PCR choix des amorces

[roomy]

Bonjour, 

 

je n'ai pas bien compris comment choisir les amorces sur cette photo et lesquelles sont vraies du coup? 

 

merci d'avance  

[Fabulo]

Helloo,

 

Alors pour savoir quelle amorce convient tu doit les essayer :

La première étape est d'écrire le brin correspondant de tes séquences (c'est ce qui a été fait en dessous)

Ensuite, tu dois essayer les amorces qu'on te donne:

 

Amorce a:

=> les deux amorces sont sur le même brin donc c'est pas bon

 

Amorce b:

=> même problème: les amorces sont sur le même brin

 

Amorce :

 

=> le problème ici c'est que l'amorce rouge n'est pas dans le bon sens: le 5' de l'amorce est au niveau du 5' du brin sauf que les brins doivent être anti-parallèles 

 

Amorce d:

=> youpi les deux amorces coïncident parfaitement avec, chacune, un brin différent !

 

J'espère que ça pourra t'éclairer et que t'as pu mieux comprendre le mécanisme !

 

[roomy]

@gorgonzoLASok parfait merci! je crois que j'ai bien compris, seulement je ne comprends pas juste un truc, les deux amorces doivent être anti parallèle ? il me semblait que la première devait être parallèle et la seconde anti parallèle, je ne sais pas si tu vois ce que je veux dire  

Edited October 2, 2021 by Romane27

[Fabulo]

Il faut bien que les deux amorces soient antiparallèles.

Comme dans l'ADN: l'ADN est composé de deux chaines antiparallèles alors pour les amorces c'est le cas aussi !

Donc si on résume: pour la PCR, les amorces doivent chacune se fixer sur un brin différent et les deux amorces doivent être antiparallèles comme dans la double hélice d'ADN.

C'est pour ça que dans le QCM, l'amorce c n'est pas bonne, l'une des deux ne respecte pas cette condition d'être antiparallèle 

Normalement avec ces informations, tu pourras à coup sûr répondre à ce type de QCM !