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PHi peptide


Go to solution Solved by GaspardBdls,

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Slt de nouveau, 

 

Pour ce fameux peptide MEHQK, Met-Glu-His-Gln-Lys, comment est ce que je calcule son PHi?

 

De ce que j'ai compris, je prends en compte dans ce peptide, les AA à radical ionisable; ici Lys, Glu et His.

Je note les PKr de ces derniers qui sont, dans l'ordre précédent:

10.53 - 4.25 - 6 

Ensuite, il ne faut pas oublier l'acide carboxylique pour la Lys et l'amine en N-term pour la Met, donc on note aussi:

2.18 pour le pkA de Lys et 9.20 pour le pkB de Met

 

On fait ensuite notre échelle graduée de 3 à -2, car nous avons 3 charges basiques et 2 charges acides en mettant nos pkA, pkB et pkR par ordre croissant ;

 

3 ->2.18 ->2 -> 4.25-> 1-> 6-> 0 -> 9.2 ->-1 -> 10.53 -> -2

 

On fait la moyenne des pk aux abords du 0; (6+9.2)/2 = 7.6 de PHi 

 

Est ce que c'est le bon raisonnement ?? Si oui, y'a pas moyen de faire plus court ? 

 

Merci.

  • Solution
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Hello ! 

 

Oui le raisonnement est bon, tu as pleeeeeeeeein de topics traitant ce sujet, je t'invite à y jeter un coup d'oeil, tu trouvera ton bonheur et peut être une technique plus rapide ! Sinon tu peux aussi tenter la partie pédagogique (avec les moyens mnémotechniques etc) 

 

Bonne journée et bon courage.

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