[axolotldu84]

bonjour !

je suis désespérée je ne comprend comment on fait pour recopier un brin complémentaire pour savoir si les amorces sont vraies ou fausses... 

quelqu'un pourrait me l'expliquer ? 

si vous voulez un support : 

merci beaucoup !

[Cha31170]

coucou, 

je te renvoie à cette fiche, si tu as toujours des problèmes reviens me voir  

 

 

[axolotldu84]

oui je l'avais vu ! mais je ne comprend pas comment on fait....

comment on fait l'amorce 2, elle n'a rien a voir avec celle qu'on a... je suis paumée

[SBY]

Hello @axolotdu84 ! 

Je vais essayer de t'éclairer du mieux que je peux. 

 

Quand on fait une PCR, deux amorces sont nécessaires :

- une amorce sens qui s'hybridera avec le brin anti-sens (orienté 3'-5') et qui aura donc la même séquence que le brin sens soit celle proposée dans l'énoncé.   

- une amorce anti-sens qui s'hybride avec le brin sens (orienté 5'-3') et aura donc la même séquence que le brin anti-sens, complémentaire au brin proposé dans l'énoncé.

Pour vous faciliter les choses, Bettina vous mettra toujours en première amorce l'amorce sens et en deuxième l'amorce anti-sens. Elle n'inversera pas les deux.  

Tu vois bien ce que je raconte sur ce schéma : 

 

Quand tu es face à ce genre de QCM, ce que je te conseille de faire pour commencer, c'est d'écrire le brin complémentaire à celui donné dans l'énoncé. D'ailleurs très souvent, pour pas dire toujours, ce sera le brin sens qui vous sera donné. Ici, ça nous donne ça : 

5' CGTACCGTACCTATAGCTACTAGTGTCTAGTTCGA // GCATCCCAATGTGACGTTGCATGATGTGTCTCAG 3' 

3' GCATGGCATGGATATCGATGATCACAGATCAAGCT // CGTAGGGTTACACTGCAACGTACTACACAGAGTC 5'

 

Pour l'item A : 

5' CGTACCGTACCTATAGCTACTAGTGTCTAGTTCGA // GCATCCCAATGTGACGTTGCATGATGTGTCTCAG 3' 

3' GCATGGCATGGATATCGATGATCACAGATCAAGCT // CGTAGGGTTACACTGCAACGTACTACACAGAGTC 5'

Tu vois ici, que la deuxième amorce ne fonctionne pas car on devrait la retrouver au niveau de l'autre brin ! Donc faux. 

 

Item B : 

5' CGTACCGTACCTATAGCTACTAGTGTCTAGTTCGA // GCATCCCAATGTGACGTTGCATGATGTGTCTCAG 3' 

3' GCATGGCATGGATATCGATGATCACAGATCAAGCT // CGTAGGGTTACACTGCAACGTACTACACAGAGTC 5'

Pour la deuxième amorce, bien faire attention à l'orientation. Mon brin anti-sens est orienté 3'-5' ici et elle est donnée de 5' vers 3' dans l'item. Il faut donc lire la séquence de droite ou à gauche. 

Ici, pour ce couple d'amorce, tu vois que ca respecte toutes les conditions que je t'ai expliqué plus haut. Donc vrai. 

 

Item C : 

5' CGTACCGTACCTATAGCTACTAGTGTCTAGTTCGA // GCATCCCAATGTGACGTTGCATGATGTGTCTCAG 3' 

3' GCATGGCATGGATATCGATGATCACAGATCAAGCT // CGTAGGGTTACACTGCAACGTACTACACAGAGTC 5'

Ici aussi les deux amorces fonctionnent.

 

Voilà j'espère t'avoir aidé ! 
Force à toi pour le CCB 

[axolotldu84]

ok merci, je viens de comprendre ! 

vraiment merci bcp (je sais que vous vous repetez souvent mais pour le coup je faisais un blocage...) 

encore merci et bonne soirée !

[SBY]

il y a 58 minutes, axolotdu84 a dit :

ok merci, je viens de comprendre ! 

vraiment merci bcp (je sais que vous vous repetez souvent mais pour le coup je faisais un blocage...) 

encore merci et bonne soirée !

Aucun soucis on est là pour ça ! L'essentiel c'est que t'aies compris ! 

Bonne soirée à toi aussiiii !