Calcul pHi

[Audrey-DA]

Bonjour !

Pouvez m'expliquer comment on calcule le pHi des AA ?
 Si j'ai bien compris, on fait la moyenne des pK des deux AA qui encadrent le zwiterrion mais comment calcule-t-on ces pK ?
On fait la somme des charges + et - de l' AA ?

Merci d'avance !

 

[Guest Jeffrey]

Bonjour,
 

 
Voilà la méthode pour calculer le pHi d'un AA :
 
Tu peux déjà te rassurer, toutes les valeurs de pK des différentes fonctions ionisables que l'on peut retrouver au sein des AA ne sont pas à connaître. C'est l'énoncé qui te fournira ces valeurs :

• - α-aminé : 9,3
• - Guanidium : 12,5
• - α-carboxylique : 2,1
• - β-carboxylique : 4,0
• - γ-carboxylique : 4,0
• - ε-aminé : 10,5

 

Méthode :

 

On te donne un AA. On te demande de calculer son pHi.
 

1. Tu écris les fonctions ionisables de ton AA ainsi que leur valeur de pK :

 

- α-aminé : 9,3 

- α-carboxylique : 2,1 

- +/- autres fonctions ionisables : ...

 

2. Tu dessines une droite des pH qui va de 0 à 14 et tu places sur cette droite les différentes fonctions dans l'ordre croissant de leur pK.

3. Pour chaque segment de droite, tu vas écrire les charges +, 0 ou - que tu as pour chaque fonction, et par somme tu écris la charge globale de l'AA. Chaque fois que le pH dépasse le pK d'une fonction, elle perd une charge positive.

4. Tu regardes le segment où la charge globale est 0. Ca te permet d'identifier les pK qui encadrent la forme zwitterionique de l'AA.

5. Tu calcules ton pHi en faisant la moyenne des 2 pK concernés.

 

 

Application :

 

On te donne l'acide glutamique (Glu, E). On te demande de calculer son pHi.
 

1. Tu écris les fonctions ionisables de ton AA ainsi que leur valeur de pK :

 

- α-aminé : 9,3 

- α-carboxylique : 2,1 

- γ-carboxylique : 4,0

 

2. Tu dessines une droite des pH qui va de 0 à 14 et tu places sur cette droite les différentes fonctions dans l'ordre croissant de leur pK.

3. Pour chaque segment de droite, tu vas écrire les charges +, 0 ou - que tu as en tenant compte de chaque fonction, et effectivement, par somme tu écris la charge globale de l'AA. Chaque fois que le pH dépasse le pK d'une fonction, elle perd une charge positive.

 

 

4. Tu regardes le segment où la charge globale est 0. Ça te permet d'identifier les pK qui encadrent la forme zwitterionique de l'AA.

 

 

5. Tu calcules ton pHi en faisant la moyenne des 2 pK concernés : ici pHi = (2,1 + 4) / 2 = 3,05.

 

 

En pratique :

 

L'avantage de cette méthode, c'est qu'elle te sert à déterminer le pHi de peptide (avec plusieurs AA). Maintenant, pour faire simple :

• pHi d'une AA dicarboxylique : moyenne des 2 pK les plus petits
• pHi d'un AA basique : moyenne des 2 pK les plus grands
• pHi d'un AA sans autre groupement ionisable que les 2 fonctions principales : moyenne des pK de l'alpha-aminé et de l'alpha-carboxylique.

 

J'espère que je t'ai pas embrouillée, si tu t'entraînes à appliquer ces méthodes tu verras vite que c'est assez simple !

[PaulHenri]

Merci beaucoup pour cette réponse claire et super bien rédigée ! 

[Audrey-DA]

D'accord je m'entrainerai !
Merci mille fois pour cette très bonne explication:)