Le métabolisme (my BFF)

[CaPASSkrèm]

Saluuut

 

Alors déjà, veuillez m’excuser pour la longueur de ce message et pour les questions sûrement bêtes qui y sont inscrites

 

Suite au cours de ce matin sur le métabolisme, j’ai quelques questions :

 

Je ne comprends pas cette diapo (https://ibb.co/yN9Fnnc) :

• Je ne comprends pas à quel moment de la glycolyse cette réaction ce passe. Est ce qu’elle se passe à la fin de la glycolyse, après la formation du pyruvate ? Pourquoi créer du lactate et du NAD+ pour enlever le pyruvate alors que le but initial est d’avoir du pyruvate et du NADH non ?
• D’ailleurs à quoi sert le NADH et le FADH2 ? (J’ai pas fait spé SVT en terminale (pire erreur de ma vie mais passons) donc je suis un peu perdue avec tout ces trucs )

 

Pour l’étape 3 de la glycolyse (https://ibb.co/NCXyCqj

• Je ne comprends pas pourquoi on multiplie par 2 la réaction

 

Pour la réaction avec le pyruvate d’héshydrogénase (diapo 10-16):

• Est ce que cette réaction est juste avant le cycle de Krebs pour conditionner le pyruvate en acétyl coa ?

 

Pour ces deux diapos : https://ibb.co/445RhpW

• Je ne comprends pas du tout à quoi servent ces réactions car suite à l’action de la l’enzyme pyruvate deshydrogénase le pyruvate est déjà transformé en acétyl COA donc déjà conditionné pour le cycle de Krebs non ?

 

Dernière petite question (promis) :

• La prof nous a dit qu’il y avait des réactions à ne pas apprendre du coup on doit vraiment pas les apprendre ou on doit qu’ a meme connaitre qui se transforme en quoi grace à telle enzyme ? Ou alors doit juste savoir qui se transforme en quoi sans détails ? Ou alors rien du tout on doit juste bine connaitre celles qu'elles nous a dit ?

 

J’espère avoir été claire dans mes 46000 questions mdr

 

Merciiiiiiiiii à la personne qui prendra de son temps pour me répondre

[Dr_Zaius]

1 hour ago, CaPASSkrèm said:

Je ne comprends pas cette diapo (https://ibb.co/yN9Fnnc) :

 

1 hour ago, CaPASSkrèm said:

Je ne comprends pas à quel moment de la glycolyse cette réaction ce passe. Est ce qu’elle se passe à la fin de la glycolyse, après la formation du pyruvate ? Pourquoi créer du lactate et du NAD+ pour enlever le pyruvate alors que le but initial est d’avoir du pyruvate et du NADH non ?

Alors à ce moment on parlait de la glycolyse anaérobie qui a lieux par exemple en situation de sprint (pas le temps pour l’oxygène) pour faire de l’ATP. Une partie du pyruvate est certes perdu en lactate comme tu l'a bien remarqué mais gace à la régéneration du NAD+ qui va permettre la synthèse de l'ATP nécessaire à notre sprint suivant l'équation :

Glucose + 2 Pi + 2ADP + 2 NAD+ -> 2 pyruvate + 2ATP + 2NADH + 2H+ + 2H2O

1 hour ago, CaPASSkrèm said:

D’ailleurs à quoi sert le NADH et le FADH2 ? (J’ai pas fait spé SVT en terminale (pire erreur de ma vie mais passons) donc je suis un peu perdue avec tout ces trucs )

Ils sont des cofacteurs nécessaires au enzymes comme on l'a vu dans le cours avec Ausseuil sur l'enzymologie.

 

1 hour ago, CaPASSkrèm said:

Pour l’étape 3 de la glycolyse (https://ibb.co/NCXyCqj

• Je ne comprends pas pourquoi on multiplie par 2 la réaction

Alors il faut reprendre la diapo précédente qui montre les enzymes de la réaction 1. Et tu vois qu'à la fin tu abouti au dihydroxyacétone phosphate  et au glycéraldéhyde 3 phosphate -> On multiplie donc par 2 par la suite car d'abord le glycéraldéhyde 3 phosphate va permettre la synthèse de deux ATP sur la partie droite de la diapo ! Mais ensuite le dihydroxyacétone phosphate va être transformé en glycéraldéhyde 3 phosphate par la triose phosphate isomérase et va donc permettre la synthèse de deux autres ATP donc 2x2 = 4 ATP au final !

