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Depurination ADN southern Blot


Go to solution Solved by Yas,

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Bonjour ,

Concernant le Southern Blot a quoi sert la dépurination de l'ADN ?

Il est écrit qu'elle sert à obtenir des fragments d'ADN de plus petite taille mais si le therme "dépurination" veut dire créer des (désoxy)nucleotides Apuriques ou Apyrimidiques je vois pas en quoi ça peut réduire la taille de l'ADN ?

A moi que ce soit deux choses différentes ?

Merci de votre aide !

  • Solution
Posted

Salut Antoined,

 

la dépurination au HCl n'est utilisée qu'avec des gros fragments d'ADN de plusieurs kb (contrairement à la dénaturation au NaOH qui est nécessaire pour séparer les doubles brins).

En fait comme tu l'as dit, la dépurination consiste à enlever les parties puriques et ne laisser que le squelette ose+phosphate. Les sites AP (apuriques) sont très instables, le clivage des liaisons phosphodiesters est donc favorisé au niveau de ces sites AP  et  l'ADN de départ sera donc fragmenté en petits brins.

 

PS : n'hésite pas à poser la question en TD ;)

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