annale purpan génome 2020

[reyerika]

Bonjour! je ne comprends pas ce genre de QCMs, j'ai regardé la correction détaillée et je n'arrive pas à comprendre comment ils ont fait... Si quelqu'un pouvait m'expliquer  Merci beaucoup!!!!

Les réponses vraies sont ABD

 

 

 

 

 

 

[SApaces]

Saluuut ! 

 

Alors tout d'abord il me semble que vous n'avez pas vu les plasmides et les enzymes de restrictions. Je vais quand même essayé de t'expliquer ce QCM mais je ne sais pas si c'est dans votre programme. Si vous avez pas vu de QCM de ce style en TD, je ne pense pas que ce soit au programme.

Si ce n'est pas au programme, je veux pas t'embrouiller 

 

Les enzymes de restriction correspondent à des endonucléases qui coupent en reconnaissant des séquences semi-palindromiques. Les sites de restriction sont rares donc dans un fragment du génome, l'enzyme coupe à un seul endroit (il y a peu de probabilités qu'on trouve 2 fois le même site).

Le but est de couper les fragments issues de la PCR et le plasmide par les mêmes enzymes de restrictions qui reconnaissant les mêmes sites de restriction (donc mêmes séquences) afin d'insérer le fragment de PCR dans le plasmide. Le plasmide permettre de cloner le fragment. 

 

On retrouve alors 2 cas : 

- on coupe par une seule enzyme de restriction, le fragment d'ADN peut s'insérer dans les 2 sens --> le clonage n'est pas orienté

- on coupe avec deux enzyme de restriction, le fragment s'insère toujours dans le même sens --> le clonage est orienté

 

Il faut faire attention à l'emplacement des sites de restriction dans le plasmide afin que le fragment d'ADN qu'on veut insérer se mette dans le bon sens.

 

Les extrémités des sites de restriction peuvent être compatibles pour différentes enzymes, c'est à dire qu'après la coupure, on obtient une séquence identique pour les 2 enzymes comme AccI et TaqI ici.  

 

Du coup,

pour l'item A, on voit que AccI est avant EcoRI sur le fragment mais c'est l'inverse sur le plasmide, le côté 3' (EcoRI) du fragment va se lier côté 5' du plasmide. 

pour l'item B, on voit qu'il n'y a pas de site TaqI sur le fragment d'ADN mais TaqI a une extrémité compatible avec AccI (en jaune sur le schéma). On peut donc utiliser ce couple d'amorce. 

pour l'item C, KpnI n'est pas sur le fragment et est compatible avec aucun des sites de restriction présent.

 

Je t'ai fait le raisonnement sur 3 items mais j'ai peut être fait quelques erreurs. Ce sont des QCM plutôt difficiles, surtout si vous ne les avez pas traités en TD.

 

Voilà, cela ne te servira peut être pas mais tu peux toujours lire dans le doute ! après je te conseille de ne pas trop t'attarder dessus et de plutôt bien maitriser les autres types de QCM..

 

Courage

[reyerika]

Il y a 2 heures, SApaces a dit :

Saluuut ! 

 

Alors tout d'abord il me semble que vous n'avez pas vu les plasmides et les enzymes de restrictions. Je vais quand même essayé de t'expliquer ce QCM mais je ne sais pas si c'est dans votre programme. Si vous avez pas vu de QCM de ce style en TD, je ne pense pas que ce soit au programme.

Si ce n'est pas au programme, je veux pas t'embrouiller 

 

Les enzymes de restriction correspondent à des endonucléases qui coupent en reconnaissant des séquences semi-palindromiques. Les sites de restriction sont rares donc dans un fragment du génome, l'enzyme coupe à un seul endroit (il y a peu de probabilités qu'on trouve 2 fois le même site).

Le but est de couper les fragments issues de la PCR et le plasmide par les mêmes enzymes de restrictions qui reconnaissant les mêmes sites de restriction (donc mêmes séquences) afin d'insérer le fragment de PCR dans le plasmide. Le plasmide permettre de cloner le fragment. 

 

On retrouve alors 2 cas : 

- on coupe par une seule enzyme de restriction, le fragment d'ADN peut s'insérer dans les 2 sens --> le clonage n'est pas orienté

- on coupe avec deux enzyme de restriction, le fragment s'insère toujours dans le même sens --> le clonage est orienté

 

Il faut faire attention à l'emplacement des sites de restriction dans le plasmide afin que le fragment d'ADN qu'on veut insérer se mette dans le bon sens.

 

Les extrémités des sites de restriction peuvent être compatibles pour différentes enzymes, c'est à dire qu'après la coupure, on obtient une séquence identique pour les 2 enzymes comme AccI et TaqI ici.  

 

Du coup,

pour l'item A, on voit que AccI est avant EcoRI sur le fragment mais c'est l'inverse sur le plasmide, le côté 3' (EcoRI) du fragment va se lier côté 5' du plasmide. 

pour l'item B, on voit qu'il n'y a pas de site TaqI sur le fragment d'ADN mais TaqI a une extrémité compatible avec AccI (en jaune sur le schéma). On peut donc utiliser ce couple d'amorce. 

pour l'item C, KpnI n'est pas sur le fragment et est compatible avec aucun des sites de restriction présent.

 

Je t'ai fait le raisonnement sur 3 items mais j'ai peut être fait quelques erreurs. Ce sont des QCM plutôt difficiles, surtout si vous ne les avez pas traités en TD.

 

Voilà, cela ne te servira peut être pas mais tu peux toujours lire dans le doute ! après je te conseille de ne pas trop t'attarder dessus et de plutôt bien maitriser les autres types de QCM..

 

Courage

Merci beaucoup c'est super gentil d'avoir répondu, il a été classé au programme dans les annales paces actualisées, mais je me disais bien aussi qu'on avait pas vu ça ^^