 

1 hour ago, CaPASSkrèm said:

Pour la réaction avec le pyruvate d’héshydrogénase (diapo 10-16):

• Est ce que cette réaction est juste avant le cycle de Krebs pour conditionner le pyruvate en acétyl coa ?

Oui tout à fait la pyruvate déshydrogénase va permettre la synthèse de : 

- CO2

- Acétyl CoA pour le cycle de Krebs

- NADH

1 hour ago, CaPASSkrèm said:

Pour ces deux diapos : https://ibb.co/445RhpW

• Je ne comprends pas du tout à quoi servent ces réactions car suite à l’action de la l’enzyme pyruvate deshydrogénase le pyruvate est déjà transformé en acétyl COA donc déjà conditionné pour le cycle de Krebs non ?

Alors oui c'est vrai pour la pyruvate deshydrogénase puis la dihydrolipoyl transacétylase qui vont être utile pour le cycle de krebs car elles permettent bien la synthèse d'acétyl CoA nécessaire au cycle de Krebs mais le cycle de Krebs a aussi besoin d'autres choses comme du FAD par exemple et c'est ceux à quoi sert dihydrolipoyl déshydrogénase, mais aussi vu qu'elle est couplée à E2 elle permet à E2 de fonctionner .

1 hour ago, CaPASSkrèm said:

Dernière petite question (promis) :

• La prof nous a dit qu’il y avait des réactions à ne pas apprendre du coup on doit vraiment pas les apprendre ou on doit qu’ a meme connaitre qui se transforme en quoi grace à telle enzyme ? Ou alors doit juste savoir qui se transforme en quoi sans détails ? Ou alors rien du tout on doit juste bine connaitre celles qu'elles nous a dit ?

 

Je pense qu'elle nous en fait cadeau ! Mais c'est mon point de vue personnel je n'ai pas encore vu les QCMs mais va  y faire un tour pour te faire une idée de ce qu'il faut apprendre

PS j'adore tes longues questions ça me permet de voir si j'ai bien compris en t'expliquant donc hésites pas ! @CaPASSkrèm

Edited October 26, 2021 by Dr_Zaius

[SoundCoA]

Salut ! @CaPASSkrèm

 

@Dr_Zaius a énormément répondu mais je reprends tout! 

Il y a 1 heure, CaPASSkrèm a dit :

Je ne comprends pas cette diapo (https://ibb.co/yN9Fnnc) :

• Je ne comprends pas à quel moment de la glycolyse cette réaction ce passe. Est ce qu’elle se passe à la fin de la glycolyse, après la formation du pyruvate ? Pourquoi créer du lactate et du NAD+ pour enlever le pyruvate alors que le but initial est d’avoir du pyruvate et du NADH non ?
• D’ailleurs à quoi sert le NADH et le FADH2 ? (J’ai pas fait spé SVT en terminale (pire erreur de ma vie mais passons) donc je suis un peu perdue avec tout ces trucs )

  Tout d'abord, cette diapo c'est pour montrer comme le dit @Dr_Zaius la glycolyse anaérobie, qui va se dérouler chez l'Homme lorsqu'il y aura un manque d'O2. Elle est présente dans le cours pour montrer comment on peut produire de l'ATP sans oxygène. 

L'équation est: Glucose + 2 Pi + 2 ADP --> 2 lactate + 2 ATP + 2 H2O avec passage de NADH + H+ à NAD+ attention ! 

Ensuite, les NADH et FADH2, vous le verrez servent lors de la chaîne respiratoire à produire le gradient de proton nécessaire au fonctionnement de l'ATP Synthase 

(tqt pas besoin d'avoir fait spé svt pour ça, nous on avait pas ça au programme au lycée et on s'en est sortis !)

 

Il y a 1 heure, CaPASSkrèm a dit :

 

Pour l’étape 3 de la glycolyse (https://ibb.co/NCXyCqj

• Je ne comprends pas pourquoi on multiplie par 2 la réaction

On multiplie par 2 cette réaction simplement parce qu'à l'étape de passage entre le fructose 1,6 diphosphate au glycéraldéhyde 3-phosphate, nous avons formation d' 1 dihydroxyacétone phosphate et d'1 glycéraldéhyde 3-phosphate mais la Triose phosphate isomérase tant à transformer en glycéraldéhyde 3-phosphate le dihydroxyacétone phosphate !! ainsi nous avons:  2 glycéraldéhyde 3-phosphate pour 1 fructose 1,6 diphosphate !!! Notez bien qu'on passe d'un C6 à 2 C3 ! Donc pour 1 glucose: on a 2fois cette deuxième partie de la glycolyse ! 

 

 

 

 

Il y a 1 heure, CaPASSkrèm a dit :

Pour la réaction avec le pyruvate d’héshydrogénase (diapo 10-16):

• Est ce que cette réaction est juste avant le cycle de Krebs pour conditionner le pyruvate en acétyl coa ?

C'est ça ! La décarboxylation oxydative du pyruvate = PU + NAD+ +HS-CoA --> AcétylCoA + CO2 + NADH

elle produit de l'acétyl-coa pour le cycle de Krebs et du NADH !

 

Il y a 1 heure, CaPASSkrèm a dit :

 

Pour ces deux diapos : https://ibb.co/445RhpW

• Je ne comprends pas du tout à quoi servent ces réactions car suite à l’action de la l’enzyme pyruvate deshydrogénase le pyruvate est déjà transformé en acétyl COA donc déjà conditionné pour le cycle de Krebs non ?

Non ! L'Acétyl-CoA se forme avec E2 (aka: Dihydrolipoyl transacétylase) mais les cycles de ses réactions ont toutes les 3 besoin les unes des autres pour exister via des co- réductions et oxydations ! Sans une des 3 réactions catalysées par 1 des 3 enzymes en couleurs (E1, E2 ou E3), la réaction n'a pas lieu !

 

Il y a 1 heure, CaPASSkrèm a dit :

 

 

Dernière petite question (promis) :

• La prof nous a dit qu’il y avait des réactions à ne pas apprendre du coup on doit vraiment pas les apprendre ou on doit qu’ a meme connaitre qui se transforme en quoi grace à telle enzyme ? Ou alors doit juste savoir qui se transforme en quoi sans détails ? Ou alors rien du tout on doit juste bine connaitre celles qu'elles nous a dit ?

 

Pour ça, écoute la prof à 100% ! Ce qui est sur c'est qu'il faut bien connaître les réactions où elle ne vous a pas dit de ne pas les apprendre ! Celles où elles vous a dit de ne pas les apprendre (c’est pas français mais t'as compris), d'après moi il faut quand même les connaître globalement ! Faites votre maximum !!

 

 

J'espère avoir été claire, n'hésite pas si non !!

 

Bon courage moussaillon !

Edited October 26, 2021 by SoundCoA

[Dr_Zaius]

6 minutes ago, SoundCoA said:

On multiplie par 2 cette réaction simplement parce qu'à l'étape de passage entre le fructose 1,6 diphosphate au glycéraldéhyde 3-phosphate, nous avons formation de 2 glycéraldéhyde 3-phosphate pour 1 fructose 1,6 diphosphate !!! Notez bien qu'on passe d'un C6 à 2 C3 ! Donc pour 1 glucose: on a 2fois cette deuxième partie de la glycolyse !

 

C'est juste mais tu as simplifié, je trouve et je me permet de te reprendre car la prof a bien insisté dessus donc bon dans le doute si jamais la question tombe au moins on sera calé !  le passage que tu évoque du fructose 1,6 diphosphate au glycéraldéhyde 3-phosphate, la prof a bien insisté sur le fait qu'on obtient 2 trioses phosphates différents à la fin on abouti au dihydroxyacétone phosphate  et au glycéraldéhyde 3 phosphate et c'est le glycéraldéhyde 3 phosphate qui va permettre 2 ATP puis la dihydroxyacétone phosphate va être transformé en glycéraldéhyde 3 phosphate  et  là il y a rebelotte d'où le x2

[SoundCoA]

il y a 13 minutes, Dr_Zaius a dit :

C'est juste mais tu as simplifié, je trouve et je me permet de te reprendre car la prof a bien insisté dessus donc bon dans le doute si jamais la question tombe au moins on sera calé !  le passage que tu évoque du fructose 1,6 diphosphate au glycéraldéhyde 3-phosphate, la prof a bien insisté sur le fait qu'on obtient 2 trioses phosphates différents à la fin on abouti au dihydroxyacétone phosphate  et au glycéraldéhyde 3 phosphate et c'est le glycéraldéhyde 3 phosphate qui va permettre 2 ATP puis la dihydroxyacétone phosphate va être transformé en glycéraldéhyde 3 phosphate  et  là il y a rebelotte d'où le x2

 

COMPLÈTEMENT OUI (c'est corrigé) !!!!! @CaPASSkrèm c'est clair pour toi ?

Edited October 26, 2021 by SoundCoA

[CaPASSkrèm]

WAWWWWW merci pour vos réponses super detaillées @Dr_Zaius et @SoundCoA !!!!!!!!! 

 

J'ai tout compris !!!!!!!!

[Dr_Zaius]

C'est toujours un plaisir de répondre à la biomol ! 

[une_PASSionnée]

@Dr_Zaius saluttt est ce que tu pourrais partager le drive ou t'as pris ton cours stppp 

[CaPASSkrèm]

Saluuut

 

Suite au cours de ce matin j’ai des nouvelles questions sur le métabolisme aka my BFF :

 

J’essaie de comprendre cette diapo (https://ibb.co/y4Ld5pN) mais je n’y arrive pas, je comprends pas trop le fonctionnement.

 

Je ne comprends pas non plus cette diapo : https://ibb.co/8zgNm3R

 

Et après, pour cette diapo : https://ibb.co/zm10tM6

• j’ai pas trop compris comment on faisait pour calculer le nb de mol d’ATP, est ce qu’on doit faire les même calculs que la prof à fait sur le diapo précédent (https://ibb.co/HP754jJ)  pour retrouver les valeurs (car d’après ce que j’ai compris on ne doit pas les apprendre par coeur) ?

 

Mercii encore une fois à la gentille personne qui prendra de son temps pour me répondre

[nemnémo-raux]

Coucou @CaPASSkrèm !!!

1) Pour ta première question, je te joins un post que je viens juste d'écrire : 

2) Pour ta seconde question, on se situe dans la matrice mitochondriale. Il faut lire la diapo de gauche à droite. Tout d'abord, la chaîne respiratoire produit des H+, relâchés dans la membrane mitochondriale. Il sont recaptés par l'ATP synthase (la diapo de ton petit 1)), et servent de carburant à ce complexe. Il va produire de l'ATP, qui va être relâché dans le cytosol, à travers l'échangeur ADP+Pi/ATP. Cet ATP va être utilisé par ta cellule, et recyclé ensuite en ADP+Pi. Ces deux produits sont inutiles, et doivent donc retourner dans la mitochondrie pour refabriquer de l'ATP. Ils vont cheminer à travers l'échangeur encore une fois, et servir de substrat à l'ATP synthase.

 

3) Pour finir, est -ce que la professeure vous a expliqué la dernière diapositive ? L'an dernier elle ne l'avait pas fait. En fait, ce qu'il faut retenir c'est le bilan de 32 ATP après dégradation du glucose. @Dr_sprat @Rom1@Jo_Bi_Deng@Mediane@SoundCoAest-ce que vous saurez expliquer cette diapo ? :

https://ibb.co/HP754jJ

 

[CaPASSkrèm]

Merciiii beaucoup @nemnemo-rreur 

 

Il y a 2 heures, nemnemo-rreur a dit :

3) Pour finir, est -ce que la professeure vous a expliqué la dernière diapositive ? L'an dernier elle ne l'avait pas fait. En fait, ce qu'il faut retenir c'est le bilan de 32 ATP après dégradation du glucose. @Dr_sprat @Rom1@Jo_Bi_Deng@Mediane@SoundCoAest-ce que vous saurez expliquer cette diapo ? :

https://ibb.co/HP754jJ

 

En fait pour cette diapo j'ai capté le fonctionnement mais je ne comprends pas celui de celle là (https://ibb.co/zm10tM6) parce que la prof a dit un truc du style pas besoins d'apprendre les valeurs (genre isocitrate fois 2 ca produit 5 ATP) car on peut les retrouver mais la question est comment on fait pour les retrouver

 

Ps : J'adore ta bio j'ai rigolé dessus pendant 5 min

[nemnémo-raux]

Je ne sais pas si ça répond à ta question :

Un NADH va produire 2,5 ATP

Un FAD va produire 1,5 ATP

Je pense que c'est comme ça qu'elle vous demande de les retrouver !

 

Et tant mieux si ma bio divertit ! 

[CaPASSkrèm]

il y a 57 minutes, nemnemo-rreur a dit :

Je ne sais pas si ça répond à ta question :

Un NADH va produire 2,5 ATP

Un FAD va produire 1,5 ATP

Je pense que c'est comme ça qu'elle vous demande de les retrouver !

 

Et tant mieux si ma bio divertit ! 

 

Okay merci beaucoup !!!!!!